हेटमैप
हीटमैप टूल इनपुट के रूप में एक मैट्रिक्स डेटा फ़ाइल को स्वीकार करता है और उपयोगकर्ताओं को फ़िल्टर, सामान्य और क्लस्टर डेटा को फ़िल्टर करने, सामान्य करने और क्लस्टर करने की अनुमति देता है। हीटमैप के लिए प्राथमिक उपयोग का मामला विभिन्न नमूनों के बीच जीन अभिव्यक्ति स्तर का क्लस्टर विश्लेषण है।
जीन एनोटेशन
जीन एनोटेशन टूल विभिन्न डेटाबेस के खिलाफ इनपुट FASTA फ़ाइलों के अनुक्रम संरेखण के आधार पर जीन एनोटेशन करता है।
मूल स्थानीय संरेखण खोज उपकरण
BLAST टूल NCBI BLAST का एक BMKCLOUD एकीकृत संस्करण है और इसका उपयोग BMKCloud खाते में अपलोड किए गए डेटा का उपयोग करके समान कार्यों को करने के लिए किया जा सकता है।
CDS_UTR भविष्यवाणी
CDS_UTR भविष्यवाणी उपकरण को ज्ञात प्रोटीन डेटाबेस और ORF भविष्यवाणी परिणामों के खिलाफ BLAST परिणामों के आधार पर दिए गए ट्रांसक्रिप्ट अनुक्रमों में कोडिंग क्षेत्रों (CDS) और गैर-कोडिंग क्षेत्रों (UTR) की भविष्यवाणी करने के लिए डिज़ाइन किया गया है।
मैनहट्टन प्लॉट
मैनहट्टन प्लॉट टूल उच्च नमूना प्रयोगों के प्रदर्शन को सक्षम करता है और आमतौर पर जीनोम-वाइड एसोसिएशन स्टडीज (GWAS) में उपयोग किया जाता है।
सर्कोस आरेख
सर्कोस आरेख उपकरण जीनोम में जीनोमिक सुविधा को कैसे वितरित किया जाता है, इसका कुशल विज़ुअलाइज़ेशन प्रदान करता है। सामान्य विशेषताओं में मात्रात्मक लोकी, एसएनपी, इंडल्स, स्ट्रक्चरल और कॉपी नंबर वेरिएंट शामिल हैं।
जीन ऑन्कोलॉजी (जीओ) संवर्धन
GO संवर्धन उपकरण कार्यात्मक संवर्धन विश्लेषण प्रदान करता है। इस टूल में प्राथमिक सॉफ्टवेयर TOPGO-BIOCONDUCTOR पैकेज है, जिसमें अंतर अभिव्यक्ति विश्लेषण, GO संवर्धन विश्लेषण और परिणामों का दृश्य शामिल है।
भारित जीन सह-अभिव्यक्ति नेटवर्क विश्लेषण (WGCNA)
WGCNA जीन सह-अभिव्यक्ति मॉड्यूल की खोज के लिए एक व्यापक रूप से उपयोग की जाने वाली डेटा खनन विधि है। यह माइक्रोएरे और एनजीएस जीन अभिव्यक्ति डेटा सहित विभिन्न अभिव्यक्ति डेटासेट पर लागू होता है।
इंटरप्रोस्कैन
इंटरप्रोस्कैन टूल इंटरप्रो प्रोटीन अनुक्रम विश्लेषण और वर्गीकरण प्रदान करता है।
गो केग संवर्धन
GO KEGG संवर्धन टूल एक GO संवर्धन हिस्टोग्राम, KEGG संवर्धन हिस्टोग्राम और KEGG संवर्धन मार्ग को एक प्रदान किए गए जीन सेट और इसी एनोटेशन के आधार पर डिजाइन करने के लिए डिज़ाइन है।