Illumina unaprijed napravljene knjižnice
Značajke
●Platforme:Illumina Novaseq 6000 i Novaseq X Plus
●Načini sekvenciranja:PE150 i PE250
●Kontrola kvalitete knjižnica prije sekvenciranja
●Sekvenciranje podataka QC i isporuka:Dostava QC izvješća i sirove podatke u FASTQ formatu nakon demultipleksiranja i filtriranja Q30 čitanja
Prednosti usluge
●Svestranost usluga sekvenciranja:Kupac može odabrati slijed prema traci, protočnoj ćeliji ili potrebnim količinama podataka (djelomični sekvenciranje trake).
●Opsežno iskustvo na Illumina platformi za sekvenciranje:s tisućama zatvorenih projekata s raznim vrstama.
●Dostava sekvenciranja QC izvješća:s mjernim podacima, točnošću podataka i ukupnim performansama projekta sekvenciranja.
●Proces zrelog sekvenciranja:s kratkim vremenom zaokreta.
●Rigorozna kontrola kvalitete: Provodimo stroge QC zahtjeve kako bismo zajamčili davanje dosljedno visokokvalitetnih rezultata.
Uzorke platforme
| Platforma | Ćelija protoka | Način sekvenciranja | Jedinica | Procijenjeni izlaz |
| Novaseq x | 10b (8 traka) | PE150 | Jednostruka traka Djelomična traka | 375 GB / traka |
| 25b (8 traka) | PE150 | Jednostruka traka Djelomična traka | 1000 GB/traka | |
| Novaseq 6000 | SP protočna ćelija (2 trake) | PE250 | Ćelija protoka Jednostruka traka Djelomična traka | 325-400 m čitanja / traka |
| S4 protočna ćelija (4 trake) | PE150 | Ćelija protoka Jednostruka traka Djelomična traka | ~ 800 GB / traka |
Zahtjevi za uzorkovanje
| Iznos podataka (x) | Koncentracija (qPCR/nm) | Volumen | |
| Sekvenciranje djelomične trake
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
| 10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X> 100 GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
| Slijed trake | Po traci | ≥ 1,5 nm / bibliotečki bazen | ≥ 25 μl / knjižnični bazen |
Pored koncentracije i ukupne količine, potreban je i prikladan vršni uzorak.
NAPOMENA: Traka sekvenciranja knjižnica niske raznolikosti zahtijeva Phix Spike-in kako bi osigurao robusno pozivanje na osnovu.
Preporučujemo slanje predkooliranih knjižnica kao uzoraka. Ako vam je potreban BMKGENE za obavljanje objedinjavanja knjižnice, obratite se
Zahtjevi za biblioteku za sekvenciranje djelomičnog traka.
Veličina knjižnice (vršna karta)
Glavni vrh trebao bi biti unutar 300-450 bp.
Knjižnice bi trebale imati jedan glavni vrh, bez onečišćenja adaptera i bez dimera temeljnih premaza.
Molimo kontaktirajte nas ako vaši uzorci ne ispunjavaju zahtjeve za početne materijale.
Servisni tijek rada
Kontrola kvalitete knjižnice
Sekvenciranje
Kontrola kvalitete podataka
Dostava projekta
Izvještaj knjižnice QC
Izvještaj o kvaliteti knjižnice navedeno je prije sekvenciranja, procjene količine knjižnice i fragmentacije.
Sekvenciranje QC izvješća
Tablica 1. Statistika o sekvenciranju podataka.
| ID uzorka | Bmkid | Raw čita | Sirovi podaci (BP) | Očistite čitanja (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Slika 1. raspodjela kvalitete duž očitavanja u svakom uzorku
Slika 2. distribucija sadržaja baze
Slika 3. Raspodjela sadržaja čitanja u podacima o sekvenciranju
