●प्लेटफार्म:इलुमिना नोवासेक 6000 और नोवासेक एक्स प्लस
●अनुक्रमण मोड:PE150 और PE250
●अनुक्रमण से पहले पुस्तकालयों का गुणवत्ता नियंत्रण
●अनुक्रमण डेटा क्यूसी और वितरण:डीमल्टीप्लेक्सिंग और Q30 रीड्स को फ़िल्टर करने के बाद फास्टक्यू प्रारूप में क्यूसी रिपोर्ट और कच्चे डेटा की डिलीवरी
●अनुक्रमण सेवाओं की बहुमुखी प्रतिभा:ग्राहक लेन, फ्लो सेल, या आवश्यक डेटा की मात्रा (आंशिक लेन अनुक्रमण) के आधार पर अनुक्रम चुन सकता है।
●इलुमिना अनुक्रमण मंच पर व्यापक अनुभव:विभिन्न प्रजातियों के साथ हजारों बंद परियोजनाओं के साथ।
●अनुक्रमण क्यूसी रिपोर्ट की डिलीवरी:गुणवत्ता मेट्रिक्स, डेटा सटीकता और अनुक्रमण परियोजना के समग्र प्रदर्शन के साथ।
●परिपक्व अनुक्रमण प्रक्रिया:कम टर्न-अराउंड समय के साथ.
●कठोर गुणवत्ता नियंत्रण: हम लगातार उच्च-गुणवत्ता वाले परिणामों की डिलीवरी की गारंटी के लिए सख्त QC आवश्यकताओं को लागू करते हैं।
प्लैटफ़ॉर्म | प्रवाह सेल | अनुक्रमण मोड | इकाई | अनुमानित आउटपुट |
नोवासेक एक्स | 10बी (8 लेन) | पीई150 | एकल लेन आंशिक लेन | 375जीबी/लेन |
25बी (8 लेन) | पीई150 | एकल लेन आंशिक लेन | 1000 जीबी/लेन | |
नोवासेक 6000 | एसपी फ्लो सेल (2 लेन) | पीई250 | प्रवाह सेल एकल लेन आंशिक लेन | 325-400 एम रीड्स/लेन |
S4 फ्लो सेल (4 लेन) | पीई150 | प्रवाह सेल एकल लेन आंशिक लेन | ~800 जीबी/लेन |
डेटा राशि (एक्स) | एकाग्रता (क्यूपीसीआर/एनएम) | आयतन | |
आंशिक लेन अनुक्रमण
| एक्स ≤ 10 जीबी | ≥ 1 एनएम | ≥ 25 μl |
10 जीबी <एक्स ≤ 50 जीबी | ≥ 2 एनएम | ≥ 25 μl | |
50 जीबी <एक्स ≤ 100 जीबी | ≥ 3 एनएम | ≥ 25 μl | |
एक्स > 100 जीबी | ≥ 4 एनएम | ≥ 25 μl | |
लेन अनुक्रमण | प्रति लेन | ≥ 1.5 एनएम/लाइब्रेरी पूल | ≥ 25 μl / लाइब्रेरी पूल |
एकाग्रता और कुल मात्रा के अलावा, एक उपयुक्त शिखर पैटर्न की भी आवश्यकता होती है।
नोट: कम विविधता वाले पुस्तकालयों के लेन अनुक्रमण के लिए मजबूत बेस कॉलिंग सुनिश्चित करने के लिए PhiX स्पाइक-इन की आवश्यकता होती है।
हम पूर्व-पूलित पुस्तकालयों को नमूने के रूप में सबमिट करने की अनुशंसा करते हैं। यदि आपको लाइब्रेरी पूलिंग करने के लिए BMKGENE की आवश्यकता है, तो कृपया देखें
आंशिक लेन अनुक्रमण के लिए पुस्तकालय आवश्यकताएँ।
मुख्य शिखर 300-450 बीपी के भीतर होना चाहिए।
पुस्तकालयों में एक ही मुख्य शिखर होना चाहिए, कोई एडाप्टर संदूषण नहीं होना चाहिए और कोई प्राइमर डिमर नहीं होना चाहिए।
पुस्तकालय की गुणवत्ता पर एक रिपोर्ट अनुक्रमण, पुस्तकालय की मात्रा का आकलन और विखंडन से पहले प्रदान की जाती है।
तालिका 1. अनुक्रमण डेटा पर आँकड़े।
नमूना आईडी | बीएमकेआईडी | कच्चा पढ़ता है | कच्चा डेटा (बीपी) | साफ़ पढ़ें (%) | Q20(%) | Q30(%) | जीसी(%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
चित्र 1. प्रत्येक नमूने में गुणवत्ता वितरण
चित्र 2. आधार सामग्री वितरण
चित्र 3. अनुक्रमण डेटा में पढ़ी गई सामग्री का वितरण