पूर्ण-लंबाई एमआरएनए अनुक्रमण -पैकबियो
विशेषताएँ
● लाइब्रेरी की तैयारी के बाद पॉली-ए एमआरएनए से सीडीएनए संश्लेषण
● सीसीएस मोड में अनुक्रमण, HiFi रीड उत्पन्न करना
● पूर्ण-लंबाई प्रतिलेखों का अनुक्रमण
● विश्लेषण के लिए संदर्भ जीनोम की आवश्यकता नहीं है; हालाँकि, इसे नियोजित किया जा सकता है
● जैव सूचनात्मक विश्लेषण प्रतिलेख आइसोफॉर्म एलएनसीआरएनए, जीन फ्यूजन, पॉली-एडिनाइलेशन और जीन संरचना के विश्लेषण को सक्षम बनाता है।
सेवा लाभ
●उच्च सटीकता: HiFi सटीकता के साथ पढ़ता है >99.9% (Q30), जो NGS के बराबर है
● वैकल्पिक स्प्लिसिंग विश्लेषण: संपूर्ण प्रतिलेखों का अनुक्रमण आइसोफॉर्म पहचान और लक्षण वर्णन को सक्षम बनाता है
●व्यापक विशेषज्ञता: 1100 से अधिक PacBio पूर्ण-लंबाई ट्रांसक्रिप्टोम परियोजनाओं को पूरा करने और 2300 से अधिक नमूनों को संसाधित करने के ट्रैक रिकॉर्ड के साथ, हमारी टीम हर परियोजना के लिए समृद्ध अनुभव लेकर आती है।
●बिक्री के बाद का समर्थन: हमारी प्रतिबद्धता 3 महीने की बिक्री-पश्चात सेवा अवधि के साथ परियोजना को पूरा करने से आगे तक फैली हुई है। इस समय के दौरान, हम परिणामों से संबंधित किसी भी प्रश्न के समाधान के लिए प्रोजेक्ट फॉलो-अप, समस्या निवारण सहायता और प्रश्नोत्तर सत्र की पेशकश करते हैं।
नमूना आवश्यकताएँ और वितरण
| पुस्तकालय | अनुक्रमण रणनीति | डेटा अनुशंसित | गुणवत्ता नियंत्रण |
| पॉलीए समृद्ध एमआरएनए सीसीएस लाइब्रेरी | पैकबियो सीक्वल II पैकबियो रिवियो | 20/40 जीबी 5/10 एम सीसीएस | Q30≥85% |
नमूना आवश्यकताएँ:
न्यूक्लियोटाइड्स:
● पौधे:
जड़, तना या पंखुड़ी: 450 मिलीग्राम
पत्ती या बीज: 300 मिलीग्राम
फल: 1.2 ग्राम
● पशु:
दिल या आंत: 300 मिलीग्राम
आंत या मस्तिष्क: 240 मिलीग्राम
मांसपेशी: 450 मिलीग्राम
हड्डियाँ, बाल या त्वचा: 1 ग्राम
● आर्थ्रोपोड:
कीड़े: 6 ग्राम
क्रस्टेशिया: 300 मिलीग्राम
● पूरा खून: 1 ट्यूब
● कोशिकाएं: 106 कोशिकाओं
| सांद्र(एनजी/μl) | मात्रा (μg) | पवित्रता | अखंडता |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | ओडी260/280=1.7-2.5 ओडी260/230=0.5-2.5 जेल पर सीमित या कोई प्रोटीन या डीएनए संदूषण नहीं दिखाया गया है। | पौधों के लिए: RIN≥7.5; जानवरों के लिए: RIN≥8.0; 5.0≥ 28S/18S≥1.0; सीमित या कोई आधारभूत उन्नयन नहीं |
अनुशंसित नमूना वितरण
कंटेनर: 2 मिली सेंट्रीफ्यूज ट्यूब (टिन फ़ॉइल अनुशंसित नहीं है)
नमूना लेबलिंग: समूह+प्रतिकृति जैसे A1, A2, A3; बी1, बी2, बी3.
शिपमेंट:
1. सूखी बर्फ: नमूनों को बैग में पैक करके सूखी बर्फ में दबा देना चाहिए।
2. आरएनएस्टेबल ट्यूब: आरएनए नमूनों को आरएनए स्थिरीकरण ट्यूब (जैसे आरएनएस्टेबल®) में सुखाया जा सकता है और कमरे के तापमान में भेजा जा सकता है।
सेवा कार्य प्रवाह
प्रयोग डिज़ाइन
नमूना वितरण
आरएनए निष्कर्षण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
बिक्री के बाद की सेवाएँ
निम्नलिखित विश्लेषण शामिल है:
● कच्चा डेटा गुणवत्ता नियंत्रण
● वैकल्पिक पॉलीएडेनाइलेशन विश्लेषण (एपीए)
● संलयन प्रतिलेख विश्लेषण
● वैकल्पिक स्प्लिसिंग विश्लेषण
● बेंचमार्किंग यूनिवर्सल सिंगल-कॉपी ऑर्थोलॉग्स (बुस्को) विश्लेषण
● उपन्यास प्रतिलेख विश्लेषण: कोडिंग अनुक्रम (सीडीएस) और कार्यात्मक एनोटेशन की भविष्यवाणी
● एलएनसीआरएनए विश्लेषण: एलएनसीआरएनए और लक्ष्य की भविष्यवाणी
● माइक्रोसैटेलाइट पहचान (एसएसआर)
बुस्को विश्लेषण
वैकल्पिक स्प्लिसिंग विश्लेषण
वैकल्पिक पॉलीएडेनाइलेशन विश्लेषण (एपीए)
उपन्यास प्रतिलेखों की कार्यात्मक व्याख्या
इस विशेष प्रकाशन में BMKGene की नैनोपोर फुल-लेंथ mRNA अनुक्रमण सेवाओं द्वारा की गई प्रगति का पता लगाएं।
मा, वाई. एट अल. (2023) 'नेमोपिलेमा नोमुराई विष पहचान के लिए पैकबायो और ओएनटी आरएनए अनुक्रमण विधियों का तुलनात्मक विश्लेषण', जीनोमिक्स, 115(6), पी। 110709. डीओआई: 10.1016/जे.वाईजीईएनओ.2023.110709।
चाओ, क्यू. एट अल. (2019) 'पॉपुलस स्टेम ट्रांस्क्रिप्टोम की विकासात्मक गतिशीलता', प्लांट बायोटेक्नोलॉजी जर्नल, 17(1), पीपी. 206-219। डीओआई: 10.1111/पीबीआई.12958।
डेंग, एच. एट अल. (2022) 'एक्टिनिडिया लैटिफोलिया (एक एस्कॉर्बेट-समृद्ध फल फसल) और एसोसिएटेड आणविक तंत्र के फलों के विकास और पकने के दौरान एस्कॉर्बिक एसिड सामग्री में गतिशील परिवर्तन', आणविक विज्ञान के अंतर्राष्ट्रीय जर्नल, 23(10), पी। 5808. डीओआई: 10.3390/आईजेएमएस23105808/एस1।
हुआ, एक्स. एट अल. (2022) 'पेरिस पॉलीफिला में बायोएक्टिव पॉलीफिलिन में शामिल बायोसिंथेटिक पाथवे जीन की प्रभावी भविष्यवाणी', संचार जीवविज्ञान 2022 5:1, 5(1), पीपी 1-10। doi: 10.1038/s42003-022-03000-z.
लियू, एम. एट अल. (2023) 'टुटा एब्सोल्यूटा (मेरिक) ट्रांसक्रिप्टोम और साइटोक्रोम पी450 जीन का संयुक्त पैकबियो आइसो-सेक और इलुमिना आरएनए-सेक विश्लेषण', कीड़े, 14(4), पी। 363. डीओआई: 10.3390/इंसेक्ट्स14040363/एस1।
वांग, लिजुन एट अल। (2019) 'रिकिनस कम्युनिस में रिसिनोलेइक एसिड बायोसिंथेसिस की बेहतर समझ के लिए इलुमिना आरएनए अनुक्रमण के साथ संयुक्त पैकबायो एकल-अणु वास्तविक समय विश्लेषण का उपयोग करके ट्रांसक्रिप्टोम जटिलता का एक सर्वेक्षण', बीएमसी जीनोमिक्स, 20(1), पीपी 1-17। डीओआई: 10.1186/एस12864-019-5832-9।
