Metagenomics (NGS)

Shotgun metagenomics nrog Illumina yog cov cuab yeej nrov rau kev kawm microbiomes los ntawm kev sib txuas DNA ncaj qha los ntawm cov qauv nyuaj, ua rau kev kawm ntawm ob qho tib si taxonomic thiab kev ua haujlwm sib txawv. BMKCloud metagenomic (NGS) cov kav dej pib nrog kev tswj xyuas zoo thiab kev sib koom ua ke metagenome, los ntawm cov noob tau kwv yees thiab ua ke rau hauv cov ntaub ntawv uas tsis yog rov ua dua uas tau sau tseg rau kev ua haujlwm thiab kev sau se siv ntau lub databases. Cov ntaub ntawv no yog siv los txheeb xyuas nyob rau hauv-piv txwv taxonomic ntau haiv neeg (alpha ntau haiv neeg) thiab nruab nrab-sample diversity (beta diversity). Kev soj ntsuam sib txawv ntawm cov pab pawg pom OTUs thiab kev ua haujlwm lom neeg sib txawv ntawm ob pawg siv ob qho kev ntsuas parametric thiab tsis yog parametric, thaum kev txheeb xyuas kev sib raug zoo cuam tshuam txog qhov sib txawv ntawm ib puag ncig.