संदर्भ जीनोम के साथ mRNA-seq (NGS)
RNA-seq जीवन और फसल विज्ञान में एक मानक उपकरण है, जो जीनोम और प्रोटिओम्स के बीच की खाई को कम करता है। इसकी ताकत नए टेप की खोज करने और एक परख में उनकी अभिव्यक्ति को निर्धारित करने में निहित है। यह व्यापक रूप से तुलनात्मक ट्रांसक्रिपटोमिक अध्ययनों के लिए उपयोग किया जाता है, विभिन्न लक्षणों या फेनोटाइप्स से संबंधित जीनों पर प्रकाश को बहाना, जैसे कि म्यूटेंट की तुलना जंगली-प्रकारों से या विशिष्ट परिस्थितियों में जीन अभिव्यक्ति का खुलासा करना। BMKCLOUD mRNA (संदर्भ) ऐप अभिव्यक्ति परिमाणीकरण, विभेदक अभिव्यक्ति विश्लेषण (DEG), और अनुक्रम संरचना को mRNA-seq (NGS) जैव सूचना विज्ञान पाइपलाइन में विश्लेषण करता है और समान सॉफ़्टवेयर की ताकत को समेटता है, सुविधा और उपयोगकर्ता-मित्रता सुनिश्चित करता है। उपयोगकर्ता अपने RNA-seq डेटा को क्लाउड पर अपलोड कर सकते हैं, जहां ऐप एक व्यापक, वन-स्टॉप बायोइनफॉर्मेटिक विश्लेषण समाधान प्रदान करता है। इसके अतिरिक्त, यह ग्राहक अनुभव को प्राथमिकता देता है, उपयोगकर्ताओं की विशिष्ट आवश्यकताओं के अनुरूप व्यक्तिगत संचालन की पेशकश करता है। उपयोगकर्ता पैरामीटर सेट कर सकते हैं और पाइपलाइन मिशन को स्वयं सबमिट कर सकते हैं, इंटरैक्टिव रिपोर्ट की जांच कर सकते हैं, डेटा/आरेख देख सकते हैं और पूरा डेटा खनन कर सकते हैं, जैसे: लक्ष्य जीन चयन, कार्यात्मक क्लस्टरिंग, डायग्रामिंग, आदि।
प्लैटफ़ॉर्म:इलुमिना, एमजीआई
रणनीति:शाही सेना Seq
लेआउट: पैरीड, क्लीन-डेटा।
लाइब्रेरी प्रकार:fr-unstrandand, fr-firststrand या fr-secondstrand
लंबाई पढ़ें:150 बीपी
फ़ाइल प्रकार:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz या *.fq.gz। सिस्टम होगाअपने फ़ाइल नामों के अनुसार .fastq फ़ाइलों को स्वचालित रूप से जोड़ें,उदाहरण के लिए *_1.Fastq को *._ 2.fastq के साथ जोड़ा गया।
नमूनों की संख्या:संख्या पर कोई प्रतिबंध नहीं हैंनमूनों की, लेकिन विश्लेषण का समय की संख्या में वृद्धि होगीनमूने बढ़ते हैं।
अनुशंसित डेटा राशि:6 जी प्रति नमूना