नैनोपोर पूर्ण-लंबाई प्रतिलेख

नैनोपोर ट्रांसक्रिप्टोम अनुक्रमण पूर्ण-लंबाई वाले सीडीएनए को अनुक्रमित करने, ट्रांसक्रिप्ट आइसोफॉर्म की सटीक पहचान करने और मात्रा निर्धारित करने के लिए एक शक्तिशाली तरीका है। बीएमकेक्लाउड नैनोपोर फुल-लेंथ ट्रांसक्रिप्टोम पाइपलाइन को उच्च गुणवत्ता वाले अच्छी तरह से एनोटेटेड संदर्भ जीनोम के खिलाफ नैनोपोर प्लेटफॉर्म पर उत्पन्न आरएनए-सेक डेटा का विश्लेषण करने के लिए डिज़ाइन किया गया है, जो जीन और ट्रांसक्रिप्ट दोनों स्तरों पर गुणात्मक और मात्रात्मक विश्लेषण प्रदान करता है। गुणवत्ता नियंत्रण के बाद, पूर्ण-लंबाई वाले गैर-काइमेरिक (एफएलएनसी) अनुक्रम प्राप्त किए जाते हैं और अनावश्यक प्रतिलेखों को हटाने के लिए सर्वसम्मति अनुक्रमों को संदर्भ जीनोम में मैप किया जाता है। इस प्रतिलेख सेट से, अभिव्यक्ति की मात्रा निर्धारित की जाती है और विभेदित रूप से व्यक्त जीन और प्रतिलेखों की पहचान की जाती है और कार्यात्मक रूप से एनोटेट किया जाता है। पाइपलाइन में वैकल्पिक पॉलीएडेनाइलेशन (एपीए) विश्लेषण, वैकल्पिक स्प्लिसिंग विश्लेषण, सरल अनुक्रम दोहराव (एसएसआर) विश्लेषण, एलएनसीआरएनए और संबंधित लक्ष्यों की भविष्यवाणी, कोडिंग अनुक्रमों की भविष्यवाणी (सीडीएस), जीन परिवार विश्लेषण, प्रतिलेखन कारक विश्लेषण, उपन्यास जीन की भविष्यवाणी भी शामिल है। और प्रतिलेखों की कार्यात्मक व्याख्या।