● Iscrpljivanje rRNA praćeno pripremom biblioteke usmjerenih, omogućavajući podatke o sekvenciranju specifičnih za pramenovanje.
● Bioinformatički tijek rada omogućuje predviđanje i kvantifikacija ekspresije
●Sveobuhvatnije RNA knjižnice:Koristimo iscrpljivanje rRNA umjesto linearnog iscrpljivanja RNA u našoj pripremi prije librara, osiguravajući da podaci o sekvenciranju uključuju ne samo circRNA, već i mRNA i lncRNA, omogućujući zajedničku analizu ovih skupova podataka
●Neobvezna analiza konkurentnih endogenih RNA (CERNA) mreža: Pružanje dubljeg uvida u stanične regulatorne mehanizme
●Opsežna stručnost: S zapisom o obradi preko 20 000 uzoraka na BMKGENE -u, obuhvaćajući različite vrste uzoraka i projekte LNCRNA, naš tim donosi bogatstvo iskustva svakom projektu.
●Rigorozna kontrola kvalitete: Provodimo temeljne kontrolne točke u svim fazama, od uzoraka i pripreme knjižnice do sekvenciranja i bioinformatike. Ovo pažljivo praćenje osigurava davanje dosljedno visokokvalitetnih rezultata.
● Podrška nakon prodaje: Naša predanost proteže se izvan završetka projekta s 3-mjesečnom razdoblju nakon prodaje. Za to vrijeme nudimo praćenje projekta, pomoć u rješavanju problema i Q&A sjednice za rješavanje bilo kakvih upita vezanih za rezultate.
Knjižnica | Platforma | Preporučeni podaci | Qc |
rRNA iscrpljena biblioteka usmjerene | Illumina PE150 | 16-20 GB | Q30≥85% |
Conc. (Ng/μl) | Količina (μg) | Čistoća | Integritet |
≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Ograničena ili bez kontaminacije proteina ili DNA prikazana na gelu. | Rin≥6.0; 5,0≥28S/18S≥1,0; Ograničeno ili nema osnovne visine |
● Biljke:
Korijen, stabljika ili latica: 450 mg
List ili sjeme: 300 mg
Voće: 1,2 g
● životinja:
Srce ili crijevo: 450 mg
Viscera ili mozak: 240 mg
Mišić: 600 mg
Kosti, kosa ili koža: 1,5 g
● Arthropods:
Insekti: 9G
Crustacea: 450 mg
● Cijela krv:2 cijevi
● Stanice: 106 stanice
● Serum i plazma: 6 ml
Kontejner: 2 ml cijev za centrifugu (limena folija se ne preporučuje)
Oznaka uzoraka: grupa+replicirati npr. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pošiljka:
1. Suhi led: Uzorci se moraju spakirati u vrećice i zakopani u suhi led.
2. RNASTable Epruvete: Uzorci RNA mogu se sušiti u cijevi za stabilizaciju RNA (npr. RNAstable®) i isporučuju se na sobnoj temperaturi.
Bioinformatika
predviđanje circRNA: kromosomska raspodjela
Diferencijalno izraženi circRNA - zaplet vulkana
Diferencijalno izraženi circRNA - hijerarhijsko grupiranje
Funkcionalno obogaćivanje gena domaćina CircRNA
Istražite napredak u istraživanju koje je omogućilo BMKGENE 'CIRCRNA sekvencijske usluge putem kurirane zbirke publikacija.
Wang, X. i sur. (2021) 'CPSF4 regulira stvaranje circRNA i prigušivanje gena posredovanog mikroRNA u hepatocelularnom karcinomu', onkogene 2021 40:25, 40 (25), str. 4338–4351. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. i sur. (2023) 'X OO-reaktivan transkript otkriva ulogu kružne RNA133 u otpornosti na bolest regulirajući ekspresiju osaraba u riži', fitopatološko istraživanje, 5 (1), str. 1–14. doi: 10.1186/s42483-023-00188-8/figure/6.
Y, H. i sur. (2023) 'CPSF3 modulira ravnotežu kružnih i linearnih transkripata u hepatocelularnom karcinomu'. doi: 10.21203/rs.3.rs-2418311/v1.
Zhang, Y. i sur. (2023.) 'Sveobuhvatna procjena circRNA u cirotskoj kardiomiopatiji prije i nakon transplantacije jetre', Međunarodna imunofarmakologija, 114, str. 109495. Doi: 10.1016/j.intimp.2022.109495.