Eukariotska analiza mRNA (dostupne su referentne i de novo opcije)
Ovaj cjevovod koristi podatke NGS RNA-seq kao ulaz i daje rezultate iz višestrukih analiza nizvodno, uključujući, ali ne ograničavajući se na: sekvenciranje procjene kvalitete podataka,de novoNapomena na transkripciju, analiza varijabilnog spajanja, analiza diferencijalne ekspresije, napomenu funkcije i analiza obogaćivanja.
Duga nekodirajuća RNA analiza
Duge nekodirajuće RNA (lncRNA) su nekodirajući transkripti duljine duljine od 200 NT i za koje se zna da igraju ulogu u organizaciji i regulaciji kromatina. Tehnologije sekvenciranja visoke propusnosti i bioinformatičke osnažili su naše razumijevanje LNCRNA sekvence i informacije o pozicioniranju kako bismo identificirali lncRNA s ključnim regulatornim funkcijama. Ovaj cjevovod pruža analizu lncRNA uz analize spomenute u cjevovodu eukariotske mRNA analize.
16S/18S/Njegov amplikon sekvenciranje
Amplikonski cjevovod za analizu mikrobne raznolikosti sekvencira razvijen je na temelju dugogodišnjeg iskustva u analizi projekta mikrobne raznolikosti. Cijena sadrži standardiziranu osnovnu analizu koja pokriva glavni sadržaj analize trenutnih mikrobnih istraživanja i personalizirane analize. Izvještaj o analizi je bogato i sveobuhvatno, s mogućnošću provođenja raznolike osobne analize. Uz to, uzorci i grupe mogu se izmijeniti u letu radi dodatne prilagodbe i kontrole.
Analiza metagenomike sačmarice
Cijena metagenomske analize sačmarice koristi NGS podatke iz miješanih genomskih materijala izvađenih iz uzoraka okoliša. Uključene analize pružaju detaljne informacije o raznolikosti i obilju vrsta, strukturi populacije, filogenetskim odnosima, funkcionalnim genima i korelacijskim mrežama s okolišnim čimbenicima.
Analiza varijante NGS-WGS
Analiza varijante NGS-WGS integrirani je cjevovod za otkrivanje varijante koji obavlja kontrolu kvalitete podataka, usklađivanje sekvenci, napomenu i analizu mutacije gena. Cijena slijedi najbolje prakse GATK -a za otkrivanje SNP -a i Indel i koristi Manta za strukturno pozivanje varijante.
Studija asocijacije širokog genoma (GWAS)
GWAS cjevovod je analiza nizvodno koja uzima prethodno generirane VCF datoteke i odgovarajuće podatke fenotipa za skupinu pojedinaca kao ulaz. Koristeći specifične statističke metodologije, GWAS ima za cilj otkriti nukleotidne varijacije u korelaciji s fenotipskim razlikama. Igra ključnu ulogu u istraživanju funkcionalnih gena povezanih sa složenim ljudskim bolestima i zamršenim osobinama u biljkama i životinjama.
Analiza segregacije skupne segregacije (BSA)
BSA analiza uključuje objedinjavanje pojedinaca s ekstremnim fenotipskim osobinama iz segregacijskog stanovništva. Usporedbom diferencijalnih lokusa između združenih uzoraka, ovaj pristup brzo identificira usko povezane molekularne markere povezane s ciljnim genima. Široko se koristi u genetskom mapiranju biljaka i životinja, to je vrijedan alat za uzgoj uz pomoć markera.
Evolucijska genetička analiza
Evolucijska genetička analiza radnog tijeka koristi opsežno iskustvo BMKGENE -a u projektima genetske evolucije i uključuje filogenetsku konstrukciju stabala, analizu nejednakosti povezivanja, procjenu genetske raznolikosti, selektivnu identifikaciju pomicanja, analizu srodstva, analizu glavnih komponenti i karakterizaciju populacijske strukture.
