विकासवादी आनुवंशिकी
सेवा लाभ
ताकगी एट अल।,प्लांट जर्नल, 2013
●व्यापक जैव सूचनात्मक विश्लेषण:आनुवंशिक विविधता के आकलन को सक्षम करना, जो प्रजातियों की विकासवादी क्षमता को दर्शाता है, और अभिसरण विकास और समानांतर विकास के न्यूनतम प्रभाव के साथ प्रजातियों के बीच विश्वसनीय phylogenetic संबंध प्रकट करता है
●वैकल्पिक अनुकूलित विश्लेषण: जैसे न्यूक्लियोटाइड और अमीनो एसिड स्तर पर भिन्नता के आधार पर विचलन समय और गति का अनुमान।
●व्यापक विशेषज्ञता और प्रकाशन अभिलेख: BMKGene ने 15 वर्षों से अधिक समय तक जनसंख्या और विकासवादी आनुवंशिकी परियोजनाओं में बड़े पैमाने पर अनुभव जमा किया है, हजारों प्रजातियों को कवर किया है, आदि ने प्रकृति संचार, आणविक पौधों, प्लांट बायोटेक्नोलॉजी जर्नल, आदि में प्रकाशित 1000 से अधिक उच्च-स्तरीय परियोजनाओं में योगदान दिया है।
● अत्यधिक कुशल जैव सूचना विज्ञान टीम और लघु विश्लेषण चक्र: उन्नत जीनोमिक्स विश्लेषण में महान अनुभव के साथ, BMKGENE की टीम एक तेज टर्नअराउंड समय के साथ व्यापक विश्लेषण प्रदान करती है।
● बिक्री के बाद का समर्थन:हमारी प्रतिबद्धता 3 महीने की बिक्री के बाद सेवा अवधि के साथ परियोजना के पूरा होने से परे है। इस समय के दौरान, हम परिणामों से संबंधित किसी भी प्रश्न को संबोधित करने के लिए प्रोजेक्ट फॉलो-अप, समस्या निवारण सहायता और प्रश्नोत्तर सत्र प्रदान करते हैं।
सेवा विनिर्देश और आवश्यकताएँ
| अनुक्रमण का प्रकार | अनुशंसित जनसंख्या मान | अनुक्रमण रणनीति | न्यूक्लियोटाइड आवश्यकताएँ |
| संपूर्ण जीनोम अनुक्रमण | ≥ 30 व्यक्तियों, प्रत्येक उपसमूह से and 10 व्यक्तियों के साथ
| 10x | एकाग्रता:/ 1 एनजी/ μl कुल राशि सीमित या कोई गिरावट या संदूषण नहीं |
| विशिष्ट-स्थानीय प्रवर्धित टुकड़ा (SLAF) | टैग गहराई: 10x टैग की संख्या: <400 एमबी: डब्ल्यूजीएस की सिफारिश की जाती है <1GB: 100k टैग 1GB > 2 जीबी: 300k टैग अधिकतम 500k टैग | एकाग्रता/5 एनजी/μl कुल राशि of 80 एनजी नैनोड्रॉप OD260/280 = 1.6-2.5 Agarose gel: नहीं या सीमित गिरावट या संदूषण
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सेवा कार्य प्रवाह
प्रयोग अभिप्राय
नमूना वितरण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
बिक्री के बाद सेवाएं
सेवा में जनसंख्या संरचना (Phylogenetic पेड़, PCA, जनसंख्या स्तरीकरण चार्ट), जनसंख्या विविधता और जनसंख्या चयन (लिंकेज डिसिपिलिब्रियम, लाभप्रद साइटों के चयनात्मक स्वीप-सेलेक्शन) का विश्लेषण शामिल है। सेवा में अनुकूलित विश्लेषण (जैसे विचलन समय, जीन प्रवाह) भी शामिल हो सकता है।
*यहां दिखाए गए डेमो परिणाम सभी BMKGENE के साथ प्रकाशित जीनोम से हैं
1.evolution विश्लेषण में आनुवंशिक विविधताओं के आधार पर phylogenetic पेड़, जनसंख्या संरचना और PCA का निर्माण होता है।
Phylogenetic पेड़ आम पूर्वजों के साथ प्रजातियों के बीच टैक्सोनोमिक और विकासवादी संबंधों का प्रतिनिधित्व करता है।
पीसीए का उद्देश्य उप-आबादी के बीच निकटता की कल्पना करना है।
जनसंख्या संरचना एलील आवृत्तियों के संदर्भ में आनुवंशिक रूप से अलग-अलग उप-जनसंख्या की उपस्थिति को दर्शाती है।
चेन, एट। अल।,स्वामी, 2020
2. सेलेक्टिव स्वीप
चयनात्मक स्वीप एक ऐसी प्रक्रिया को संदर्भित करता है जिसके द्वारा एक लाभप्रद साइट का चयन किया जाता है और लिंक किए गए तटस्थ साइटों की आवृत्तियों को बढ़ाया जाता है और अनलिंक किए गए साइटों को कम किया जाता है, जिसके परिणामस्वरूप क्षेत्रीय की कमी होती है।
चयनात्मक स्वीप क्षेत्रों पर जीनोम-वाइड डिटेक्शन को एक स्लाइडिंग विंडो (100 केबी) के भीतर सभी एसएनपी के सभी एसएनपी (10 केबी) के भीतर सभी एसएनपी के जनसंख्या आनुवंशिक सूचकांक π π π fst, ताजिमा के डी) की गणना करके संसाधित किया जाता है।
न्यूक्लियोटाइड विविधता
ताजिमा की डी
निर्धारण सूचकांक
वू, एट। अल।,आणविक संयंत्र, 2018
3. गिन
वू, एट। अल।,आणविक संयंत्र, 2018
4. डेमोग्राफिक इतिहास
झांग, एट। अल।,प्रकृति पारिस्थितिकी और विकास, 2021
5.divergence समय
झांग, एट। अल।,प्रकृति पारिस्थितिकी और विकास, 2021
प्रकाशनों के एक क्यूरेटेड संग्रह के माध्यम से BMKGENE की विकासवादी आनुवंशिकी सेवाओं द्वारा सुविधा प्रदान की गई प्रगति का अन्वेषण करें:
हसनार, एके एट अल। ।इंटरनेशनल जर्नल ऑफ मॉलिक्यूलर साइंसेज, 24 (7)। doi: 10.3390/IJMS24076238।
चाय, जे। एट अल। (2022) 'एक जंगली, आनुवंशिक रूप से शुद्ध चीनी दिग्गज सैलामैंडर की खोज नए संरक्षण के अवसर पैदा करती है',जूलॉजिकल रिसर्च, 2022, वॉल्यूम। 43, अंक 3, पृष्ठ: 469-480, 43 (3), पीपी। 469-480। doi: 10.24272/j.issn.2095-8137.2022.101।
हान, एम। एट अल। ।संयंत्र विज्ञान में सीमाएँ, 13, पी। 882601। doi: 10.3389/fpls.2022.882601/bibtex।
वांग, जे। एट अल। (2022) 'लोंगान के विकास में एक क्रोमोसोम-स्तरीय जीनोम असेंबली और लोंगान एक्सेस के जनसंख्या जीनोमिक्स से जीनोमिक अंतर्दृष्टि',बागवानी अनुसंधान, 9। DOI: 10.1093/hr/uhac021।
