Exclusive Agency for Korea

条形banner-03

Proizvodi

Sekvenciranje cijelog egzoma čovjeka

Sekvenciranje cijelog ljudskog egzoma (hWES) široko je priznato kao isplativ i moćan pristup sekvencioniranju za precizno određivanje mutacija koje uzrokuju bolest. Unatoč tome što čine samo oko 1,7% cjelokupnog genoma, egzoni igraju ključnu ulogu jer izravno odražavaju profil ukupnih funkcija proteina. Značajno je da se u ljudskom genomu više od 85% mutacija povezanih s bolestima manifestira unutar područja kodiranja proteina. BMKGENE nudi sveobuhvatnu i fleksibilnu uslugu sekvenciranja cijelog ljudskog egzoma s dvije različite strategije hvatanja eksona koje su dostupne za postizanje različitih istraživačkih ciljeva.


Pojedinosti usluge

Demo rezultati

Značajke usluge

● Dostupna su dva panela egzoma na temelju ciljanog obogaćivanja sondama: Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) i xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).

● Sekvenciranje na Illumina NovaSeq.

● Bioinformatički cjevovod usmjeren prema analizi bolesti ili analizi tumora.

Prednosti usluge

Ciljano područje kodiranja proteina: Hvatanjem i sekvenciranjem regija kodiranja proteina, hWES se koristi za otkrivanje varijanti povezanih sa strukturom proteina.

Isplativo:hWES daje približno 85% mutacija povezanih s ljudskim bolestima iz 1% ljudskog genoma.

Visoka točnost: Uz veliku dubinu sekvenciranja, hWES olakšava detekciju uobičajenih varijanti i rijetkih varijanti s frekvencijama nižim od 1%.

Rigorozna kontrola kvalitete: Implementiramo pet ključnih kontrolnih točaka u svim fazama, od pripreme uzorka i biblioteke do sekvenciranja i bioinformatike. Ovaj pedantan nadzor osigurava isporuku dosljedno visokokvalitetnih rezultata.

Sveobuhvatna bioinformatička analiza: naš program ide dalje od identificiranja varijacija referentnog genoma, budući da uključuje naprednu analizu osmišljenu za specifično rješavanje istraživačkih pitanja koja se odnose na genetske aspekte bolesti ili analizu tumora.

Podrška nakon prodaje:Naša predanost proteže se i nakon završetka projekta s 3-mjesečnim servisnim razdobljem nakon prodaje. Tijekom tog vremena nudimo praćenje projekta, pomoć u rješavanju problema i sesije s pitanjima i odgovorima kako bismo odgovorili na sva pitanja povezana s rezultatima.

Uzorak specifikacija

Strategija hvatanja egzona

Strategija sekvenciranja

Preporučeni izlaz podataka

Sure Select Human All Exon v6 (Agilent)

ili xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT)

 

Illumina NovaSeq PE150

5 -10 Gb

Za mendelske poremećaje/rijetke bolesti: > 50x

Za uzorke tumora: ≥ 100x

Zahtjevi za uzorke

Vrsta uzorka

 

 Iznositi(Qubit®)

 

Koncentracija 

Volumen

 

 

 Čistoća (NanoDrop™)

 

Genomska DNK

 

≥ 50 ng
≥ 6 ng/μL
≥ 15 μL
 
OD260/280=1,8-2,0
 
nema degradacije, nema kontaminacije

 

Bioinformatika

WES_BI tijek rada_bolest-01

Bioinformatska analiza uzoraka hWES-bolesti uključuje:

● QC podataka sekvenciranja

● Usklađivanje referentnog genoma

● Identifikacija SNP-ova i InDela

● Funkcionalna anotacija SNP-ova i InDel-ova

WES_BI tijek rada_Tumor-01

Bioinformatska analiza uzoraka tumora uključuje:

● QC podataka sekvenciranja

● Usklađivanje referentnog genoma

● Identifikacija SNP-ova, InDela i somatskih varijacija

● Identifikacija varijanti zametne linije

● Analiza potpisa mutacije

● Identifikacija pogonskih gena na temelju mutacija za dobivanje funkcije

● Napomena o mutaciji na razini osjetljivosti na lijekove

● Analiza heterogenosti – izračun čistoće i ploidnosti

Tijek rada usluge

dostava uzorka

Dostava uzoraka

Pilot eksperiment

ekstrakcija DNK

Priprema knjižnice

Izgradnja knjižnice

Sekvenciranje

Sekvenciranje

Analiza podataka

Analiza podataka

数据上传-01

Dostava podataka

Usluge nakon prodaje

Usluge nakon prodaje


  • Prethodna:
  • Sljedeći:

  • Data QC – Statistika snimanja Exomea

     

    wps_doc_22

     

    Identifikacija varijanti – InDels

    图片36

    Napredna analiza: identifikacija i distribucija štetnih SNP-ova/InDela – Circosov zaplet

     

    图片37

    Analiza tumora: identifikacija i distribucija somatskih mutacija – Circos dijagram

     

    图片38

     

    Analiza tumora: klonske loze

     

    图片39

     

    dobiti ponudu

    Ovdje napišite svoju poruku i pošaljite nam je

    Pošaljite nam svoju poruku: