Exclusive Agency for Korea

条形 Banner-03

Proizvodi

Analiza udruživanja na cijelom genomu

Cilj studija udruživanja u cijelom genomu (GWAS) je identificirati genetske varijante (genotipovi) povezane sa specifičnim osobinama (fenotipi). Proučavajući genetske markere u čitavom genomu u velikom broju pojedinaca, GWAS ekstrapolira asocijacije genotipa-fenotipa kroz statističke analize na razini populacije. Ova metodologija pronalazi opsežne primjene u istraživanju ljudskih bolesti i istraživanju funkcionalnih gena povezanih sa složenim osobinama u životinjama ili biljkama.

U BMKGENE-u nudimo dvije avenije za provođenje GWAS-a na velikoj populaciji: upotrebu sekvenciranja cijelog genoma (WGS) ili se odlučuju za smanjenu metodu sekvenciranja genoma, informiranom inpliciranom fragmentu s specifičnim lokusom (SLAF). Iako WGS odgovara manjim genomima, SLAF se pojavljuje kao ekonomična alternativa za proučavanje veće populacije s dužim genomima, učinkovito minimizirajući troškove sekvenciranja, istovremeno jamčeći visoku učinkovitost otkrivanja genetskih markera.


Pojedinosti o usluzi

Bioinformatika

Demo rezultat

Izdvojene publikacije

Tijek rada

图片 13

Prednosti usluge

Opsežna zapisa o stručnosti i publikacijama: S akumuliranim iskustvom u GWAS -u, BMKGENE je završio stotine vrsta projekata vrsta u istraživanju stanovništva GWAS -a, pomagao je istraživačima da objave više od 100 članaka, a kumulativni faktor utjecaja dosegao je 500.

● Sveobuhvatna analiza bioinformatike: Radni tijek uključuje analizu SNP-Trait Association, pružanje skupa kandidatskih gena i njihove odgovarajuće funkcionalne napomene.

Visoko kvalificirani tim bioinformatike i kratki ciklus analize: S velikim iskustvom u naprednoj analizi genomike, BMKGENE -ov tim pruža sveobuhvatne analize s brzim vremenom preokreta.

Podrška nakon prodaje:Naša predanost proteže se izvan završetka projekta s 3-mjesečnom razdoblju nakon prodaje. Za to vrijeme nudimo praćenje projekta, pomoć u rješavanju problema i Q&A sjednice za rješavanje bilo kakvih upita vezanih za rezultate.

Specifikacije i zahtjevi usluge

Vrsta sekvenciranja

Preporučena ljestvica stanovništva

Strategija sekvenciranja

Potrebe nukleotida

Sekvenciranje cijelog genoma

200 uzoraka

10x

Koncentracija: ≥ 1 ng/ µl

Ukupni iznos 4NG

Ograničena ili nikakva degradacija ili onečišćenje

Specifično-lokus pojačan fragment (SLAF)

Oznaka dubina: 10x

Broj oznaka:

<400 MB: preporučuje se WGS

<1GB: 100K oznake

1 GB

> 2GB: 300k oznake

Max 500k oznake

Koncentracija ≥ 5 ng/µl

Ukupni iznos ≥ 80 ng

Nanodrop OD260/280 = 1,6-2,5

Agarozni gel: Nema ili ograničene degradacije ili onečišćenja

 

Odabir materijala

动物 1
动物 2
slika7

Različite sorte, podvrsta, Landraces/Genebanks/Mješovite obitelji/divlji resursi

Različite sorte, podvrsta, Landraces

Obitelj pola-sib/obiteljski/divlji resursi

Servisni rad protoka

Uzorak QC

Eksperiment dizajn

Dostava uzorka

Dostava uzorka

Pilot eksperiment

Vađenje RNA

Priprema knjižnice

Konstrukcija knjižnice

Sekvenciranje

Sekvenciranje

Analiza podataka

Analiza podataka

Nakon prodajnih usluga

Usluge nakon prodaje


  • Prethodno:
  • Sljedeći:

  • 图片 119

    Uključuje sljedeću analizu:

    • Analiza udruživanja na cijelom genomu: LM, LMM, Emmax, FastLMM model
    • Funkcionalna napomena gena kandidata

    Analiza udruge SNP-Trait-Manhattan Plot

     

    图片 14

     

    Analiza udruživanja SNP-Trait-QQ Plot

     

    图片 15

     

     

    Istražite napredak koje je BMKGENE -ove usluge DE GWAS kroz kuriranu zbirku publikacija:

    LV, L. i sur. (2023.) 'Uvid u genetsku osnovu tolerancije amonijaka u školjci britvice sinonovacula constricta studijom udruživanja u cijelom genomu',Akvakultura, 569, str. 739351. Doi: 10.1016/j.aquaculture.2023.739351.

    Li, X. i sur. (2022) 'Analize multi-Omics 398 pristupa prosoje od foxtail-a otkrivaju genomske regije povezane s pripitomljavanjem, osobinama metabolita i protuupalnim učincima',Molekularna biljka, 15 (8), str. 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.

    Li, J. i sur. (2022.) 'Mapiranje asocijacije u vezi s trupom jedva fenotipova u okruženju suše',Frontiers u biljnoj znanosti, 13, str. 924892. Doi: 10.3389/fpls.2022.924892/Bibtex.

    Zhao, X. i sur. (2021) 'GMST1, koji kodira sulfotransferazu, daje otpornost na soje soje mozaika virusa G2 i G3',Biljka, ćelija i okoliš, 44 (8), str. 2777–2792. doi: 10.1111/pce.14066.

    Nabavite citat

    Napišite svoju poruku ovdje i pošaljite nam je

    Pošaljite nam svoju poruku: