-
BMKMANU S3000_Spatial Transscriptome
અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ વૈજ્ઞાનિક નવીનતામાં મોખરે છે, જે સંશોધકોને તેમના અવકાશી સંદર્ભને સાચવીને પેશીઓની અંદર જટિલ જનીન અભિવ્યક્તિની પેટર્ન શોધવા માટે સશક્તિકરણ કરે છે. વિવિધ પ્લેટફોર્મ્સ વચ્ચે, BMKGene એ BMKManu S3000 સ્પેશિયલ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ ચિપ વિકસાવી છે, જે 3.5µm નું ઉન્નત રિઝોલ્યુશન ધરાવે છે, સબસેલ્યુલર રેન્જ સુધી પહોંચે છે અને બહુ-સ્તરીય રિઝોલ્યુશન સેટિંગ્સને સક્ષમ કરે છે. S3000 ચિપ, આશરે 4 મિલિયન સ્પોટ્સ દર્શાવતી, અવકાશી રીતે બારકોડેડ કેપ્ચર પ્રોબ્સ સાથે લોડ થયેલ મણકા સાથે સ્તરવાળી માઇક્રોવેલનો ઉપયોગ કરે છે. અવકાશી બારકોડ્સથી સમૃદ્ધ એક cDNA લાઇબ્રેરી, S3000 ચિપમાંથી તૈયાર કરવામાં આવી છે અને ત્યારબાદ Illumina NovaSeq પ્લેટફોર્મ પર ક્રમબદ્ધ છે. અવકાશી રીતે બારકોડેડ નમૂનાઓ અને UMIsનું સંયોજન જનરેટ થયેલ ડેટાની ચોકસાઈ અને વિશિષ્ટતાની ખાતરી કરે છે. BMKManu S3000 ચિપ્સ અત્યંત સર્વતોમુખી છે, જે મલ્ટી-લેવલ રિઝોલ્યુશન સેટિંગ્સ ઓફર કરે છે જે વિવિધ પેશીઓ અને વિગતોના ઇચ્છિત સ્તરો સાથે બારીક રીતે ટ્યુન કરી શકાય છે. આ અનુકૂલનક્ષમતા ન્યૂનતમ અવાજ સાથે ચોક્કસ અવકાશી ક્લસ્ટરિંગને સુનિશ્ચિત કરીને વિવિધ અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ અભ્યાસો માટે ઉત્કૃષ્ટ પસંદગી તરીકે ચિપને સ્થાન આપે છે. BMKManu S3000 સાથે સેલ સેગમેન્ટેશન ટેકનોલોજીનો ઉપયોગ કોષોની સીમાઓ સુધી ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ ડેટાના સીમાંકનને સક્ષમ કરે છે, જેના પરિણામે સીધો જૈવિક અર્થ હોય છે. વધુમાં, S3000 નું સુધારેલું રિઝોલ્યુશન કોષ દીઠ વધુ સંખ્યામાં જનીનો અને UMI શોધવામાં પરિણમે છે, જે અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્શન પેટર્ન અને કોષોના ક્લસ્ટરિંગનું વધુ સચોટ વિશ્લેષણ સક્ષમ કરે છે.
-
સિંગલ- ન્યુક્લી આરએનએ સિક્વન્સિંગ
સિંગલ-સેલ કેપ્ચર અને કસ્ટમ લાઇબ્રેરી બાંધકામ તકનીકોના વિકાસ, ઉચ્ચ-થ્રુપુટ સિક્વન્સિંગ સાથે, સેલ સ્તરે જનીન અભિવ્યક્તિ અભ્યાસમાં ક્રાંતિ લાવી છે. આ સફળતા તમામ કોષો પર સરેરાશ જનીન અભિવ્યક્તિ સાથે સંકળાયેલી મર્યાદાઓને દૂર કરીને જટિલ કોષોની વસ્તીના ઊંડા અને વધુ વ્યાપક પૃથ્થકરણ માટે પરવાનગી આપે છે અને આ વસ્તીમાં સાચી વિજાતીયતાને જાળવી રાખે છે. જ્યારે સિંગલ-સેલ આરએનએ સિક્વન્સિંગ (scRNA-seq) ના નિર્વિવાદ ફાયદા છે, તે ચોક્કસ પેશીઓમાં પડકારોનો સામનો કરે છે જ્યાં સિંગલ-સેલ સસ્પેન્શનનું નિર્માણ મુશ્કેલ સાબિત થાય છે અને તેને તાજા નમૂનાઓની જરૂર પડે છે. BMKGene ખાતે, અમે અત્યાધુનિક 10X જેનોમિક્સ ક્રોમિયમ ટેક્નોલોજીનો ઉપયોગ કરીને સિંગલ-ન્યુક્લિયસ RNA સિક્વન્સિંગ (snRNA-seq) ઓફર કરીને આ અવરોધને દૂર કરીએ છીએ. આ અભિગમ સિંગલ-સેલ સ્તરે ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ વિશ્લેષણ માટે સક્ષમ નમૂનાઓના સ્પેક્ટ્રમને વિસ્તૃત કરે છે.
ન્યુક્લીનું આઇસોલેશન નવીન 10X જીનોમિક્સ ક્રોમિયમ ચિપ દ્વારા પરિપૂર્ણ થાય છે, જેમાં ડબલ ક્રોસિંગ સાથે આઠ-ચેનલ માઇક્રોફ્લુઇડિક્સ સિસ્ટમ છે. આ સિસ્ટમની અંદર, બારકોડ્સ, પ્રાઇમર્સ, એન્ઝાઇમ્સ અને એક ન્યુક્લિયસને સમાવિષ્ટ જેલ બીડ્સ નેનોલિટર-કદના તેલના ટીપાંમાં સમાવિષ્ટ કરવામાં આવે છે, જે જેલ બીડ-ઇન-ઇમલ્સન (GEM) બનાવે છે. GEM ની રચના પછી, સેલ લિસિસ અને બારકોડ રિલીઝ દરેક GEM માં થાય છે. ત્યારબાદ, mRNA અણુઓ 10X બારકોડ્સ અને યુનિક મોલેક્યુલર આઇડેન્ટિફાયર (UMIs) ને સમાવિષ્ટ કરીને, cDNAs માં રિવર્સ ટ્રાન્સક્રિપ્શનમાંથી પસાર થાય છે. આ cDNAs પછી પ્રમાણભૂત અનુક્રમ લાઇબ્રેરી બાંધકામને આધિન કરવામાં આવે છે, જે સિંગલ-સેલ સ્તરે જનીન અભિવ્યક્તિ પ્રોફાઇલ્સના મજબૂત અને વ્યાપક સંશોધનની સુવિધા આપે છે.
પ્લેટફોર્મ: 10× જીનોમિક્સ ક્રોમિયમ અને ઈલુમિના નોવાસેક પ્લેટફોર્મ
-
10x જીનોમિક્સ વિઝિયમ સ્પેશિયલ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ
અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ એ એક અદ્યતન તકનીક છે જે સંશોધકોને તેમના અવકાશી સંદર્ભને સાચવીને પેશીઓની અંદર જનીન અભિવ્યક્તિ પેટર્નની તપાસ કરવાની મંજૂરી આપે છે. આ ડોમેનમાં એક શક્તિશાળી પ્લેટફોર્મ 10x જીનોમિક્સ વિઝિયમ છે જે ઇલુમિના સિક્વન્સિંગ સાથે જોડાયેલું છે. 10X વિઝિયમનો સિદ્ધાંત નિયુક્ત કેપ્ચર વિસ્તાર સાથે વિશિષ્ટ ચિપ પર રહેલો છે જ્યાં પેશી વિભાગો મૂકવામાં આવે છે. આ કેપ્ચર એરિયામાં બારકોડેડ સ્પોટ્સ હોય છે, જે પ્રત્યેક પેશીની અંદર એક અનન્ય અવકાશી સ્થાનને અનુરૂપ હોય છે. રિવર્સ ટ્રાંસ્ક્રિપ્શન પ્રક્રિયા દરમિયાન પેશીઓમાંથી કબજે કરેલા આરએનએ પરમાણુઓને પછી અનન્ય પરમાણુ ઓળખકર્તા (UMIs) સાથે લેબલ કરવામાં આવે છે. આ બારકોડેડ સ્પોટ્સ અને UMIs ચોક્કસ અવકાશી મેપિંગ અને જનીન અભિવ્યક્તિનું પ્રમાણીકરણ સિંગલ-સેલ રિઝોલ્યુશન પર સક્ષમ કરે છે. અવકાશી રીતે બારકોડેડ નમૂનાઓ અને UMIsનું સંયોજન જનરેટ થયેલ ડેટાની ચોકસાઈ અને વિશિષ્ટતાની ખાતરી કરે છે. આ અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ ટેકનોલોજીનો ઉપયોગ કરીને, સંશોધકો કોશિકાઓના અવકાશી સંગઠન અને પેશીઓની અંદર થતી જટિલ પરમાણુ ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓની ઊંડી સમજ મેળવી શકે છે, ઓન્કોલોજી, ન્યુરોસાયન્સ, ડેવલપમેન્ટલ બાયોલોજી, ઇમ્યુનોલોજી સહિત બહુવિધ ક્ષેત્રોમાં જૈવિક પ્રક્રિયાઓ અંતર્ગત મિકેનિઝમ્સમાં અમૂલ્ય આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે. , અને બોટનિકલ અભ્યાસ.
પ્લેટફોર્મ: 10X જીનોમિક્સ વિઝિયમ અને ઈલુમિના નોવાસેક
