थोकित अलग -अलग विश्लेषण
सेवा लाभ
ताकगी एट अल।, द प्लांट जर्नल, 2013
● सटीक स्थानीयकरण: पृष्ठभूमि के शोर को कम करने के लिए 30+30 से 200+200 व्यक्तियों के साथ बल्क मिश्रण; गैर-पर्यायवाची उत्परिवर्ती-आधारित उम्मीदवार क्षेत्र की भविष्यवाणी।
● व्यापक विश्लेषण: एनआर, स्विसप्रोट, गो, केग, कोग, कोग, आदि सहित गहन उम्मीदवार जीन फ़ंक्शन एनोटेशन।
● तेजी से टर्नअराउंड समय: 45 कार्य दिवसों के भीतर तेजी से जीन स्थानीयकरण।
● व्यापक अनुभव: बीएमके ने हजारों लक्षणों में योगदान दिया है, जो फसलों, जलीय उत्पादों, जंगल, फूलों, फल, आदि जैसी विविध प्रजातियों को कवर करते हैं।
सेवा विनिर्देश
जनसंख्या:
फेनोटाइप्स के विरोध के साथ माता -पिता की संतान को अलग करना।
जैसे F2 संतान, बैकक्रॉसिंग (BC), पुनः संयोजक इनब्रेड लाइन (RIL)
मिक्सिंग पूल
गुणात्मक लक्षणों के लिए: 30 से 50 व्यक्तियों (न्यूनतम 20)/बल्क
मात्रात्मक ट्रैटिस के लिए: पूरी आबादी में चरम फेनोटाइप्स के साथ शीर्ष 5% से 10% व्यक्तियों (न्यूनतम 30+30)।
अनुशंसित अनुक्रमण गहराई
कम से कम 20x/माता -पिता और 1x/संतान व्यक्तिगत (जैसे कि 30+30 व्यक्तिगत के संतान मिश्रण पूल के लिए, अनुक्रमण गहराई 30x प्रति बल्क होगा)
जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण
● संपूर्ण जीनोम पुनर्वास
● डेटा प्रोसेसिंग
● एसएनपी/इंडेल कॉलिंग
● उम्मीदवार क्षेत्र स्क्रीनिंग
● उम्मीदवार जीन फ़ंक्शन एनोटेशन
नमूना आवश्यकताएँ और वितरण
नमूना आवश्यकताएं:
न्यूक्लियोटाइड्स:
| जीडीएनए नमूना | ऊतक का नमूना |
| एकाग्रता:/30 एनजी/μl | पौधे: 1-2 ग्राम |
| राशि: μ2 μg (volumn μ15 μL) | जानवर: 0.5-1 ग्राम |
| शुद्धता: OD260/280 = 1.6-2.5 | संपूर्ण रक्त: 1.5 एमएल |
सेवा कार्य प्रवाह
प्रयोग अभिप्राय
नमूना वितरण
आरएनए निष्कर्षण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
बिक्री के बाद सेवाएं
1. उम्मीदवार क्षेत्र की पहचान करने के लिए यूक्लिडियन दूरी (ईडी) पर विश्लेषण विश्लेषण। निम्नलिखित आकृति में
एक्स-अक्ष: गुणसूत्र संख्या; प्रत्येक डॉट एक एसएनपी के एक एड मान का प्रतिनिधित्व करता है। काली रेखा फिट किए गए ED मान के अनुरूप है। एक उच्च ईडी मान साइट और फेनोटाइप के बीच अधिक महत्वपूर्ण संबंध को इंगित करता है। रेड डैश लाइन महत्वपूर्ण एसोसिएशन की दहलीज का प्रतिनिधित्व करती है।
2. एसएनपी-इंडेक्स के आधार पर कोई भी विश्लेषण नहीं
एक्स-अक्ष: गुणसूत्र संख्या; प्रत्येक डॉट एसएनपी-इंडेक्स मान का प्रतिनिधित्व करता है। ब्लैक लाइन फिटेड एसएनपी-इंडेक्स वैल्यू के लिए खड़ा है। मूल्य जितना बड़ा होगा, एसोसिएशन उतना ही महत्वपूर्ण होगा।
बीएमके केस
प्रमुख-प्रभाव मात्रात्मक विशेषता लोकस FNL7.1 एक देर से भ्रूणजनन प्रचुर मात्रा में प्रोटीन को एनकोड करता है
प्रकाशित: संयंत्र जैव प्रौद्योगिकी पत्रिका, 2020
अनुक्रमण रणनीति:
माता-पिता (JIN5-508, YN): 34 × और 20 × के लिए पूरे जीनोम पुनर्वास।
डीएनए पूल (50 लंबी गर्दन और 50 शॉर्ट-नेक्ड): 61 × और 52 × के लिए पुनर्वास
प्रमुख परिणाम
इस अध्ययन में, अलग-अलग आबादी (F2 और F2: 3) को लंबी गर्दन वाले ककड़ी लाइन JIN5-508 और शॉर्ट-नेक Yn को पार करके उत्पन्न किया गया था। दो डीएनए पूल का निर्माण 50 चरम लंबी गर्दन वाले व्यक्तियों और 50 चरम शॉर्ट-नेक व्यक्तियों द्वारा किया गया था। बीएसए विश्लेषण और पारंपरिक क्यूटीएल मैपिंग द्वारा CHR07 पर प्रमुख-प्रभाव क्यूटीएल की पहचान की गई थी। उम्मीदवार क्षेत्र को ठीक-मेधावी, जीन अभिव्यक्ति परिमाणीकरण और ट्रांसजेनिक प्रयोगों द्वारा और अधिक संकुचित किया गया था, जिसने गर्दन-लंबाई, CSFNL7.1 को नियंत्रित करने में प्रमुख जीन का पता लगाया। इसके अलावा, CSFNL7.1 प्रमोटर क्षेत्र में बहुरूपता इसी अभिव्यक्ति के साथ जुड़ा हुआ पाया गया। आगे Phylogenetic विश्लेषण ने सुझाव दिया कि FNL7.1 Locus भारत से उत्पन्न होने की बहुत संभावना है।
 ककड़ी गर्दन की लंबाई से जुड़े उम्मीदवार क्षेत्र की पहचान करने के लिए बीएसए विश्लेषण में क्यूटीएल-मैपिंग |  Cucumber गर्दन-लंबाई QTL के LOD प्रोफाइल CHR07 पर पहचाने गए |
जू, एक्स।, एट अल। "प्रमुख-प्रभाव मात्रात्मक विशेषता लोकस FNL7.1 एक देर से भ्रूणजनन प्रचुर मात्रा में प्रोटीन को ककड़ी में फलों की गर्दन की लंबाई के साथ जुड़ा हुआ है।" प्लांट बायोटेक्नोलॉजी जर्नल 18.7 (2020)।
