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लचीले विश्लेषण ऐप्स

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यूकेरियोटिक एमआरएनए विश्लेषण (संदर्भ आधारित और डे नोवो विकल्प उपलब्ध)

यह पाइपलाइन इनपुट के रूप में एनजीएस आरएनए-सेक डेटा का उपयोग करती है और कई डाउनस्ट्रीम विश्लेषणों से परिणाम उत्पन्न करती है, जिनमें शामिल हैं, लेकिन इन्हीं तक सीमित नहीं हैं: अनुक्रमण डेटा गुणवत्ता मूल्यांकन,नये सिरे सेप्रतिलेखन साइट एनोटेशन, वेरिएबल स्प्लिसिंग विश्लेषण, विभेदक अभिव्यक्ति विश्लेषण, फ़ंक्शन एनोटेशन और संवर्धन विश्लेषण।

लंबा गैर-कोडिंग आरएनए विश्लेषण

लंबे गैर-कोडिंग आरएनए (एलएनसीआरएनए) 200 एनटी से अधिक लंबाई वाले गैर-कोडिंग प्रतिलेख हैं और क्रोमैटिन संगठन और विनियमन में भूमिका निभाने के लिए जाने जाते हैं। उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण प्रौद्योगिकियों और जैव सूचना विज्ञान ने महत्वपूर्ण नियामक कार्यों के साथ एलएनसीआरएनए की पहचान करने के लिए हमारी समझ एलएनसीआरएनए अनुक्रमों और स्थिति जानकारी को सशक्त बनाया है। यह पाइपलाइन यूकेरियोटिक एमआरएनए विश्लेषण पाइपलाइन में उल्लिखित विश्लेषणों के अलावा एलएनसीआरएनए विश्लेषण प्रदान करती है।

 

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16एस/18एस/आईटीएस एम्प्लिकॉन अनुक्रमण

माइक्रोबियल विविधता परियोजना विश्लेषण में वर्षों के अनुभव के आधार पर एम्प्लिकॉन सीक्वेंसिंग माइक्रोबियल विविधता विश्लेषण पाइपलाइन विकसित की गई थी। पाइपलाइन में मानकीकृत बुनियादी विश्लेषण शामिल है, जो वर्तमान माइक्रोबियल अनुसंधान और वैयक्तिकृत विश्लेषण की मुख्यधारा विश्लेषण सामग्री को कवर करता है। विश्लेषण रिपोर्ट समृद्ध और व्यापक है, जिसमें विविध व्यक्तिगत विश्लेषण करने का विकल्प है। इसके अतिरिक्त, अतिरिक्त अनुकूलन और नियंत्रण के लिए नमूनों और समूहों को तुरंत संशोधित किया जा सकता है।

शॉटगन मेटागेनोमिक्स विश्लेषण

शॉटगन मेटागेनोमिक विश्लेषण पाइपलाइन पर्यावरणीय नमूनों से निकाले गए मिश्रित जीनोमिक सामग्रियों से एनजीएस डेटा का उपयोग करती है। शामिल विश्लेषण प्रजातियों की विविधता और बहुतायत, जनसंख्या संरचना, फ़ाइलोजेनेटिक संबंध, कार्यात्मक जीन और पर्यावरणीय कारकों के साथ सहसंबंध नेटवर्क पर विस्तृत जानकारी प्रदान करते हैं।

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एनजीएस-डब्ल्यूजीएस वेरिएंट विश्लेषण

एनजीएस-डब्ल्यूजीएस वेरिएंट विश्लेषण एक एकीकृत वेरिएंट डिटेक्शन पाइपलाइन है जो डेटा गुणवत्ता नियंत्रण, अनुक्रम संरेखण, एनोटेशन और जीन उत्परिवर्तन विश्लेषण करता है। पाइपलाइन एसएनपी और इनडेल डिटेक्शन के लिए जीएटीके सर्वोत्तम प्रथाओं का पालन करती है और संरचनात्मक वेरिएंट कॉलिंग के लिए मंटा का उपयोग करती है।

जीनोम वाइड एसोसिएशन स्टडी (जीडब्ल्यूएएस)

जीडब्ल्यूएएस पाइपलाइन एक डाउनस्ट्रीम विश्लेषण है जो इनपुट के रूप में व्यक्तियों के एक समूह के लिए पहले से उत्पन्न वीसीएफ फाइलें और संबंधित फेनोटाइप डेटा लेता है। विशिष्ट सांख्यिकीय पद्धतियों का उपयोग करते हुए, जीडब्ल्यूएएस का लक्ष्य फेनोटाइपिक अंतरों से संबंधित जीनोम-व्यापी न्यूक्लियोटाइड विविधताओं को उजागर करना है। यह जटिल मानव रोगों और पौधों और जानवरों में जटिल लक्षणों से जुड़े कार्यात्मक जीन की खोज में महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है।

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थोक पृथक्करण विश्लेषण (बीएसए)

बीएसए विश्लेषण में अलग-अलग आबादी से अत्यधिक फेनोटाइपिक लक्षणों वाले व्यक्तियों को एकत्रित करना शामिल है। एकत्र किए गए नमूनों के बीच अंतर लोकी की तुलना करके, यह दृष्टिकोण तेजी से लक्ष्य जीन से जुड़े निकट से जुड़े आणविक मार्करों की पहचान करता है। पौधों और जानवरों के आनुवंशिक मानचित्रण में व्यापक रूप से उपयोग किया जाता है, यह मार्कर-सहायता प्रजनन के लिए एक मूल्यवान उपकरण है।

विकासवादी आनुवंशिकी विश्लेषण

इवोल्यूशनरी जेनेटिक्स विश्लेषण वर्कफ़्लो आनुवंशिक विकास परियोजनाओं में बीएमकेजीएनई के व्यापक अनुभव का लाभ उठाता है और इसमें फ़ाइलोजेनेटिक वृक्ष निर्माण, लिंकेज डिसिपिलिब्रियम विश्लेषण, आनुवंशिक विविधता मूल्यांकन, चयनात्मक स्वीप पहचान, रिश्तेदारी विश्लेषण, प्रमुख घटक विश्लेषण और जनसंख्या संरचना लक्षण वर्णन शामिल है।

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