lncrna

Ntev tsis-coding RNAs (lncRNA) yog RNAs ntev dua 200 nucleotides uas tsis tshua muaj peev xwm coding tab sis muaj cov haujlwm tseem ceeb. BMKCloud lncRNA pipeline yog tsim los tshuaj xyuas rRNA depleted cov tsev qiv ntawv nrog cov khoom zoo, zoo piav qhia txog kev siv genome, los ntawm kev tshuaj xyuas lncRNA thiab mRNA qhia ua ke. Tom qab nyeem trimming thiab tswj kom zoo, nyeem tau ua raws li cov ntaub ntawv siv genome los sib sau ua ke cov ntawv sau tseg, thiab kev tshuaj xyuas cov qauv gene tom qab nthuav tawm lwm txoj kev sib txuas thiab cov noob tshiab. Cov ntawv sau tau raug txheeb xyuas tias yog mRNAs lossis lncRNAs, thiab kev txheeb xyuas qhov sib txawv qhia pom qhov sib txawv ntawm lncRNAs, lawv lub hom phiaj thiab qhov sib txawv ntawm cov noob (DEGS). Ob qho DEGs thiab qhov sib txawv qhia lncRNA lub hom phiaj yog ua haujlwm tau piav qhia kom pom cov khoom muaj txiaj ntsig zoo.