जीनोम-वाइड एसोसिएशन स्टडी (GWAS) का उद्देश्य आनुवंशिक वेरिएंट (जीनोटाइप) की पहचान करना है जो विशिष्ट लक्षणों (फेनोटाइप) से जुड़ा है। GWA अध्ययन जनसंख्या स्तर पर सांख्यिकीय विश्लेषण द्वारा बड़ी संख्या में व्यक्तियों के पूरे जीनोम को पार करते हैं और जीनोटाइप-फेनोटाइप संघों की भविष्यवाणी करते हैं। पूरे-जीनोम रीसेकेंसिंग संभावित रूप से सभी आनुवंशिक वेरिएंट की खोज कर सकते हैं। फेनोटाइपिक डेटा के साथ युग्मन, जीडब्ल्यूएएस को फेनोटाइप से संबंधित एसएनपी, क्यूटीएल और उम्मीदवार जीन की पहचान करने के लिए संसाधित किया जा सकता है, जो आधुनिक पशु/पौधे के प्रजनन को दृढ़ता से वापस करता है। SLAF एक स्व-विकसित सरलीकृत जीनोम अनुक्रमण रणनीति है, जो जीनोम-वाइड डिस्ट्रीब्यूटेड मार्कर, एसएनपी का पता लगाता है। ये एसएनपी, आणविक आनुवंशिक मार्कर के रूप में, लक्षित लक्षणों के साथ एसोसिएशन अध्ययन के लिए संसाधित किए जा सकते हैं। यह जटिल लक्षणों से जुड़े आनुवंशिक विविधताओं की पहचान करने में एक लागत प्रभावी रणनीति है।
