पूरे जीनोम बिसुल fi ते अनुक्रमण (WGBS)
संपूर्ण जीनोम बिसल्फाइट अनुक्रमण (WGBS) डीएनए मिथाइलेशन की गहन अन्वेषण के लिए स्वर्ण-मानक पद्धति के रूप में खड़ा है, विशेष रूप से साइटोसिन (5-एमसी) में पांचवीं स्थिति, जीन अभिव्यक्ति और सेलुलर गतिविधि का एक निर्णायक नियामक। WGBS के अंतर्निहित सिद्धांत में बिसल्फाइट उपचार शामिल है, जो कि मिथाइलेटेड साइटोसिन को अपरिवर्तित छोड़ते हुए uracil (C से U) के लिए unmethylated साइटोसिन के रूपांतरण को प्रेरित करता है। यह तकनीक एकल-बेस रिज़ॉल्यूशन प्रदान करती है, जिससे शोधकर्ताओं को व्यापक रूप से मिथाइलोम की जांच करने और विभिन्न परिस्थितियों से जुड़े असामान्य मिथाइलेशन पैटर्न को उजागर करने की अनुमति मिलती है, विशेष रूप से कैंसर। WGBs को नियोजित करके, वैज्ञानिक जीनोम-वाइड मेथिलिकरण परिदृश्य में अद्वितीय अंतर्दृष्टि प्राप्त कर सकते हैं, जो विविध जैविक प्रक्रियाओं और रोगों को रेखांकित करने वाले एपिजेनेटिक तंत्र की एक बारीक समझ प्रदान करते हैं।
सेवा सुविधाएँ
● एक संदर्भ जीनोम की आवश्यकता है।
● लैम्ब्डा डीएनए को बिसल्फाइट रूपांतरण दक्षता की निगरानी के लिए जोड़ा जाता है।
● इलुमिना नोवसेक पर अनुक्रमण।
सेवा लाभ
●डीएनए मिथाइलेशन अनुसंधान के लिए स्वर्ण मानक: इस परिपक्व मिथाइलेशन रूपांतरण प्रसंस्करण प्रौद्योगिकी में उच्च सटीकता और अच्छी प्रजनन क्षमता है।
●वाइड कवरेज और सिंगल-बेस रिज़ॉल्यूशन:जीनोम-वाइड स्तर पर मिथाइलेशन साइटों का पता लगाना।
●पूरा प्लेटफ़ॉर्म:नमूना प्रसंस्करण, पुस्तकालय निर्माण, अनुक्रमण से जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण से एक-स्टॉप उत्कृष्ट सेवा प्रदान करें।
●व्यापक विशेषज्ञता: WGBS अनुक्रमण परियोजनाओं के साथ सफलतापूर्वक प्रजातियों की एक विविध रेंज में पूरा हुआ, BMKGene एक दशक से अधिक अनुभव, एक उच्च कुशल विश्लेषण टीम, व्यापक सामग्री और उत्कृष्ट पोस्ट-बिक्री समर्थन लाता है।
●ट्रांसक्रिपटोमिक्स विश्लेषण के साथ जुड़ने की संभावना: RNA-seq जैसे अन्य OMICS डेटा के साथ WGBs के एकीकृत विश्लेषण के लिए अनुमति।
नमूना विनिर्देश
| पुस्तकालय | अनुक्रमण रणनीति | अनुशंसित डेटा आउटपुट | गुणवत्ता नियंत्रण |
| बिसल्फाइट का इलाज किया गया | इलुमिना PE150 | 30x गहराई | Q30% 85% बिसल्फाइट रूपांतरण> 99% |
नमूना आवश्यकताएँ
| एकाग्रता (एनजी/) एल) | कुल राशि () g) | अतिरिक्त जरूरतें | |
| जीनोमिक डीएनए | ≥ 5 | ≥ 400 एनजी | सीमित गिरावट या संदूषण |
सेवा कार्य प्रवाह
नमूना वितरण
डीएनए निष्कर्षण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
आंकड़ा वितरण
निम्नलिखित विश्लेषण शामिल है:
● कच्चे अनुक्रमण गुणवत्ता नियंत्रण;
● संदर्भ जीनोम के लिए मैपिंग;
● 5mc मिथाइलेटेड बेस का पता लगाना;
● मिथाइलेशन वितरण और एनोटेशन का विश्लेषण;
● विभेदित मिथाइलेटेड क्षेत्रों (DMRs) का विश्लेषण;
● DMRs से जुड़े जीनों का कार्यात्मक एनोटेशन।
5MC मेथिलिकरण का पता लगाना: मिथाइलेटेड साइटों के प्रकार
मिथाइलेशन मैप। 5MC मेथिलिकरण जीनोम-वाइड वितरण
अत्यधिक मिथाइलेटेड क्षेत्रों का एनोटेशन
विभेदित रूप से मिथाइलेटेड क्षेत्र: संबंधित जीन
विभेदित रूप से मिथाइलेटेड क्षेत्र: संबद्ध जीन (जीन ऑन्कोलॉजी) का एनोटेशन
BMKGENE के पूरे जीनोम बिसल्फाइट अनुक्रमण सेवाओं द्वारा प्रकाशनों के एक क्यूरेटेड संग्रह के माध्यम से सुविधा की सुविधा का अन्वेषण करें।
फैन, वाई। एट अल। (2020) 'भेड़ कंकाल की मांसपेशियों के विकास के दौरान डीएनए मेथिलिकरण प्रोफाइल का विश्लेषण पूरे जीनोम बिसल्फाइट अनुक्रमण का उपयोग करके',बीएमसी जीनोमिक्स, 21 (1), पीपी। 1-15। doi: 10.1186/S12864-020-6751-5।
झाओ, एक्स। एट अल। (2022) 'विनाइल क्लोराइड के संपर्क में आने वाले श्रमिकों में उपन्यास डीऑक्सीराइबोन्यूक्लिक एसिड मिथाइलेशन गड़बड़ी',विष विज्ञान और औद्योगिक स्वास्थ्य, 38 (7), पीपी। 377–388। doi: 10.1177/07482337221098600
ज़ूओ, जे। एट अल। (2020) 'जीनोम मिथाइलेशन के बीच संबंध, गैर-कोडिंग आरएनए के स्तर, mRNAs और मेटाबोलाइट्स टमाटर फल में,'प्लांट जर्नल, 103 (3), पीपी। 980–994। doi: 10.1111/tpj.14778।
