गैर-संदर्भ आधारित एमआरएनए अनुक्रमण-एनजीएस
विशेषताएँ
● लाइब्रेरी तैयार करने से पहले पॉली एमआरएनए कैप्चर करना
● किसी भी संदर्भ जीनोम से स्वतंत्र: प्रतिलेखों की डे नोवो असेंबली के आधार पर, कई डेटाबेस (एनआर, स्विस-प्रोट, सीओजी, केओजी, एगएनओजी, पीएफएएम, जीओ, केईजीजी) के साथ एनोटेट किए गए यूनिजीन की एक सूची तैयार करना।
● जीन अभिव्यक्ति और प्रतिलेख संरचना का व्यापक जैव सूचनात्मक विश्लेषण
सेवा लाभ
●व्यापक विशेषज्ञता: BMKGENE में 600,000 से अधिक नमूनों को संसाधित करने के ट्रैक रिकॉर्ड के साथ, सेल संस्कृतियों, ऊतकों और शरीर के तरल पदार्थ जैसे विभिन्न नमूना प्रकारों को शामिल करते हुए, हमारी टीम हर परियोजना में अनुभव का खजाना लेकर आती है। हमने विभिन्न अनुसंधान क्षेत्रों में 100,000 से अधिक mRNA-Seq परियोजनाओं को सफलतापूर्वक बंद कर दिया है।
●कठोर गुणवत्ता नियंत्रण: हम नमूना और पुस्तकालय तैयारी से लेकर अनुक्रमण और जैव सूचना विज्ञान तक सभी चरणों में मुख्य नियंत्रण बिंदुओं को लागू करते हैं। यह सावधानीपूर्वक निगरानी लगातार उच्च-गुणवत्ता वाले परिणामों की डिलीवरी सुनिश्चित करती है।
● व्यापक व्याख्या: हम विभेदित रूप से व्यक्त जीन (डीईजी) को कार्यात्मक रूप से एनोटेट करने और संबंधित संवर्धन विश्लेषण करने के लिए कई डेटाबेस का उपयोग करते हैं, जो ट्रांसक्रिप्टोम प्रतिक्रिया के अंतर्निहित सेलुलर और आणविक प्रक्रियाओं पर अंतर्दृष्टि प्रदान करते हैं।
●बिक्री के बाद का समर्थन: हमारी प्रतिबद्धता 3 महीने की बिक्री-पश्चात सेवा अवधि के साथ परियोजना को पूरा करने से आगे तक फैली हुई है। इस समय के दौरान, हम परिणामों से संबंधित किसी भी प्रश्न के समाधान के लिए प्रोजेक्ट फॉलो-अप, समस्या निवारण सहायता और प्रश्नोत्तर सत्र की पेशकश करते हैं।
नमूना आवश्यकताएँ और वितरण
| पुस्तकालय | अनुक्रमण रणनीति | डेटा अनुशंसित | गुणवत्ता नियंत्रण |
| पॉली ए समृद्ध | इलुमिना PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 जीबी | Q30≥85% |
नमूना आवश्यकताएँ:
न्यूक्लियोटाइड्स:
| सांद्र(एनजी/μl) | मात्रा (μg) | पवित्रता | अखंडता |
| ≥ 10 | ≥ 0.2 | ओडी260/280=1.7-2.5 ओडी260/230=0.5-2.5 जेल पर सीमित या कोई प्रोटीन या डीएनए संदूषण नहीं दिखाया गया है। | पौधों के लिए: RIN≥4.0; जानवरों के लिए: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; सीमित या कोई आधारभूत उन्नयन नहीं |
● पौधे:
जड़, तना या पंखुड़ी: 450 मिलीग्राम
पत्ती या बीज: 300 मिलीग्राम
फल: 1.2 ग्राम
● पशु:
दिल या आंत: 300 मिलीग्राम
आंत या मस्तिष्क: 240 मिलीग्राम
मांसपेशी: 450 मिलीग्राम
हड्डियाँ, बाल या त्वचा: 1 ग्राम
● आर्थ्रोपोड:
कीड़े: 6 ग्राम
क्रस्टेशिया: 300 मिलीग्राम
● पूरा खून: 1 ट्यूब
● कोशिकाएं: 106 कोशिकाओं
अनुशंसित नमूना वितरण
कंटेनर: 2 मिली सेंट्रीफ्यूज ट्यूब (टिन फ़ॉइल अनुशंसित नहीं है)
नमूना लेबलिंग: समूह+प्रतिकृति जैसे A1, A2, A3; बी1, बी2, बी3.
शिपमेंट:
1. सूखी बर्फ: नमूनों को बैग में पैक करके सूखी बर्फ में दबा देना चाहिए।
2. आरएनएस्टेबल ट्यूब: आरएनए नमूनों को आरएनए स्थिरीकरण ट्यूब (जैसे आरएनएस्टेबल®) में सुखाया जा सकता है और कमरे के तापमान में भेजा जा सकता है।
सेवा कार्य प्रवाह
प्रयोग डिज़ाइन
नमूना वितरण
आरएनए निष्कर्षण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
बिक्री के बाद की सेवाएँ
बायोइनफॉरमैटिक्स
ट्रांस्क्रिप्टोम असेंबली और यूनिजीन चयन
यूनीजीन एनोटेशन
जैविक प्रतिकृति का नमूना सहसंबंध और मूल्यांकन
विभेदित रूप से व्यक्त जीन (डीईजी)
डीईजी का कार्यात्मक एनोटेशन
डीईजी का कार्यात्मक संवर्धन
प्रकाशनों के क्यूरेटेड संग्रह के माध्यम से बीएमकेजीन की यूकेरियोटिक एनजीएस एमआरएनए अनुक्रमण सेवाओं द्वारा की गई प्रगति का पता लगाएं।
शेन, एफ. एट अल. (2020) 'अमूर कैटफ़िश (सिलुरस एसोटस) के गोनाड्स में डी नोवो ट्रांसक्रिप्टोम असेंबली और सेक्स-पक्षपाती जीन अभिव्यक्ति', जीनोमिक्स, 112(3), पीपी 2603-2614। doi: 10.1016/J.YGENO.2020.01.026।
झांग, सी. एट अल. (2016) 'प्याज में बल्ब की सूजन और विकास के दौरान सुक्रोज चयापचय का ट्रांसक्रिप्टोम विश्लेषण (एलियम सेपा एल.)', फ्रंटियर्स इन प्लांट साइंस, 7 (सितंबर), पी। 212763. डीओआई: 10.3389/एफपीएलएस.2016.01425/बीआईबीटीएक्स।
झू, सी. एट अल. (2017) 'डे नोवो असेंबली, कैरेक्टराइजेशन एंड एनोटेशन फॉर ट्रांस्क्रिप्टोम ऑफ सरकोचेइलिचिस साइनेंसिस', पीएलओएस वन, 12(2)। डीओआई: 10.1371/जर्नल.पोन.0171966।
ज़ू, एल. एट अल. (2021) 'डी नोवो ट्रांस्क्रिप्टोम विश्लेषण लवणता तनाव के तहत पोडोकार्पस मैक्रोफिलस की नमक सहनशीलता में अंतर्दृष्टि प्रदान करता है', बीएमसी प्लांट बायोलॉजी, 21(1), पीपी 1-17। डीओआई: 10.1186/एस12870-021-03274-1/आंकड़े/9।
