lncRNA

Duge nekodirajuće RNA (lncRNA) su RNA duže od 200 nukleotida s niskim potencijalom kodiranja, ali s kritičnim regulatornim funkcijama. BMKCloud LNCRNA cjevovod dizajniran je za analizu biblioteka iscrpljenih rRNA s visokokvalitetnim, dobro napomena referentnim genomu, analizom ekspresije LNCRNA i mRNA zajedno. Nakon čitanja obrezivanja i kontrole kvalitete, čitanja su usklađena s referentnim genomu za sastavljanje transkripata, a naknadna analiza strukture gena otkriva alternativno spajanje i nove gene. Transkripti su identificirani kao mRNA ili lncRNA, a analiza diferencijalne ekspresije identificira različito eksprimirane lncRNA, njihove ciljeve i različito eksprimirane gene (DEG). I DEG -ovi i različito eksprimirani ciljevi LNCRNA funkcionalno su označeni kako bi se pronašli obogaćene funkcionalne kategorije.