CircRNA

Kružne RNA (circRNA) su nekodirajuće RNA koje tvore kružne strukture i imaju višestruke regulatorne uloge, uključujući natjecanje s miRNA za ciljne gene i vezanje proteina. Cjevovod BMKCloud circRNA dizajniran je za analizu biblioteka osiromašenih rRNA s dobro označenim i visokokvalitetnim referentnim genomom. Analiza počinje obrezivanjem očitavanja i kontrolom kvalitete, nakon čega slijedi usklađivanje očitavanja s referentnim genomom i predviđanjem novih circRNA, zajedno s identifikacijom poznatih circRNA iz baza podataka. Odgovarajuće miRNA mete i circRNA domaćini se naknadno identificiraju. Diferencijalna analiza ekspresije otkriva različito izražene circRNA, a odgovarajući domaćini su funkcionalno označeni kako bi se izdvojile obogaćene biološke funkcije.