पैसिफिक बायोसाइंसेस (PACBIO) आइसोफॉर्म अनुक्रमण डेटा को इनपुट के रूप में लेते हुए, यह ऐप पूर्ण-लंबाई प्रतिलेख अनुक्रम (विधानसभा के बिना) की पहचान करने में सक्षम है। संदर्भ जीनोम के खिलाफ पूर्ण-लंबाई अनुक्रमों की मैपिंग करके, टेप को ज्ञात जीन, टेप, कोडिंग क्षेत्रों आदि द्वारा अनुकूलित किया जा सकता है। इस मामले में, mRNA संरचनाओं की अधिक सटीक पहचान, जैसे कि वैकल्पिक splicing, आदि, प्राप्त की जा सकती है। एनजीएस ट्रांसक्रिपटोम अनुक्रमण डेटा के साथ संयुक्त विश्लेषण ट्रांसक्रिप्ट स्तर पर अभिव्यक्ति में अधिक व्यापक एनोटेशन और अधिक सटीक परिमाणीकरण को सक्षम करता है, जो काफी हद तक डाउनस्ट्रीम अंतर अभिव्यक्ति और कार्यात्मक विश्लेषण को लाभान्वित करता है।
