Tag nrho cov transcriptome ua ntu zus - itchina
Nta
Lub tsev qiv ntawv lub tsev qiv ntawv kom ua tiav cov transcriptome: RRNA Depetion taug kev los ntawm PE150 npaj tau raws li los ntawm SE50 lub tsev qiv ntawv npaj
● Ua tiav cov lus qhia no ua tiav MRNA, LNCRA, Circna, thiab mirna hauv cais cov ntaub ntawv qhia bioinform
Kev Ntsuam Xyuas ntawm txhua tus kab sib koom ua ke ntawm cov lus qhia sib xyaw ua ke, suav nrog CERNA tes hauj lwm tsom xam.
Kev Pabcuam Zoo
●Hauv kev tsom xam ntawm cov kev cai tswj hwm: Cerna Kev Tshawb Xyuas Network tau qhib los ntawm kev ua pob ua ke ntawm MRNA, LNCRA, CIRCRON, thiab los ntawm ib qho kev ua haujlwm zoo dua qub.
●Kev qhia tshwj xeeb: Peb siv ntau yam databases kom muaj nuj nqi rau cov ntsiab lus sib txawv (DEGS) thiab ua cov kev pom ntawm cov txheej txheem cellular thiab molecular nyob rau hauv cov lus teb transcliptome.
●Kev txawj ntse dav: Nrog rau cov ntaub ntawv sau tseg ntawm kev kaw ua tiav tiav 2100 Tag nrho cov kev tshawb fawb hauv ntau pab neeg tshawb fawb, peb pab neeg coj kev muaj txiaj ntsig rau txhua qhov project.
●Kev tswj kom nruj: Peb siv cov ntsiab lus tseem ceeb thoob plaws txhua theem, los ntawm cov qauv thiab chaw khaws ntawv npaj rau kev sib txuas thiab bioinformics. Qhov kev saib xyuas me me no ua kom pom tseeb qhov kev xa tawm ntawm cov txiaj ntsig zoo.
●Kev them nyiaj yug tom qab muag: Peb cov kev cog lus txuas ntxiv tshaj qhov ua tiav nrog 3-hli tom qab muag lub sijhawm pabcuam. Nyob rau lub sijhawm no, peb muab txoj haujlwm taug xyuas kev pab ntxiv, daws teeb meem, thiab Q & ib ntu los daws cov lus nug uas cuam tshuam nrog cov txiaj ntsig
Qauv yuav tsum tau ua thiab xa khoom
| Lub tsev qiv ntawv | Seitencing Lub Tswv Yim | Cov ntaub ntawv pom zoo | Kev Tswj Xyuas Zoo |
| rranna depleted | ICATINA PE150 | 16 GB | Q30-85% |
| Loj raug xaiv | Thaum pom ICAINA | 10-20m nyeem |
Qauv Yuav Tsum Tau Ua:
Nucleotides:
| Conc. (NG / μl) | Tus nqi (μg) | Kev coj dawb huv | Kev muaj siab dawb paug |
| ≥ 80 | ≥ 1.6 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 OD260 / 230 = 0.5-25-2.5 Txwv tsis pub lossis tsis muaj protein los yog cov khoom tsis huv uas muaj nyob ntawm gel. | Rin≥6.0 5.0 ≥28s / 18S≥1.0; Txwv tsis pub lossis tsis muaj qhov nce hauv qab |
Pom zoo tus qauv xa mus
Thawv: 2 Ml Centrifuge Tube (Tin Ntawv Nyiaj tsis pom zoo)
Qauv kos npe: Pab pawg + hloov kho dua li AG1, A2, A3; B1, B2, B3.
Cov zaub mov xa tuaj:
1. Cov dej khov txias: Cov qauv yuav tsum tau ntim rau hauv cov hnab thiab faus rau hauv cov dej khov qhuav.
2. Rnastable Hlis: RNA cov qauv tuaj yeem qhuav hauv RNA stabilization raj (piv txwv li ntawm rnastable®) thiab xa tawm ntawm chav tsev kub.
Kev Pabcuam Khiav
Kev Tshawb Fawb Kev Tshawb Fawb
Qauv Xa
RNA rho tawm
Kev Siv Hauv Tsev Qiv Ntawv
Ze
Cov Ntaub Ntawv Kev Ntsuam Xyuas
Cov Kev Pab Tom Qab Muag
Bioinformformic
RNA nthuav qhia cov ntsiab lus
Cov ntsiab lus txawv
Kev Ntsuas Cera
Kev nthuav tawm sib txawv thiab muaj feem cuam tshuam rnas
Tshawb cov kev tshawb fawb txog kev tshawb fawb los ntawm BMKGene 'Tag nrho cov chaw transcriptome ua ntu zus los ntawm kev sau cov ntaub ntawv curated.
Dai, Y. li al. (2022) 'Cov Lus Qhia Tshaj Tawm Cov Lus Qhia ntawm MRNAS, LNCNAS thiab MirCNas thiab MirnNas hauv Kilmas tau txheeb xyuas los ntawm RNA-extraSencing', molecular omics, 18 (2), pp. 154-166. DOI: 10.1039 / D1MO00370D.
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Wang, XJ et al. (2022) 'Ntau-oms kev ua kev sib koom ua ke ntawm kev sib tw endogenous RNAnogen ntau cov kev cai lij choj: cov yam ntxwv moleers thiab tshuaj sib tw thiab cov yeeb ncuab hauv oncology, 12, p. 904865. DOI: 10.3389 / FONC.2022.904865 / BIBTEX.
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Yan, Z. li al. (2022) 'tag nrho-transcriptome RNle cov molecular txheej txheem cuam tshuam nrog kev saib xyuas ntawm Brothatharvest Zoo hauv Brothharvest Bed irradiation', posthaarvest biology thiab thev naus laus zis, 188, p. 111878. DOI: 10.1016 / J.Posthrvbio.2022.111878.
