10x genoms storium scatial transpletome
Hana pāhana
Nā hiʻohiʻona
● Hoʻomalu: 100 μm
● wahi a Soleter: 55 μm
● Helu o nā Spots: 4992
● Hoʻokuʻuʻia: 6.5 x 6.5 mm
● Hoʻomoeʻia kēlā me kēia wahi i kauʻia me nā primers i hoʻohuiʻia i 4 mau'āpana:
- Poly (dt) kaʻe no ka prna phiping a me CDNA Synthesis
- UNIQIE Molecular Molecular (UMI) e hoʻoponopono i nā bias amplification
- ka spatial Barcode
- Kāohi i keʻano o ka helu helu helu 1 spequingcing primer
● H & E nānā i nā'āpana
Loaʻa
●ʻO ka lawelawe hoʻokahi: Hoʻohui i nāʻike a me nā hana a me nā mākaukau, e komo pū me ka cryo
● GRAFICIC SIVICInical hui: Me kaʻike ma luna o 250 mau hua'ōlelo a me 100+ mauʻanoʻelua e pili ana i ke kanaka, ka mea kanu a me nā mea kanu.
●ʻO ka hoʻoponopono maoliʻana i ka hana holoʻokoʻa: Me ka mana piha o ka holomua hoʻokolohua.
●Nā Kūlana Kūʻai Kūʻai Kūʻai Nui:ʻO ka pākaukau i ka wā 29 nā loiloi a me 100+ mau kiʻi kiʻekiʻe kiʻekiʻe.
●ʻO ka nānāʻana i kaʻikeʻikepili a me kaʻike: loaʻa no nā noi noiʻi'ē aʻe.
●Ke kohoʻana i ka loiloi hoʻololiʻana me keʻano hoʻokahi-cell mrna seequing
Nā kiko'ī
| Nā koi koi | Puka Hanau | Serenencing hoʻolālā | Ua'ōleloʻia nāʻikepili | Honua mālamalama |
| ʻO Octi-Entbed Cryo i nā hiʻohiʻona (Optomital Diameter: kokoke. 6x6x6 MM³) 2 mau poloka i kēlā me kēia hoʻohālike | 10x kiʻi waihona cdnadna | Hoʻomālamalama pe150 | E heluheluʻo 50k pe i kēlā me kēia wahi (60GB) | Rin> 7 |
No nā kiko'ī hou aku ma nā kiko'ī o ka uku hoʻomākaukau a me ka lawelaweʻana, eʻoluʻolu e kamaʻilio e kamaʻilio meMele Kalikimaka
Haʻawina lawelawe
I ka papa hoʻomākaukau hoʻomākaukauʻana,ʻo kahi hoʻokolokolo koʻikoʻi RNA RNA RNA i hanaʻia e hōʻoia i ka loaʻaʻana o kahi kūlana kiʻekiʻe RNA. Ma keʻano o ka huiʻana i keʻano o nā'āpana i hoʻopaʻaʻia aʻikeʻia aʻikeʻia a me nā kūlana permeabilization no ka hoʻokuʻuʻana o ka tisna Kahiʻia ka protocol hoʻopailua hoʻokolokolo i ka wā no ka hoʻokumuʻana i ka Palapala waihona, ua hahaiʻia e keʻano noiʻi a me kaʻikeʻikepili.
ʻO ka hana lawelawe piha e pili ana i ka hana hou a me nā hōʻoia i nā mea kūʻai aku e mālama i kahi poma pane pane, e hōʻoia ana i ka hoʻokōʻana i nā hana hana.
Komo i ka loiloi ma lalo nei:
Pūnaewele Pūnaewele:
o Ka heluʻikepili a me ka helu helu helu helu
o ka mea e nānā ai i kēlā me kēia wahi
o Tissue Coverage
Inner-sample ka loiloi:
o Gene fashivy
o ka clustering slustering, me ka hoʻohaʻahaʻaʻana i ka hōʻike dimension
o nā hōʻike hōʻikeʻokoʻa ma waena o nā clusters
o ka hana hana hana a me ka hoʻonuiʻana i nāʻano mele
Ka loiloi hui waena
o Re-hui hui o nā wahi mai nā'āpanaʻelua (eg.
o Kaʻikeʻana i nā inoa inoa inoa no kēlā me kēia cluster
o ka hana hana hana a me ka hoʻonuiʻana i nāʻano mele
o ka hōʻikeʻokoʻa o ka cluster like ma waena o nā hui
Inner-sample ka loiloi
Streas clustering
ʻO nā inoa inoaʻo Mark Gence e hoʻomaopopo a me ka hoʻokaʻawale spatial
Ka loiloi hui waena
Hui pūʻikepili mai nā huiʻelua a me nā mea hou
ʻO nā hua'ōlelo he nui o nā pua hou
Eʻimi i nā mea holomua i hoʻonuiʻia e BMKGENT SPATIALS i ka lawelaweʻana i ka lawelawe ma ka 10x Visi nui i kēia mau hōʻike hōʻikeʻia:
Chen, d. et al. )Nā hana o ka lāhui aupuni o nāʻepekema oʻAmelika Hui PūʻIa oʻAmelika Hui PūʻIa, 120 (30), p. E2303462120. Doi: /10.1073/Pnas.2303462120
Chen, y. et al. (2023) 'ʻO ka Steel e hana i ka palena kiʻekiʻe o ka hopena kiʻekiʻe o SpatiotemPhiter i unuhiʻia i kaʻikepili'.Nā pōkole ma bioinformatics, 24 (2), PP. 1-10. Doi: 10.1093 / BIB / BBAD068.
Liu, C. Et al. (2022)ʻO nā noiʻi nulela, 50 (17), pp. 9724-9737. Doi: 10.1093 / THA / Gkac773.
Wang, j. et al. (2023) 'E hoʻohui i nā mea i kākau inoaʻia a me keʻano o ka sma dequence e hōʻike ai i nā hoʻolālā o nā mea hana noturtineNā leka uila o ka honua holoʻokoʻa, 19 (8), pp. 2515-22030. Doi: 10.7150 / IJBS.83510.
