एमआरएनए-सीक्यू (एनजीएस) - नए सिरे से

एमआरएनए अनुक्रमण विशिष्ट परिस्थितियों में कोशिकाओं में सभी एमआरएनए प्रतिलेखों की प्रोफाइलिंग की अनुमति देता है और विभिन्न अनुसंधान क्षेत्रों में व्यापक रूप से उपयोग की जाने वाली तकनीक है। BMKCloud De novo mRNA-seq पाइपलाइन को कोई संदर्भ जीनोम उपलब्ध नहीं होने पर पॉली-ए समृद्ध अनुक्रमण पुस्तकालयों का विश्लेषण करने के लिए डिज़ाइन किया गया है। पाइपलाइन गुणवत्ता नियंत्रण से शुरू होती है, उसके बादनये सिरे सेट्रांसक्रिप्ट असेंबली और यूनिजीन सेट चयन। यूनिजीन संरचना विश्लेषण कोडिंग अनुक्रम (सीडीएस) और सरल अनुक्रम दोहराव (एसएसआर) की भविष्यवाणी करता है। इसके बाद, विभेदक अभिव्यक्ति विश्लेषण परीक्षण की गई स्थितियों के बीच विभेदित रूप से व्यक्त जीन (डीईजी) का पता लगाता है, इसके बाद जैविक अंतर्दृष्टि निकालने के लिए कार्यात्मक एनोटेशन और डीईजी का संवर्धन किया जाता है।