डे नोवो बैक्टीरियल जीनोम असेंबली
हम 0 अंतराल की गारंटी देते हुए एक पूर्ण बैक्टीरियल जीनोम असेंबली सेवा प्रदान करते हैं। यह लंबे समय से पढ़े जाने वाले अनुक्रमण तकनीकों को एकीकृत करके संभव है, जैसे कि असेंबली के लिए नैनोपोर और पैकबियो और ओन्ट्स रीड्स के असेंबली सत्यापन और त्रुटि सुधार के लिए इलुमिना के साथ लघु-पढ़ने के अनुक्रमण। हमारी सेवा असेंबली, कार्यात्मक एनोटेशन और उन्नत जैव सूचनात्मक विश्लेषण से पूर्ण जैव सूचनात्मक वर्कफ़्लो प्रदान करती है, विशिष्ट अनुसंधान लक्ष्यों को पूरा करती है। यह सेवा विभिन्न आनुवंशिक और जीनोमिक अध्ययनों के लिए सटीक संदर्भ जीनोम के विकास को सक्षम करती है। इसके अतिरिक्त, यह वैज्ञानिक अंतर्दृष्टि और बायोटेक्नोलॉजिकल इनोवेशन को आगे बढ़ाने के लिए विश्वसनीय और अंतराल-मुक्त जीनोमिक डेटा महत्वपूर्ण सुनिश्चित करने के लिए तनाव अनुकूलन, आनुवंशिक इंजीनियरिंग और माइक्रोबियल प्रौद्योगिकी विकास जैसे अनुप्रयोगों के लिए आधार बनाता है।
सेवा सुविधाएँ
● जीनोम पूर्णता की वांछित डिग्री के आधार पर चुनने के लिए दो संभावित विकल्पों के साथ।
● ड्राफ्ट जीनोम विकल्प: Illumina Novaseq PE150 के साथ शॉर्ट-रीड अनुक्रमण।
● पूरा 0 गैप जीनोम।
● जीनोम असेंबली के लिए नैनोपोर प्रोमेथियन 48 या पैसबियो रेवियो पर लंबे समय से पढ़ें।
● जीनोम सत्यापन और त्रुटि सुधार (नैनोपोर) के लिए इलुमिना नोवसेक पर शॉर्ट-रीड सीक्वेंसिंग या ड्राफ्ट जीनोम उत्पन्न करने के लिए।
सेवा लाभ
●शून्य-अंतराल जीनोम गारंटीकृत: यह लंबे समय तक पढ़ने के अनुक्रमण (नैनोपोर या पैकबियो) के साथ इलुमिना अनुक्रमण के एकीकरण के कारण है।
●पूरा बायोइनफॉरमैटिक्स वर्कफ़्लो:इसमें जीनोम असेंबली और कई जीनोमिक तत्वों की भविष्यवाणी, कार्यात्मक जीन एनोटेशन, और जीनोम विज़ुअलाइज़ेशन जैसे सर्कोस प्लॉट शामिल हैं।
●व्यापक विशेषज्ञता: 20,000 से अधिक माइक्रोबियल जीनोम इकट्ठे हुए, BMKGene एक दशक से अधिक का अनुभव, एक उच्च कुशल विश्लेषण टीम, व्यापक सामग्री और उत्कृष्ट पोस्ट-बिक्री समर्थन लाता है।
●बिक्री के बाद का समर्थन:हमारी प्रतिबद्धता 3 महीने की बिक्री के बाद सेवा अवधि के साथ परियोजना के पूरा होने से परे है। इस समय के दौरान, हम परिणामों से संबंधित किसी भी प्रश्न को संबोधित करने के लिए प्रोजेक्ट फॉलो-अप, समस्या निवारण सहायता और प्रश्नोत्तर सत्र प्रदान करते हैं।
●कई अनुक्रमण रणनीतियाँ उपलब्ध हैं:विभिन्न अनुसंधान लक्ष्यों और जीनोम पूर्णता की आवश्यकताओं के लिए।
सेवा विनिर्देश
| सेवा | अनुक्रमण रणनीति |
| मसौदा जीनोम | इलुमिना PE150 100x |
| 0 गैप जीनोम | नैनोपोर 100x + इलुमिना PE150 100x Or PACBIO HIFI 30X + ILLUMINA PE150 100X (वैकल्पिक) |
नमूना आवश्यकताएं:
| एकाग्रता (एनजी/) एल) | कुल राशि () g) | वॉल्यूम ()L) | OD260/280 | OD260/230 | |
| पैकबियो | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| नैनोपोर | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| Illumina | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· बैक्टीरिया: .53.5x1010 कोशिकाओं
सेवा कार्य प्रवाह
नमूना वितरण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
बिक्री के बाद सेवाएं
निम्नलिखित विश्लेषण शामिल है:
● अनुक्रमण डेटा गुणवत्ता नियंत्रण
● जीनोम असेंबली
● जीनोम घटक विश्लेषण: सीडी और कई जीनोमिक तत्वों की भविष्यवाणी
● कई सामान्य डेटाबेस (GO, KEGG, आदि) और उन्नत डेटाबेस (कार्ड, VFDB, आदि) के साथ कार्यात्मक एनोटेशन
● जीनोम विज़ुअलाइज़ेशन
हम एक आसानी से सुलभ FASTA प्रारूप और जीनोम एनोटेशन फ़ाइल (GFF) में जीनोम प्रदान करते हैं।
जीन एनोटेशन - जाओ
जीन एनोटेशन - CAZY कार्बोहाइड्रेट
जीनोम विज़ुअलाइज़ेशन - सर्कोस प्लॉट
प्रकाशनों के एक क्यूरेटेड संग्रह के माध्यम से BMKGENE की बैक्टीरियल जीनोम असेंबली सेवाओं द्वारा सुविधा प्रदान की गई प्रगति का अन्वेषण करें।
दाई, डब्ल्यू। एट अल। ।इंटरनेशनल जर्नल ऑफ मॉलिक्यूलर साइंसेज, 24 (19), पी। 14669। DOI: 10.3390/IJMS241914669/S1।
कांग, क्यू। एट अल। (2021) 'मल्टीड्रग-रेसिस्टेंट प्रोटियस मिराबिलिस चीन में वन्यजीवों से ब्लॉक्सा -1 और ब्लैंडम -1 ले जाने वाले आइसोलेट्स: पब्लिक हेल्थ रिस्क में वृद्धि,',एकीकृत जूलॉजी, 16 (6), पीपी। 798-809। doi: 10.1111/1749-4877.12510।
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