-
तुलनात्मक जीनोमिक्स
तुलनात्मक जीनोमिक्स में विभिन्न प्रजातियों के बीच संपूर्ण जीनोम अनुक्रमों और संरचनाओं की जांच और तुलना शामिल है। यह क्षेत्र प्रजातियों के विकास का अनावरण करना, जीन कार्यों को डीकोड करना और विभिन्न जीवों में संरक्षित या भिन्न अनुक्रम संरचनाओं और तत्वों की पहचान करके आनुवंशिक नियामक तंत्र को स्पष्ट करना चाहता है। एक व्यापक तुलनात्मक जीनोमिक्स अध्ययन में जीन परिवार, विकासवादी विकास, संपूर्ण-जीनोम दोहराव की घटनाओं और चयनात्मक दबावों के प्रभाव जैसे विश्लेषण शामिल हैं।
-
विकासवादी आनुवंशिकी
जनसंख्या और विकासवादी आनुवंशिक विश्लेषण मंच की स्थापना वर्षों से बीएमके आर एंड डी टीम के भीतर संचित व्यापक अनुभव के आधार पर की गई है। यह विशेष रूप से उन शोधकर्ताओं के लिए एक उपयोगकर्ता अनुकूल उपकरण है जो जैव सूचना विज्ञान में पढ़ाई नहीं कर रहे हैं। यह प्लेटफ़ॉर्म फ़ाइलोजेनेटिक वृक्ष निर्माण, लिंकेज डिसिपिलिब्रियम विश्लेषण, आनुवंशिक विविधता मूल्यांकन, चयनात्मक स्वीप विश्लेषण, रिश्तेदारी विश्लेषण, पीसीए, जनसंख्या संरचना विश्लेषण आदि सहित बुनियादी विकासवादी आनुवंशिकी से संबंधित बुनियादी विश्लेषण को सक्षम बनाता है।
-
हाई-सी आधारित जीनोम असेंबली
हाई-सी एक ऐसी विधि है जिसे जांच निकटता-आधारित इंटरैक्शन और उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण के संयोजन से गुणसूत्र विन्यास को पकड़ने के लिए डिज़ाइन किया गया है। ऐसा माना जाता है कि इन अंतःक्रियाओं की तीव्रता का गुणसूत्रों पर भौतिक दूरी के साथ नकारात्मक संबंध होता है। इसलिए, हाई-सी डेटा का उपयोग ड्राफ्ट जीनोम में इकट्ठे अनुक्रमों के क्लस्टरिंग, ऑर्डरिंग और ओरिएंटेशन को निर्देशित करने और उन्हें एक निश्चित संख्या में क्रोमोसोम पर एंकरिंग करने के लिए किया जाता है। यह तकनीक जनसंख्या-आधारित आनुवंशिक मानचित्र के अभाव में गुणसूत्र-स्तरीय जीनोम असेंबली को सशक्त बनाती है। प्रत्येक जीनोम को हाई-सी की आवश्यकता होती है।
-
पौधे/पशु डी नोवो जीनोम अनुक्रमण
दे नोवोअनुक्रमण से तात्पर्य संदर्भ जीनोम की अनुपस्थिति में अनुक्रमण प्रौद्योगिकियों का उपयोग करके किसी प्रजाति के संपूर्ण जीनोम के निर्माण से है। तीसरी पीढ़ी के अनुक्रमण की शुरूआत और व्यापक रूप से अपनाने, जिसमें लंबे समय तक पढ़ने की विशेषता है, ने पढ़ने के बीच ओवरलैप को बढ़ाकर जीनोम असेंबली में काफी वृद्धि की है। चुनौतीपूर्ण जीनोम से निपटने के दौरान यह वृद्धि विशेष रूप से प्रासंगिक है, जैसे कि उच्च हेटेरोज़ायोसिटी, दोहराव वाले क्षेत्रों का एक उच्च अनुपात, पॉलीप्लॉइड, और दोहराए जाने वाले तत्वों वाले क्षेत्र, असामान्य जीसी सामग्री, या उच्च जटिलता जो आमतौर पर शॉर्ट-रीड अनुक्रमण का उपयोग करके खराब रूप से इकट्ठे होते हैं। अकेला।
हमारा वन-स्टॉप समाधान एकीकृत अनुक्रमण सेवाएं और जैव सूचनात्मक विश्लेषण प्रदान करता है जो उच्च गुणवत्ता वाले डे नोवो असेंबल जीनोम प्रदान करता है। इलुमिना के साथ एक प्रारंभिक जीनोम सर्वेक्षण जीनोम आकार और जटिलता का अनुमान प्रदान करता है, और इस जानकारी का उपयोग PacBio HiFi के साथ लंबे समय से पढ़े गए अनुक्रमण के अगले चरण का मार्गदर्शन करने के लिए किया जाता है, जिसके बादनये सिरे सेअंडकोषों की सभा. HiC असेंबली का बाद का उपयोग क्रोमोसोम-स्तरीय असेंबली प्राप्त करते हुए, जीनोम में कॉन्टिग्स की एंकरिंग को सक्षम बनाता है। अंत में, जीनोम को जीन भविष्यवाणी द्वारा और व्यक्त जीनों को अनुक्रमित करके, छोटी और लंबी रीडिंग के साथ ट्रांसक्रिप्टोम का सहारा लेकर एनोटेट किया जाता है।
-
मानव संपूर्ण एक्सोम अनुक्रमण
ह्यूमन होल एक्सोम सीक्वेंसिंग (एचडब्ल्यूईएस) को रोग पैदा करने वाले उत्परिवर्तनों का पता लगाने के लिए एक लागत प्रभावी और शक्तिशाली अनुक्रमण दृष्टिकोण के रूप में व्यापक रूप से स्वीकार किया जाता है। संपूर्ण जीनोम का केवल 1.7% होने के बावजूद, एक्सॉन कुल प्रोटीन कार्यों की प्रोफ़ाइल को सीधे प्रतिबिंबित करके एक महत्वपूर्ण भूमिका निभाते हैं। विशेष रूप से, मानव जीनोम में, रोगों से संबंधित 85% से अधिक उत्परिवर्तन प्रोटीन कोडिंग क्षेत्रों के भीतर प्रकट होते हैं। BMKGENE विभिन्न अनुसंधान लक्ष्यों को पूरा करने के लिए उपलब्ध दो अलग-अलग एक्सॉन कैप्चरिंग रणनीतियों के साथ एक व्यापक और लचीली मानव संपूर्ण एक्सोम अनुक्रमण सेवा प्रदान करता है।
-
विशिष्ट-स्थान प्रवर्धित फ़्रैगमेंट अनुक्रमण (SLAF-Seq)
उच्च-थ्रूपुट जीनोटाइपिंग, विशेष रूप से बड़े पैमाने पर आबादी पर, आनुवंशिक संघ अध्ययन में मौलिक कदम है और कार्यात्मक जीन खोज, विकासवादी विश्लेषण आदि के लिए आनुवंशिक आधार प्रदान करता है। गहन संपूर्ण जीनोम पुन: अनुक्रमण के बजाय,कम प्रतिनिधित्व जीनोम अनुक्रमण (आरआरजीएस)आनुवंशिक मार्कर खोज में उचित दक्षता बनाए रखते हुए प्रति नमूना अनुक्रमण लागत को कम करने के लिए अक्सर इन अध्ययनों में नियोजित किया जाता है। आरआरजीएस प्रतिबंध एंजाइमों के साथ डीएनए को पचाने और एक विशिष्ट टुकड़े के आकार की सीमा पर ध्यान केंद्रित करके इसे प्राप्त करता है, जिससे जीनोम का केवल एक अंश अनुक्रमित होता है। विभिन्न आरआरजीएस पद्धतियों में से, स्पेसिफिक-लोकस एम्प्लीफाइड फ्रैगमेंट सीक्वेंसिंग (एसएलएएफ) एक अनुकूलन योग्य और उच्च गुणवत्ता वाला दृष्टिकोण है। BMKGene द्वारा स्वतंत्र रूप से विकसित यह विधि, प्रत्येक प्रोजेक्ट के लिए प्रतिबंध एंजाइम सेट को अनुकूलित करती है। यह पर्याप्त संख्या में एसएलएएफ टैग (जीनोम के 400-500 बीपीएस क्षेत्रों को अनुक्रमित किया जा रहा है) की पीढ़ी को सुनिश्चित करता है जो दोहराव वाले क्षेत्रों से प्रभावी ढंग से बचते हुए पूरे जीनोम में समान रूप से वितरित होते हैं, इस प्रकार सर्वोत्तम आनुवंशिक मार्कर खोज का आश्वासन देते हैं।
-
इल्लुमिना पूर्व-निर्मित पुस्तकालय
सिंथेसिस द्वारा सीक्वेंसिंग (एसबीएस) पर आधारित इलुमिना सीक्वेंसिंग तकनीक विश्व स्तर पर अपनाया गया एनजीएस नवाचार है, जो दुनिया के 90% से अधिक सीक्वेंसिंग डेटा उत्पन्न करने के लिए जिम्मेदार है। एसबीएस के सिद्धांत में प्रत्येक डीएनटीपी को जोड़ने पर फ्लोरोसेंटली लेबल वाले प्रतिवर्ती टर्मिनेटरों की इमेजिंग शामिल है, और बाद में अगले बेस को शामिल करने की अनुमति देने के लिए इसे क्लीयर किया जाता है। प्रत्येक अनुक्रमण चक्र में मौजूद सभी चार प्रतिवर्ती टर्मिनेटर-बाउंड डीएनटीपी के साथ, प्राकृतिक प्रतिस्पर्धा निगमन पूर्वाग्रह को कम करती है। यह बहुमुखी तकनीक जीनोमिक अनुप्रयोगों की एक श्रृंखला को पूरा करते हुए सिंगल-रीड और पेयर-एंड लाइब्रेरी दोनों का समर्थन करती है। इलुमिना अनुक्रमण की उच्च-थ्रूपुट क्षमताएं और परिशुद्धता इसे जीनोमिक्स अनुसंधान में आधारशिला के रूप में स्थापित करती है, जो वैज्ञानिकों को बेजोड़ विवरण और दक्षता के साथ जीनोम की जटिलताओं को सुलझाने में सशक्त बनाती है।
हमारी पूर्व-निर्मित लाइब्रेरी अनुक्रमण सेवा ग्राहकों को विभिन्न स्रोतों (एमआरएनए, संपूर्ण जीनोम, एम्प्लिकॉन, 10x लाइब्रेरी, अन्य) से अनुक्रमण लाइब्रेरी तैयार करने में सक्षम बनाती है। इसके बाद, इन पुस्तकालयों को इलुमिना प्लेटफार्मों में गुणवत्ता नियंत्रण और अनुक्रमण के लिए हमारे अनुक्रमण केंद्रों पर भेजा जा सकता है।
