हाई-सी आधारित क्रोमैटिन इंटरेक्शन
सेवा सुविधाएँ
● PE150 के साथ इलुमिना नोवासेक पर अनुक्रमण।
● सेवा के लिए फॉर्मेल्डिहाइड के साथ क्रॉस-लिंक करने और डीएनए-प्रोटीन इंटरैक्शन को संरक्षित करने के लिए निकाले गए न्यूक्लिक एसिड के बजाय ऊतक के नमूनों की आवश्यकता होती है।
● हाई-सी प्रयोग में बायोटिन के साथ चिपचिपे सिरों पर प्रतिबंध और अंतिम मरम्मत शामिल है, इसके बाद अंतःक्रियाओं को संरक्षित करते हुए परिणामी कुंद सिरों को गोलाकार किया जाता है। फिर डीएनए को स्ट्रेप्टाविडिन मोतियों के साथ खींचा जाता है और बाद की लाइब्रेरी तैयारी के लिए शुद्ध किया जाता है।
सेवा लाभ
●इष्टतम प्रतिबंध एंजाइम डिजाइन: 93% तक वैध इंटरैक्शन जोड़े के साथ विभिन्न प्रजातियों पर उच्च हाई-सी दक्षता सुनिश्चित करने के लिए।
●व्यापक विशेषज्ञता और प्रकाशन रिकॉर्ड:BMKGene के पास 800 विभिन्न प्रजातियों और विभिन्न पेटेंटों से >2000 हाई-सी अनुक्रमण परियोजनाओं का व्यापक अनुभव है। 900 से अधिक के संचयी प्रभाव कारक के साथ 100 से अधिक प्रकाशित मामले।
●अत्यधिक कुशल जैव सूचना विज्ञान टीम:हाई-सी प्रयोगों और डेटा विश्लेषण के लिए इन-हाउस पेटेंट और सॉफ़्टवेयर कॉपीराइट और एक स्व-विकसित विज़ुअलाइज़ेशन डेटा सॉफ़्टवेयर के साथ।
●बिक्री के बाद का समर्थन:हमारी प्रतिबद्धता 3 महीने की बिक्री-पश्चात सेवा अवधि के साथ परियोजना को पूरा करने से आगे तक फैली हुई है। इस समय के दौरान, हम परिणामों से संबंधित किसी भी प्रश्न के समाधान के लिए प्रोजेक्ट फॉलो-अप, समस्या निवारण सहायता और प्रश्नोत्तर सत्र की पेशकश करते हैं।
●व्यापक व्याख्या: हम पहचानी गई विविधताओं के साथ जीन को कार्यात्मक रूप से एनोटेट करने और संबंधित संवर्धन विश्लेषण करने के लिए कई डेटाबेस का उपयोग करते हैं, जिससे कई शोध परियोजनाओं पर अंतर्दृष्टि मिलती है।
सेवा विशिष्टताएँ
| पुस्तकालय | अनुक्रमण रणनीति | अनुशंसित डेटा आउटपुट | हाई-सी सिग्नल रिज़ॉल्यूशन |
| हाई-सी लाइब्रेरी | इलुमिना PE150 | क्रोमैटिन लूप: 150x टीएडी: 50x | क्रोमैटिन लूप: 10Kb टीएडी: 40Kb |
सेवा आवश्यकताएँ
| नमूना प्रकार | आवश्यक राशि |
| पशु ऊतक | ≥2g |
| संपूर्ण रक्त | ≥2mL |
| कवक | ≥1 ग्राम |
| पौधा- युवा ऊतक | 1 ग्राम/एलिकोट, 2-4 एलिकोट्स अनुशंसित |
| संवर्धित कोशिकाएँ | ≥1x107 |
निम्नलिखित विश्लेषण शामिल है:
● कच्चा डेटा QC;
● मैपिंग और हाई-सी लाइब्रेरी क्यूसी: वैध इंटरेक्शन जोड़े और इंटरेक्शन क्षय घातांक (आईडीई);
● जीनोम-वाइड इंटरेक्शन प्रोफाइलिंग: सीआईएस/ट्रांस विश्लेषण और हाई-सी इंटरेक्शन मैप;
● ए/बी कम्पार्टमेंट वितरण का विश्लेषण;
● टीएडी और क्रोमैटिन लूप की पहचान;
● नमूनों के बीच 3डी क्रोमैटिन संरचना तत्वों और संबंधित जीनों के संबंधित कार्यात्मक एनोटेशन पर विभेदक विश्लेषण।
सीआईएस और ट्रांस अनुपात वितरण
नमूनों के बीच गुणसूत्रीय अंतःक्रिया का हीटमैप
ए/बी डिब्बों का जीनोम-व्यापी वितरण
क्रोमेटिन लूप्स का जीनोम-व्यापक वितरण
टीएडी का विज़ुअलाइज़ेशन
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मेंग, टी. एट अल. (2021) 'एक तुलनात्मक एकीकृत मल्टी-ओमिक्स विश्लेषण सीए2 को कॉर्डोमा के लिए एक नए लक्ष्य के रूप में पहचानता है',न्यूरो ऑन्कोलॉजी, 23(10), पृ. 1709-1722। doi: 10.1093/NEUONC/NOAB156.
जू, एल. एट अल. (2021) '3डी अव्यवस्था और जीनोम की पुनर्व्यवस्था एकीकृत हाई-सी, नैनोपोर और आरएनए अनुक्रमण द्वारा एनएएफएलडी के रोगजनन में अंतर्दृष्टि प्रदान करती है',एक्टा फार्मास्युटिका सिनिका बी, 11(10), पृ. 3150-3164. डीओआई: 10.1016/जे.एपीएसबी.2021.03.022।
