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*यहां दिखाए गए डेमो परिणाम बायोमार्कर प्रौद्योगिकियों के साथ प्रकाशित जीनोम से हैं

1. एलटीआर सम्मिलित समय का अनुमान: आंकड़ा अन्य प्रजातियों की तुलना में, राई जीनोम में एलटीआर-आरटीएस सम्मिलन समय में एक अद्वितीय बिमोडल वितरण दिखाया गया है। सबसे हालिया चोटी लगभग 0.5 मिलियन साल पहले दिखाई दी थी।

ली गुआंग एट अल।,प्रकृति आनुवंशिकी, 2021

2. फाइलोजनी और जीन पारिवारिक विश्लेषण चायोट (सेकहियम एड्यूल) पर: चायोट और जीन परिवार में अन्य 13 संबंधित प्रजातियों का विश्लेषण करके, चायोट को साँप लौकी (ट्राइकोसैंथ्स एंजुइना) के साथ सबसे अधिक निकटता से संबंधित पाया गया। लगभग 27-45 MYA और पूरे जीनोम डुप्लिकेशन (WGD) में स्नेक गॉर्ड से प्राप्त चयोट को 25 of 4 Mya में चायोट में देखा गया था, जो कि Cucuibitaceae में तीसरा WGD घटना है।

फू ए एट अल।बागवानी अनुसंधान, 2021

3.Synteny विश्लेषण: फलों के विकास में फाइटोहोर्मोन से संबंधित कुछ जीन चायोट, स्नेक गॉर्ड और स्क्वैश में पाए गए थे। चायोट और स्क्वैश के बीच सहसंबंध चायोट और स्नेक गॉर्ड के बीच की तुलना में थोड़ा अधिक है।

फू ए एट अल।बागवानी अनुसंधान, 2021

4. जीने पारिवारिक विश्लेषण: जीन परिवार के विस्तार और G.Thurberi और G.Davidsonii जीनोम में संकुचन पर KEGG संवर्धन दिखाया गया है कि स्टेरॉयड बायोसिंथेसिस और ब्रैसिनोस्टेरॉइड बायोसिंथेसिस संबंधित जीन का विस्तार किया गया था।

यांग जेड एट अल।,बीएमसी बायोलॉजी, 2021

5. जीनोम डुप्लीकेशन विश्लेषण: 4DTV और केएस वितरण विश्लेषण ने पूरे जीनोम डुप्लीकेशन इवेंट को दिखाया। Intraspecies की चोटियों ने दोहराव घटनाओं को दिखाया। चौराहे की चोटियों ने सट्टेबाजी की घटनाओं को दिखाया। विश्लेषण ने संकेत दिया कि अन्य तीन बारीकी से संबंधित प्रजातियों के साथ तुलना करते हुए, ओ। यूरोपिया ने हाल ही में बड़े पैमाने पर जीन डुप्लिकेशन के माध्यम से चला गया।

राव जी एट अल।,बागवानी अनुसंधान, 2021

बीएमके केस

चुभन के बिना गुलाब: नमी अनुकूलन से जुड़े जीनोमिक अंतर्दृष्टि

प्रकाशित: राष्ट्रीय विज्ञान समीक्षा, 2021

अनुक्रमण रणनीति:

'बासी काकॉटे से रहित' (आर।विचुरैनन) जीनोम:
लगभग। 93 x PACBIO + लगभग। 90 x नैनोपोर + 267 x इलुमिना

प्रमुख परिणाम

1. उच्च गुणवत्ता r.wichuraiana जीनोम का निर्माण लंबे समय से पढ़े जाने वाले अनुक्रमण तकनीकों का उपयोग करके किया गया था, जो 530.07 एमबी की एक विधानसभा का उत्पादन करता है (अनुमानित जीनोम आकार फ्लो साइटोमेट्री द्वारा लगभग 525.9 एमबी था और जीनोम सर्वेक्षण द्वारा 525.5। ； हेटेरोज़ायोसिटी 1.03%के आसपास था)। Busco का अनुमानित स्कोर 93.9%था। "ओल्ड ब्लश" (हाप्लोब) के साथ तुलना करते हुए, इस जीनोम की गुणवत्ता और पूर्णता की पुष्टि बेस सिंगल-बेस सटीकता और एलटीआर असेंबली इंडेक्स (एलएआई = 20.03) द्वारा की गई थी। R.wichuraiana जीनोम में 32,674 प्रोटीन कोडिंग जीन शामिल हैं।

2.Multi-Omics संयुक्त विश्लेषण, तुलनात्मक जीनोमिक्स, ट्रांसक्रिपटॉमिक्स, जेटीएल विश्लेषण से मिलकर, जेनेटिक आबादी के क्यूटीएल विश्लेषण, आर। विचुरियाना और रोजा चिनेंसिस के बीच महत्वपूर्ण अटकलों का पता चला। इसके अलावा, क्यूटीएल में संबंधित जीनों की अभिव्यक्ति भिन्नता स्टेम चुभन पैटर्निंग के साथ जुड़े होने की संभावना थी।

बासे के बीच तुलनात्मक जीनोमिक्स एनीसिस; एस कांटेले और रोजा चिनेंसिस सहित सिंटेनी विश्लेषण, जीन परिवार क्लस्टर, विस्तार और संकुचन विश्लेषण, बड़ी संख्या में विविधताओं का पता चला, जो गुलाबों में महत्वपूर्ण लक्षणों से संबंधित हैं। एनएसी और एफएआर 1/एफआरएस जीन परिवार में अद्वितीय विस्तार ब्लैक स्पॉट के प्रतिरोध के साथ जुड़े होने की बहुत संभावना थी।

झोंग, एम।, एट अल। "रोज़ विदाउट प्रिकल: नमी के अनुकूलन से जुड़े जीनोमिक इनसाइट्स"राष्ट्रीय विज्ञान समीक्षा, 2021;, NWAB092।