Pūnaewele Kū'ē Rna Sencening
Nā hiʻohiʻona
● Ke hoʻoiho neiʻo RNA sample i ka hana rrna i ukaliʻia e ka mākaukauʻo RNA i ka hoʻomākaukauʻana i ka hale kūʻai.
● Nā Manaʻo BiintoChetic ma muli o ke kuleana i kahiʻano e pili ana iā Genome
● E hoʻopaʻa ana ka loiloi i keʻano o ka hana a me nā degs akā hana hou a me ka loiloi srna
Loaʻa nā lawelawe lawelawe
●ʻO ka mana kūpono: Ua hoʻokō mākou i nā wahi hoʻokele waiwai ma waena o nā wahi āpau, mai ka papa kūʻai a me nā hale kūʻai hale a me Biinforming. Ke hōʻoia nei kēia meticulous e hōʻoia i ka hāʻawiʻana i nā hopena kiʻekiʻe kiʻekiʻe.
●Nāʻikepili Scand-SEQUNCING SEQUNING: Ma muli o ka hoʻomākaukauʻana o RNA i ka papa inoa o RNA i ke kuhikuhi
●ʻO ka nānāʻana i ka loiloi pihaʻana i nā mea kākau'ōlelo procharyotic:ʻO ka piko bioInmetic e pili ana i ka nānāʻana i ka hōʻike o ka genentis a me ka nānāʻana o keʻano transcript Aia pū me ka loiloi o Srnas, ka inoa inoa inoa inoa a me ka wānana a me ka wānana o ka hoʻonohonohoʻana i ka lua a me nā pahuhopu.
●Kākoʻo kākoʻo: Ke hoʻonui nei kā mākou hana i waho ma mua o ka hoʻopauʻana i kahi papa hana me kahi 3-mahina ma hope o ka lawelawe lawelawe. I kēia manawa, hāʻawi aku mākou i nā hana hahai, a me nā manaʻo e hoʻopiʻiʻia i kōkua, a me ke kau e pili ana i nā noi.
Nā koi koi a me ka laweʻana
| Puka Hanau | Serenencing hoʻolālā | Ua'ōleloʻia nāʻikepili | Honua mālamalama |
| Ua loaʻa iā Rrna i kahi waihona waihona | Hoʻomālamalama pe150 | 1-2 GB | Q30≥85% |
Nā Manaʻo Manaʻo:
| SCA. (NG / μl) | Ka nui (μg) | ʻO Menu ka hoʻomaʻemaʻe | Huakai |
| ≥ 50 | ≥ 1 | Od260 / 280 = 1.8-2.0 Od260 / 230 = 1.0-2.5 Palenaʻole aʻaʻohe protein a iʻole dna conceation i hōʻikeʻia ma ka gel. | Rin≥6.5 |
Hōʻikeʻia ka hoʻounaʻana
Nā pahu: 2 ML Cetrifuge Tube (Tin Foilʻaʻole i aʻoʻia)
Sample Labelning: Kumupa + Ka Hoʻolau'Awele iā A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Hoʻouna:
1.ʻO ka maloʻo maloʻo: Pono nā specles i hoʻopaʻaʻia i nāʻeke a kanuʻia ma ka maloʻo maloʻo.
2. E hiki ke maloʻo nā tubes: Hiki ke maloʻoʻo RNA i ka smabillization rena ma rna stabillization (e like me rnastable®)
E holo ka lawelawe lawelawe
Nā Hoʻounaʻana
Hana ka waihona puke
Hoahewa ana
Nāʻikepiliʻikepili
Ma hope o nā lawelawe kūʻai
ʻO ka papa inoaʻo Bioinia Pool.
Komo i ka loiloi ma lalo nei:
● Ke Kahu Pūnaewele Pūnaewele
● Alvingnment i ka'ōlelo a Genome
● Ka Waihona Pūnaewele Pūnaewele: RNA FACEGMESATION REMENTYTY, hoʻokomo i ka nui a me ka suenuncing Saturation
● Hoʻomoe i kahi annotation o nā coding codes
● Nā hōʻike hōʻike hōʻike: hoʻoponopono a me keʻano nui o ka helu helu (PCA)
●ʻO keʻano hana likeʻole (degs)
● Hoʻomoe i ka hana a me ka hoʻonuiʻana o nā degs
_
● Kālepili Kūlana Kūlana: Nā Operaton, hoʻomaka a hoʻopau i nā kūlana, nā kūlana kūponoʻole (UTS)
Seequence saturation
Hana i kaʻaeʻana o nāʻano coding
Ka hoʻoponoponoʻana ma waena o nā hiʻohiʻona
Nā Kūlana Hoʻolaha (Degs) ka nānāʻana
Hana hana hoʻoikaika
srna annotation
Eʻimi i ka holomua o nā holomua e BMKGEN's Nanopore Full-LAND
Guan, cp et al. (2018) 'Global Transcriptome Changes of Biofilm-Forming Staphylococcus epidermidis Responding to Total Alkaloids of Sophorea alopecuroides',Pollish Quinea o Microboology, 67 (2), p. 223. Doi: 10.21307 / pjm-2018-024.
