રિડ્યુસ્ડ રિપ્રેઝન્ટેશન બિસલ્ફાઇટ સિક્વન્સિંગ (RRBS)
રિડ્યુસ્ડ રિપ્રેઝન્ટેશન બિસલ્ફાઇટ સિક્વન્સિંગ (RRBS) ડીએનએ મેથિલેશન સંશોધનમાં હોલ જીનોમ બિસલ્ફાઇટ સિક્વન્સિંગ (WGBS) ના ખર્ચ-અસરકારક અને કાર્યક્ષમ વિકલ્પ તરીકે ઉભરી આવ્યું છે. જ્યારે WGBS સમગ્ર જીનોમને સિંગલ બેઝ રિઝોલ્યુશન પર તપાસીને વ્યાપક આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે, ત્યારે તેની ઊંચી કિંમત મર્યાદિત પરિબળ બની શકે છે. RRBS વ્યૂહાત્મક રીતે જીનોમના પ્રતિનિધિ ભાગનું પસંદગીપૂર્વક વિશ્લેષણ કરીને આ પડકારને ઓછો કરે છે. આ પદ્ધતિ MspI ક્લીવેજ દ્વારા CpG ટાપુ-સમૃદ્ધ પ્રદેશોના સંવર્ધન પર આધાર રાખે છે અને ત્યારબાદ 200-500/600 bps ટુકડાઓના કદની પસંદગી દ્વારા. પરિણામે, માત્ર CpG ટાપુઓની નજીકના વિસ્તારોને અનુક્રમિત કરવામાં આવે છે, જ્યારે દૂરના CpG ટાપુઓ ધરાવતા વિસ્તારોને વિશ્લેષણમાંથી બાકાત રાખવામાં આવે છે. આ પ્રક્રિયા, બાયસલ્ફાઇટ સિક્વન્સિંગ સાથે જોડાયેલી, ડીએનએ મેથિલેશનની ઉચ્ચ-રિઝોલ્યુશન શોધ માટે પરવાનગી આપે છે, અને સિક્વન્સિંગ અભિગમ, PE150, ખાસ કરીને મધ્યને બદલે ઇન્સર્ટ્સના છેડા પર ધ્યાન કેન્દ્રિત કરે છે, જે મેથિલેશન પ્રોફાઇલિંગની કાર્યક્ષમતામાં વધારો કરે છે. આરઆરબીએસ એ એક અમૂલ્ય સાધન છે જે ખર્ચ-અસરકારક ડીએનએ મેથિલેશન સંશોધનને સક્ષમ કરે છે અને એપિજેનેટિક મિકેનિઝમ્સના જ્ઞાનને આગળ ધપાવે છે.
સેવા સુવિધાઓ
● સંદર્ભ જીનોમ જરૂરી છે.
● લેમ્બડા ડીએનએનો ઉપયોગ બાયસલ્ફાઇટ રૂપાંતરણ કાર્યક્ષમતાને મોનિટર કરવા માટે થાય છે.
● MspI પાચન કાર્યક્ષમતાનું પણ નિરીક્ષણ કરવામાં આવે છે.
● છોડના નમૂનાઓ માટે ડબલ એન્ઝાઇમ પાચન.
● Illumina NovaSeq પર સિક્વન્સિંગ.
સેવા લાભો
●WGBS માટે ખર્ચ-અસરકારક અને કાર્યક્ષમ વિકલ્પ: ઓછા ખર્ચે અને ઓછા નમૂનાની જરૂરિયાતો સાથે વિશ્લેષણને સક્ષમ કરવું.
●પૂર્ણ પ્લેટફોર્મ:સેમ્પલ પ્રોસેસિંગ, લાઇબ્રેરી કન્સ્ટ્રક્શન અને સિક્વન્સિંગથી લઈને બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ એનાલિસિસ સુધી વન-સ્ટોપ ઉત્તમ સેવા પ્રદાન કરે છે.
●વ્યાપક નિપુણતા: આરઆરબીએસ સિક્વન્સિંગ પ્રોજેક્ટ્સ વિવિધ પ્રજાતિઓની વિવિધ શ્રેણીમાં સફળતાપૂર્વક પૂર્ણ થયા સાથે, BMKGENE એક દાયકાથી વધુનો અનુભવ, ઉચ્ચ કુશળ વિશ્લેષણ ટીમ, વ્યાપક સામગ્રી અને વેચાણ પછી ઉત્તમ સપોર્ટ લાવે છે.
સેવા વિશિષ્ટતાઓ
| પુસ્તકાલય | સિક્વન્સિંગ વ્યૂહરચના | ભલામણ કરેલ ડેટા આઉટપુટ | ગુણવત્તા નિયંત્રણ |
| MspI ડાયજેસ્ટેડ અને બિસલ્ફાઇટ ટ્રીટેડ લાઇબ્રેરી | ઇલુમિના PE150 | 8 જીબી | Q30 ≥ 85% બાયસલ્ફાઇટ રૂપાંતરણ > 99% MspI કટીંગ કાર્યક્ષમતા > 95% |
નમૂના જરૂરીયાતો
| એકાગ્રતા (ng/µL) | કુલ રકમ (µg) |
| |
| જીનોમિક ડીએનએ | ≥ 30 | ≥ 1 | મર્યાદિત અધોગતિ અથવા દૂષણ |
સેવા કાર્ય પ્રવાહ
નમૂના વિતરણ
પુસ્તકાલય બાંધકામ
સિક્વન્સિંગ
ડેટા વિશ્લેષણ
વેચાણ પછીની સેવાઓ
નીચેના વિશ્લેષણનો સમાવેશ થાય છે:
● કાચો સિક્વન્સિંગ ગુણવત્તા નિયંત્રણ;
● સંદર્ભ જીનોમ માટે મેપિંગ;
● 5mC મેથિલેટેડ પાયાની શોધ અને મોટિફ ઓળખ;
● મેથાઈલેશન વિતરણ અને નમૂના સરખામણીનું વિશ્લેષણ;
● વિભેદક રીતે મેથિલેટેડ પ્રદેશો (ડીએમઆર) નું વિશ્લેષણ;
● DMR સાથે સંકળાયેલ જનીનોની કાર્યાત્મક ટીકા.
ગુણવત્તા નિયંત્રણ: પાચન કાર્યક્ષમતા (જીનોમ મેપિંગમાં)
ગુણવત્તા નિયંત્રણ: બાયસલ્ફાઇટ રૂપાંતરણ (મેથિલેશન માહિતી નિષ્કર્ષણમાં)
મેથિલેશન મેપ: 5mC મેથિલેશન જીનોમ-વ્યાપી વિતરણ
નમૂના સરખામણી: મુખ્ય ઘટક વિશ્લેષણ
વિભેદક રીતે મેથિલેટેડ પ્રદેશો (DMRs) વિશ્લેષણ: હીટમેપ
પ્રકાશનોના ક્યુરેટેડ સંગ્રહ દ્વારા BMKGene ની આખી જીનોમ બાયસલ્ફાઇટ સિક્વન્સિંગ સેવાઓ દ્વારા સુવિધા આપવામાં આવેલ સંશોધન પ્રગતિઓનું અન્વેષણ કરો.
લી, ઝેડ એટ અલ. (2022) 'CRISPR એક્ટિવેશન અને પેરાક્રિન ફેક્ટર્સ દ્વારા લેડિગ જેવા કોષોમાં હાઇ-ફિડેલિટી રિપ્રોગ્રામિંગ',PNAS નેક્સસ, 1(4). doi: 10.1093/PNASNEXUS/PGAC179.
ટિયાન, એચ. એટ અલ. (2023) 'ચીની મોનોઝાયગોટિક ટ્વિન્સમાં શરીરની રચનાનું જીનોમ-વાઇડ ડીએનએ મેથિલેશન વિશ્લેષણ',યુરોપિયન જર્નલ ઑફ ક્લિનિકલ ઇન્વેસ્ટિગેશન, 53(11), પૃષ્ઠ. e14055. doi: 10.1111/ECI.14055.
વુ, વાય. એટ અલ. (2022) 'ડીએનએ મેથિલેશન અને કમર-થી-હિપ રેશિયો: ચાઇનીઝ મોનોઝાયગોટિક ટ્વિન્સમાં એપિજેનોમ-વાઇડ એસોસિએશન અભ્યાસ',જર્નલ ઓફ એન્ડોક્રિનોલોજિકલ ઇન્વેસ્ટિગેશન, 45(12), પાના. 2365–2376. doi: 10.1007/S40618-022-01878-4.
