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BMKMANU S3000_स्थानिक प्रतिलेख
स्थानिक ट्रांसक्रिप्टोमिक्स वैज्ञानिक नवाचार में सबसे आगे है, जो शोधकर्ताओं को उनके स्थानिक संदर्भ को संरक्षित करते हुए ऊतकों के भीतर जटिल जीन अभिव्यक्ति पैटर्न में गहराई से जाने के लिए सशक्त बनाता है। विभिन्न प्लेटफार्मों के बीच, BMKGene ने BMKManu S3000 Spatial Transcriptome चिप विकसित की है, जो 3.5μm के उन्नत रिज़ॉल्यूशन का दावा करती है, उपसेलुलर रेंज तक पहुंचती है, और बहु-स्तरीय रिज़ॉल्यूशन सेटिंग्स को सक्षम करती है। S3000 चिप, जिसमें लगभग 4 मिलियन स्पॉट हैं, स्थानिक रूप से बारकोडेड कैप्चर जांच के साथ लोड किए गए मोतियों के साथ स्तरित माइक्रोवेल्स को नियोजित करता है। स्थानिक बारकोड से समृद्ध एक सीडीएनए लाइब्रेरी, S3000 चिप से तैयार की जाती है और बाद में इलुमिना नोवासेक प्लेटफॉर्म पर अनुक्रमित की जाती है। स्थानिक रूप से बारकोड किए गए नमूनों और यूएमआई का संयोजन उत्पन्न डेटा की सटीकता और विशिष्टता सुनिश्चित करता है। BMKManu S3000 चिप बेहद बहुमुखी है, जो बहु-स्तरीय रिज़ॉल्यूशन सेटिंग्स की पेशकश करती है जिसे विभिन्न ऊतकों और विवरण के वांछित स्तरों पर बारीकी से ट्यून किया जा सकता है। यह अनुकूलनशीलता चिप को विविध स्थानिक ट्रांसक्रिप्टोमिक्स अध्ययनों के लिए एक उत्कृष्ट विकल्प के रूप में स्थापित करती है, जो न्यूनतम शोर के साथ सटीक स्थानिक क्लस्टरिंग सुनिश्चित करती है। BMKManu S3000 के साथ सेल विभाजन तकनीक का उपयोग कोशिकाओं की सीमाओं तक ट्रांसक्रिप्शनल डेटा के परिसीमन को सक्षम बनाता है, जिसके परिणामस्वरूप एक विश्लेषण होता है जिसका प्रत्यक्ष जैविक अर्थ होता है। इसके अलावा, S3000 के बेहतर रिज़ॉल्यूशन के परिणामस्वरूप प्रति कोशिका अधिक संख्या में जीन और यूएमआई का पता चलता है, जिससे स्थानिक प्रतिलेखन पैटर्न और कोशिकाओं के क्लस्टरिंग का अधिक सटीक विश्लेषण संभव हो जाता है।
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एकल-नाभिक आरएनए अनुक्रमण
एकल-सेल कैप्चर और कस्टम लाइब्रेरी निर्माण तकनीकों के विकास ने, उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण के साथ मिलकर, सेल स्तर पर जीन अभिव्यक्ति अध्ययन में क्रांति ला दी है। यह सफलता जटिल कोशिका आबादी के गहन और अधिक व्यापक विश्लेषण की अनुमति देती है, सभी कोशिकाओं पर औसत जीन अभिव्यक्ति से जुड़ी सीमाओं पर काबू पाती है और इन आबादी के भीतर वास्तविक विविधता को संरक्षित करती है। जबकि एकल-कोशिका आरएनए अनुक्रमण (scRNA-seq) के निर्विवाद फायदे हैं, यह कुछ ऊतकों में चुनौतियों का सामना करता है जहां एकल-कोशिका निलंबन का निर्माण मुश्किल साबित होता है और नए नमूनों की आवश्यकता होती है। BMKGene में, हम अत्याधुनिक 10X जीनोमिक्स क्रोमियम तकनीक का उपयोग करके एकल-न्यूक्लियस आरएनए अनुक्रमण (snRNA-seq) की पेशकश करके इस बाधा का समाधान करते हैं। यह दृष्टिकोण एकल-कोशिका स्तर पर ट्रांसक्रिप्टोम विश्लेषण के लिए उपयुक्त नमूनों के स्पेक्ट्रम को विस्तृत करता है।
नाभिक का पृथक्करण नवीन 10X जीनोमिक्स क्रोमियम चिप के माध्यम से पूरा किया जाता है, जिसमें डबल क्रॉसिंग के साथ आठ-चैनल माइक्रोफ्लुइडिक्स प्रणाली होती है। इस प्रणाली के भीतर, बारकोड, प्राइमर, एंजाइम और एक एकल नाभिक को शामिल करने वाले जेल मोतियों को नैनोलीटर आकार की तेल की बूंदों में समाहित किया जाता है, जिससे जेल बीड-इन-इमल्शन (जीईएम) बनता है। GEM गठन के बाद, प्रत्येक GEM के भीतर कोशिका विश्लेषण और बारकोड रिलीज़ होता है। इसके बाद, एमआरएनए अणु सीडीएनए में रिवर्स ट्रांसक्रिप्शन से गुजरते हैं, जिसमें 10X बारकोड और अद्वितीय आणविक पहचानकर्ता (यूएमआई) शामिल होते हैं। फिर इन सीडीएनए को मानक अनुक्रमण पुस्तकालय निर्माण के अधीन किया जाता है, जिससे एकल-कोशिका स्तर पर जीन अभिव्यक्ति प्रोफाइल की एक मजबूत और व्यापक खोज की सुविधा मिलती है।
प्लेटफ़ॉर्म: 10× जीनोमिक्स क्रोमियम और इलुमिना नोवासेक प्लेटफ़ॉर्म
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10x जीनोमिक्स विसियम स्पैटियल ट्रांस्क्रिप्टोम
स्थानिक ट्रांसक्रिप्टोमिक्स एक अत्याधुनिक तकनीक है जो शोधकर्ताओं को उनके स्थानिक संदर्भ को संरक्षित करते हुए ऊतकों के भीतर जीन अभिव्यक्ति पैटर्न की जांच करने की अनुमति देती है। इस डोमेन में एक शक्तिशाली प्लेटफ़ॉर्म इलुमिना अनुक्रमण के साथ 10x जीनोमिक्स विसियम है। 10X विसियम का सिद्धांत एक निर्दिष्ट कैप्चर क्षेत्र के साथ एक विशेष चिप पर आधारित है जहां ऊतक अनुभाग रखे जाते हैं। इस कैप्चर क्षेत्र में बारकोडेड स्पॉट होते हैं, जिनमें से प्रत्येक ऊतक के भीतर एक अद्वितीय स्थानिक स्थान से संबंधित होता है। ऊतक से कैप्चर किए गए आरएनए अणुओं को रिवर्स ट्रांसक्रिप्शन प्रक्रिया के दौरान अद्वितीय आणविक पहचानकर्ताओं (यूएमआई) के साथ लेबल किया जाता है। ये बारकोडेड स्पॉट और यूएमआई एकल-सेल रिज़ॉल्यूशन पर सटीक स्थानिक मानचित्रण और जीन अभिव्यक्ति की मात्रा का ठहराव सक्षम करते हैं। स्थानिक रूप से बारकोड किए गए नमूनों और यूएमआई का संयोजन उत्पन्न डेटा की सटीकता और विशिष्टता सुनिश्चित करता है। इस स्थानिक ट्रांसक्रिपटॉमिक्स तकनीक का उपयोग करके, शोधकर्ता कोशिकाओं के स्थानिक संगठन और ऊतकों के भीतर होने वाली जटिल आणविक अंतःक्रियाओं की गहरी समझ प्राप्त कर सकते हैं, जो ऑन्कोलॉजी, तंत्रिका विज्ञान, विकासात्मक जीव विज्ञान, इम्यूनोलॉजी सहित कई क्षेत्रों में जैविक प्रक्रियाओं के अंतर्निहित तंत्र में अमूल्य अंतर्दृष्टि प्रदान करते हैं। , और वनस्पति अध्ययन।
प्लेटफ़ॉर्म: 10X जीनोमिक्स विसियम और इलुमिना नोवासेक
