DNBSEQ unaprijed izrađene knjižnice
Značajke
●Platforma:Mgi-dnbseq-t7
●Načini sekvenciranja:PE150
●Prijenos Illumina knjižnica naMGI:Omogućavanje sekvenciranja visokih količina podataka uz niske cijene.
●Kontrola kvalitete knjižnica prije sekvenciranja.
●Sekvenciranje podataka QC i isporuka:Dostava QC izvješća i sirove podatke u FASTQ formatu nakon demultipleksiranja i filtriranja Q30 čitanja.
Prednosti
●Svestranost usluga sekvenciranja:Kupac može odlučiti slijediti trakom ili količinom podataka.
●Visoki izlaz podataka:1500 GB/traka
●Dostava sekvenciranja QC izvješća:s mjernim podacima, točnošću podataka i ukupnim performansama projekta sekvenciranja.
●Proces zrelog sekvenciranja:s kratkim vremenom zaokreta.
●Rigorozna kontrola kvalitete: Provodimo stroge QC zahtjeve kako bismo zajamčili davanje dosljedno visokokvalitetnih rezultata.
Zahtjevi za uzorkovanje
| Iznos podataka (x) | Koncentracija (qPCR/nm) | Volumen | |
| Djelomična traka
| X ≤ 10 GB | ≥ 1nm | ≥ 25 μl |
| 10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X> 100 GB | ≥ 4 nm | ||
| Jednostruka traka | Po traci | ≥ 1,5 nm / bibliotečki bazen | ≥ 25 μl / knjižnični bazen |
Pored koncentracije i ukupne količine, potreban je i prikladan vršni uzorak.
NAPOMENA: Traka sekvenciranja knjižnica niske raznolikosti zahtijeva Phix Spike-in kako bi osigurao robusno pozivanje na osnovu.
Preporučujemo slanje predkooliranih knjižnica kao uzoraka. Ako vam je potreban BMKGENE za obavljanje objedinjavanja knjižnice, pogledajte
Zahtjevi za biblioteku za sekvenciranje djelomičnog traka.
Veličina knjižnice (vršna karta)
Glavni vrh trebao bi biti unutar 300-450 bp.
Knjižnice bi trebale imati jedan glavni vrh, bez onečišćenja adaptera i bez dimera temeljnih premaza.
Servisni tijek rada
Izvještaj knjižnice QC
Izvještaj o kvaliteti knjižnice navedeno je prije sekvenciranja, procjene količine knjižnice i fragmentacije.
Sekvenciranje QC izvješća
Tablica 1. Statistika o sekvenciranju podataka.
| ID uzorka | Bmkid | Raw čita | Sirovi podaci (BP) | Očistite čitanja (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Slika 1. raspodjela kvalitete duž očitavanja u svakom uzorku
Slika 2. distribucija sadržaja baze
Slika 3. Raspodjela sadržaja čitanja u podacima o sekvenciranju
