Imunoprecipitacijsko sekvenciranje kromatina (ChIP-seq)
Prednosti usluge
●Napredna bioinformatska analiza i sveobuhvatna anotacija:Koristimo više baza podataka za funkcionalno označavanje gena povezanih s regijama vezanja proteina i DNK, pružajući uvid u stanične i molekularne procese koji su u osnovi interakcije.
●Podrška nakon prodaje:Naša predanost proteže se i nakon završetka projekta s 3-mjesečnim servisnim razdobljem nakon prodaje. Tijekom tog vremena nudimo praćenje projekta, pomoć u rješavanju problema i sesije s pitanjima i odgovorima kako bismo odgovorili na sva pitanja povezana s rezultatima.
●Veliko iskustvo:S iskustvom uspješnog završetka brojnih ChIP-Seq projekata, naša tvrtka donosi više od desetljeća stručnosti za stol. Naš visokostručni tim za analizu, zajedno sa sveobuhvatnim sadržajem i postprodajnom podrškom, osigurava uspjeh vaših projekata.
● Rigorozna kontrola kvalitete: Implementiramo ključne kontrolne točke u svim fazama, od pripreme uzorka i biblioteke do sekvenciranja i bioinformatike. Ovaj pedantan nadzor osigurava isporuku dosljedno visokokvalitetnih rezultata.
Specifikacije usluge
| Knjižnica | Strategija sekvenciranja | Preporučeni izlaz podataka | Kontrola kvalitete |
| Pročišćena DNA nakon imunoprecipitacije | Ilumina PE150 | 10 Gb | Q30≥85% Pretvorba bisulfita >99% MspI učinkovitost rezanja > 95% |
Zahtjevi za uzorke
Ukupna količina: ≥10 ng
Distribucija veličine fragmenata: 100-750 bps
Tijek rada usluge
Dostava uzoraka
Izgradnja knjižnice
Sekvenciranje
Analiza podataka
Usluge nakon prodaje
Uključuje sljedeću analizu:
● Kontrola kvalitete neobrađenih podataka
● Vršno pozivanje na temelju mapiranja na referentni genom
● Bilješke o genima povezanim s vrhovima
● Analiza motiva: identifikacija veznih mjesta faktora transkripcije (TFBS)
● Diferencijalna vršna analiza i bilješke
Procjena obogaćivanja u blizini početnih mjesta transkripcije (TSS)
Raspodjela CHIP vrhova na cijelom genomu
Klasifikacija područja vrhova
Funkcionalno obogaćivanje gena povezanih s vrhom (KEGG)
