ʻO BMKMANU S3000_spatial e kākau nei
ʻO BMKMANU S3000 Spatial Scatial TranspTome Technical Score
Nā hiʻohiʻona
- hoʻoholo: 3.5 μM
- Spot Diameter: 2.5 μM
- Ka helu o nā wahi: e like me 4 miliona
- 3 Hiki i nā'āpana āpau: 6.8 mm * 6.8 mm, 11 mm * 11 mm * 20 mm * 20 mm * 20 mm * 20 mm * 20 mm *
- E hoʻoukaʻia kēlā me kēia bead barcoded me nā kumu mua i hoʻohuiʻia i 4 mau'āpana:
• Nā Poly (DT) hulina no Mrna Prining a me CDNA Synthesis,
• Keʻano o nā mea kākau Molecular Molecular (UMI) e hoʻoponopono i nā bias amplification
• ka spatial Barcode
• Ke hoʻopaʻaʻana i ka māhele o ka māhele helu helu 1 SEQENENCING FIRIME
- H & e a a me ka fluerescent e nānā ana i nā'āpana
- hiki ke hoʻohana i kaʻenehana Segmentation Segmentation: Hoʻohuiʻana o ka H & E nānā ana, e noʻonoʻo ana i nā palena o kēlā me kēia cell. Ke hoʻoiho nei i ka loiloi spitional Spitial Spitional Spilus e pili ana i keʻano o ka bin bin.
- Hiki iā ia ke hoʻokō i ka hoʻoponoponoʻana i ka multilevel
Loaʻa iā BMKMANU S3000
-Kānalua o ka hopuʻana i nā wahi hopu i ka 4 miliona: me kahi hopena i hoʻomaikaʻiʻia o 3.5 Um, e alakaʻi ana i ke kiʻekiʻe kiʻekiʻe a me Umi kaʻikeʻana i kēlā me kēia cell. Hōʻike kēia mau hopena i ka hoʻomaikaʻiʻana o nā clute o nā cell e pili ana i nā kiʻi kope o nā palapala kākauʻana, me nā kiko'ī kiko'ī e pili ana i keʻano o ka hoʻopiliʻana i nāʻano kiko'ī.
- ka hoʻoholoʻana o ka celbular:ʻO kēlā me kēia wahi i hoʻopiliʻia> 2 miliona mau pahu spatial barcoded me kahi'āpana o ka helu o ka helu o ka schools.
-ʻO ka hoʻonuiʻana i ka hopena o ka hopena kiʻekiʻe:ʻO ka loiloiʻana i ka nui o ka loiloi nui-kiʻekiʻe mai 100 μm i ka 5 μm e hoʻoholo i nā hiʻohiʻona o nā mea hoʻonā maikaʻi loa.
-Hiki ke hoʻohana "ʻekolu i loko o hoʻokahi 'slidelelo" cegmenteationʻenehanaʻO ka hoʻohuiʻana i ka maʻi maʻi, H & E nānā, a me Rna Sequence ma kahi o nā palena o nā palena o ka cell.
-Kūpono me nā papa hana he nui:ʻO nā NGS a me ka lōʻihi o ka wikiwiki i loaʻa i ka serequing.
-Hoʻolālā ka hoʻolālā o 1-8 mau wahi paʻa: Ua loli ka nui o ka nui o ka hopuʻana, e hiki ai ke hoʻohana i 3 mau waihona (6.8 mm * 1 mm * 11 mm * 20 mm *
-ʻO ka lawelawe hoʻokahi: hoʻohui i nāʻike āpau a me nā mea akamai a me nā loiloi, e komo pū me ka crodo
-ʻO nā bioin a me nā mea hoʻohana a me nā mea hoʻohanaʻole-hoʻohanaʻoleʻia o nā hopena:Hoʻokomoʻia ka pā i ka 29 mau loiloi a me 100+ mau kiʻi kiʻekiʻe, hoʻohuiʻia me ka hoʻohanaʻana i ka polokalamu i hoʻomohalaʻia a hoʻonohonoho i ka clustering clultering a me nā clustering clustering.
-ʻO ka nānāʻana i kaʻikeʻikepili a me kaʻike: Loaʻa no nā noi noiʻi'ē aʻe
-ʻO ka hui akamai akamai akamai: Me kaʻike ma luna o 250 mau hua'ōlelo a me 100+ mauʻanoʻelua e pili ana i ke kanaka, ka mea kanu a me nā mea kanu.
-ʻO nā mea hou i hoʻonuiʻia ma ka papahana holoʻokoʻa: Me ka mana piha o ka holomua hoʻokolohua.
-Ke kohoʻana i ka loiloi hoʻololiʻana me keʻano hoʻokahi-cell mrna seequing
Nāʻikepili lawelawe
| Nā koi koi | Puka Hanau | Serenencing hoʻolālā | Ua'ōleloʻia nāʻikepili | Honua mālamalama |
| ʻO Octi-Entbed Cryo i nā hiʻohiʻona (Opmet Coimeter: approx. 6 × 0 × 6 × 6 mm³) 2 mau poloka i kēlā me kēia hoʻohālike 1 no ka hoʻokolohua, 1 no ka hoʻihoʻi | S3000 CDNA waihona | Hoʻomālamalama pe150 | ʻO 160K PE e loaʻa i kēlā me kēia 100υM (250 GB) | Rin> 7 |
No nā kiko'ī hou aku ma nā kiko'ī o ka uku hoʻomākaukau a me ka lawelaweʻana, eʻoluʻolu e kamaʻilio e kamaʻilio meMele Kalikimaka
E holo ka lawelawe lawelawe
I ka papa hoʻomākaukau hoʻomākaukauʻana,ʻo kahi hoʻokolokolo koʻikoʻi RNA RNA RNA i hanaʻia e hōʻoia i ka loaʻaʻana o kahi kūlana kiʻekiʻe RNA. Ma keʻano o ka huiʻana i keʻano o nā'āpana i hoʻopaʻaʻia aʻikeʻia aʻikeʻia a me nā kūlana permeabilization no ka hoʻokuʻuʻana o ka tisna Kahiʻia ka protocol hoʻopailua hoʻokolokolo i ka wā no ka hoʻokumuʻana i ka Palapala waihona, ua hahaiʻia e keʻano noiʻi a me kaʻikeʻikepili.
ʻO ka hana lawelawe piha e pili ana i ka hana hou a me nā hōʻoia i nā mea kūʻai aku e mālama i kahi poma pane pane, e hōʻoia ana i ka hoʻokōʻana i nā hana hana.
Ua hōʻikeʻia kaʻikepili e ka poʻe e hoʻopiliʻia e BMKMANU S3000 e hoʻohana ana i ka polokalamu "BSTMATRIX" Mai laila, e hoʻonuiʻia kahi hōʻike maʻamau e loaʻa ana i ka mana o kaʻikeʻana i kaʻikepili i loko o ka loiloi inner-sample a me ka loiloi hui.
- Ka mana o kaʻikepili maikaʻi:
- Ka heluʻikepili a me ka helu helu helu helu
- E nānā i kēlā me kēia wahi
- Kiʻi komoʻo Kahi
- Ka loiloi Inner-Sample
- e waiwai nui
- nā mea uila, me ka hoʻohaʻahaʻaʻana i keʻano dimension
- ka hōʻikeʻana i ka hōʻike hōʻike likeʻole ma waena o nā clusters: kaʻikeʻana i nā gene
-ʻO ka hanaʻana i ka hana a me ka hoʻonuiʻana i nāʻano inoaʻo Marker
- Hoʻopilikia waena o ka hui
- E hui pū ana i nā wahi mai nā'āpanaʻelua (eg.
- kaʻikeʻana i nā mea kūʻai aku ma nā wahina o kēlā me kēia cluster
-ʻO ka hanaʻana i ka hana a me ka hoʻonuiʻana i nāʻano inoaʻo Marker
-ʻO ka hōʻikeʻokoʻa o ka cluster like ma waena o nā hui
Eia kekahi, ua hoʻomohalaʻia ka bmkgene "bstvionewer" he mea hana pilikino
Hāʻawiʻo BMKGEE i nā lawelawe SPECILIE SPECILIE ma ka hoʻoponoponoʻana i ke kikowaena hoʻokahi (e pili ana i ka cell bin a iʻole multilevel square
SPATIAL SPECILIE DATA mai nā'āpana Tissue ma luna o S3000 Slide Slide i hanaʻia ma lalo nei.
SUND Study 1: MIDE Brain
Ka heluʻana o kahi'āpana Brain Mouse me S3000 i hopena i kaʻikeʻana o ~ 94 000 mau a median ʻO ka hoʻonāʻana o ka hopena o 3.5 UM i hopena i kahi hui kiko'ī nui loa e pili ana i nā hiʻohiʻona o nā cell e pili ana i nā crall i hoʻololiʻia. Ua nānā maʻalahiʻia kēia e kaʻikeʻana i ka hoʻoiliʻana o nā cell i hoʻopiliʻia e like me nā onikdendrocytes a me nā microglia cell, kahi kokoke loa i ka hina
SUNG GONDS 2: MIE EMBRYO
Ka heluʻana o kahi'āpana o ka mouse embryo me S3000 i loaʻa i kaʻikeʻana o ~ 2200 000 ʻO ka hoʻonāʻana o ka hopena o ka 3.5 UM i hopena i kahi kiko'ī kiko'ī loa o nā cluters e pili ana i nā hiʻohiʻona o nā maka a me 28 mau clusters ma ka wahi o ka lolo.
I loko o ka hoʻopiliʻana i loko o ka cell cell
ʻO nā inoa inoa inoaʻo Mark Genes Accessistification a me ka hoʻokaʻawaleʻana:
-ʻO ka hoʻoholoʻana o ka sub-cebular: hoʻohālikelikeʻia me ka s1000 slide, i kēlā me kēia wahi o S3000 ma waena o ka helu School. (Square Bin: 3.5 μM).
- EXPEDIT kiʻekiʻe: Hoʻohālikelikeʻia me S1000 Slide Slide, Median_umi hoʻonui mai ka 30% a me 7% a me 60%
Scheme o S1000 Chip:
Scheme o S3000 chip:
