जीनोम-वाइड एसोसिएशन विश्लेषण
कार्यप्रवाह
सेवा लाभ
●व्यापक विशेषज्ञता और प्रकाशन अभिलेख: GWAS में संचित अनुभव के साथ, BMKGENE ने GWAS अनुसंधान में सैकड़ों प्रजातियों की परियोजनाएं पूरी कर ली हैं, शोधकर्ताओं ने 100 से अधिक लेख प्रकाशित करने में सहायता की है, और संचयी प्रभाव कारक 500 तक पहुंच गया।
● व्यापक जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण: वर्कफ़्लो में एसएनपी-ट्रेट एसोसिएशन विश्लेषण शामिल है, जो उम्मीदवार जीन का एक सेट और उनके संबंधित कार्यात्मक एनोटेशन को वितरित करता है।
●अत्यधिक कुशल जैव सूचना विज्ञान टीम और लघु विश्लेषण चक्र: उन्नत जीनोमिक्स विश्लेषण में महान अनुभव के साथ, BMKGENE की टीम एक तेज टर्नअराउंड समय के साथ व्यापक विश्लेषण प्रदान करती है।
●बिक्री के बाद का समर्थन:हमारी प्रतिबद्धता 3 महीने की बिक्री के बाद सेवा अवधि के साथ परियोजना के पूरा होने से परे है। इस समय के दौरान, हम परिणामों से संबंधित किसी भी प्रश्न को संबोधित करने के लिए प्रोजेक्ट फॉलो-अप, समस्या निवारण सहायता और प्रश्नोत्तर सत्र प्रदान करते हैं।
सेवा विनिर्देश और आवश्यकताएँ
| अनुक्रमण का प्रकार | अनुशंसित जनसंख्या मान | अनुक्रमण रणनीति | न्यूक्लियोटाइड आवश्यकताएँ |
| संपूर्ण जीनोम अनुक्रमण | 200 नमूने | 10x | एकाग्रता:/ 1 एनजी/ μl कुल राशि सीमित या कोई गिरावट या संदूषण नहीं |
| विशिष्ट-स्थानीय प्रवर्धित टुकड़ा (SLAF) | टैग गहराई: 10x टैग की संख्या: <400 एमबी: डब्ल्यूजीएस की सिफारिश की जाती है <1GB: 100k टैग 1GB > 2 जीबी: 300k टैग अधिकतम 500k टैग | एकाग्रता/5 एनजी/μl कुल राशि of 80 एनजी नैनोड्रॉप OD260/280 = 1.6-2.5 Agarose gel: नहीं या सीमित गिरावट या संदूषण
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सामग्री चयन
विभिन्न किस्में, उप -प्रजातियां, लैंडरस/जीनबैंक/मिश्रित परिवार/जंगली संसाधन
विभिन्न किस्में, उप -प्रजातियां, लैंड्रेस
हाफ-सिब परिवार/पूर्ण-सिब परिवार/जंगली संसाधन
सेवा कार्य प्रवाह
प्रयोग अभिप्राय
नमूना वितरण
आरएनए निष्कर्षण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
बिक्री के बाद सेवाएं
निम्नलिखित विश्लेषण शामिल है:
- जीनोम-वाइड एसोसिएशन विश्लेषण: LM, LMM, EMMAX, FASTLMM मॉडल
- उम्मीदवार जीन का कार्यात्मक एनोटेशन
एसएनपी-ट्रेट एसोसिएशन विश्लेषण-मैनहट्टन प्लॉट
एसएनपी-ट्रेट एसोसिएशन विश्लेषण-क्यूक्यू प्लॉट
प्रकाशनों के एक क्यूरेटेड संग्रह के माध्यम से BMKGENE'S DE GWAS सेवाओं द्वारा सुविधा प्रदान की गई प्रगति का अन्वेषण करें:
एलवी, एल। एट अल। ।एक्वाकल्चर, 569, पी। 739351। doi: 10.1016/j.aquaculture.2023.739351।
ली, एक्स। एट अल। (2022) '398 फॉक्सटेल बाजरा पहुंच के मल्टी-ओमिक्स विश्लेषण, डोमेस्टिकेशन, मेटाबोलाइट लक्षण और विरोधी भड़काऊ प्रभाव से जुड़े जीनोमिक क्षेत्रों को प्रकट करते हैं,'आणविक संयंत्र, 15 (8), पीपी। 1367–1383। doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003।
ली, जे। एट अल। (2022) 'सूखे वातावरण में बमुश्किल फेनोटाइप्स की जीनोम-वाइड एसोसिएशन मैपिंग',संयंत्र विज्ञान में सीमाएँ, 13, पी। 924892। doi: 10.3389/fpls.2022.924892/bibtex।
झाओ, एक्स। एट अल। (2021) 'GMST1, जो एक सल्फोट्रांसफेरेज़ को एन्कोड करता है, सोयाबीन मोज़ेक वायरस उपभेदों G2 और G3' के प्रतिरोध को स्वीकार करता है,संयंत्र, कोशिका और पर्यावरण, 44 (8), पीपी। 2777–2792। doi: 10.1111/pce.14066।
