-
ટૂલકિટ્સ
BMKCloud એ જીનોમિક પ્રોગ્રામ્સ માટે વન-સ્ટોપ સોલ્યુશન પ્રદાન કરતું અગ્રણી બાયોઇન્ફોર્મેટીક પ્લેટફોર્મ છે, જે તબીબી, કૃષિ, પર્યાવરણ વગેરે સહિતના વિવિધ ક્ષેત્રના સંશોધકો દ્વારા વ્યાપકપણે વિશ્વાસપાત્ર છે. BMKCloud બાયોઇન્ફોર્મેટીક વિશ્લેષણ પ્લેટફોર્મ અને સાધનો સહિત સંકલિત, વિશ્વસનીય અને કાર્યક્ષમ સેવાઓ પ્રદાન કરવા માટે પ્રતિબદ્ધ છે. , કમ્પ્યુટિંગ સંસાધનો, સાર્વજનિક ડેટાબેઝ, બાયોઇન્ફોર્મટિક ઓનલાઈન અભ્યાસક્રમો, વગેરે. BMKCloud પાસે વિવિધ છે જનીન એનોટેશન, ઉત્ક્રાંતિ આનુવંશિક સાધનો, ncRNA, ડેટા ગુણવત્તા નિયંત્રણ, એસેમ્બલી, સંરેખણ, ડેટા નિષ્કર્ષણ, પરિવર્તન, આંકડા, આકૃતિ જનરેટર, ક્રમ વિશ્લેષણ, વગેરે સહિત વારંવાર ઉપયોગમાં લેવાતા બાયોઇન્ફોર્મેટીક સાધનો.
-
ડી નોવો બેક્ટેરિયલ જીનોમ એસેમ્બલી
અમે સંપૂર્ણ બેક્ટેરિયલ જીનોમ એસેમ્બલી સેવા પ્રદાન કરીએ છીએ, 0 ગેપની ખાતરી આપીએ છીએ. એસેમ્બલી માટે નેનોપોર અને PacBio જેવી લાંબી-રીડ સિક્વન્સિંગ ટેક્નોલોજીને એકીકૃત કરીને અને એસેમ્બલીની માન્યતા અને ONT રીડની ભૂલ સુધારણા માટે ઈલુમિના સાથે ટૂંકી-રીડ સિક્વન્સિંગ દ્વારા આ શક્ય છે. અમારી સેવા એસેમ્બલી, ફંક્શનલ એનોટેશન અને અદ્યતન બાયોઇન્ફોર્મેટિક વિશ્લેષણમાંથી સંપૂર્ણ બાયોઇન્ફોર્મેટિક વર્કફ્લો પ્રદાન કરે છે, ચોક્કસ સંશોધન લક્ષ્યોને પરિપૂર્ણ કરે છે. આ સેવા વિવિધ આનુવંશિક અને જીનોમિક અભ્યાસો માટે ચોક્કસ સંદર્ભ જીનોમના વિકાસને સક્ષમ કરે છે. વધુમાં, તે સ્ટ્રેઈન ઓપ્ટિમાઈઝેશન, આનુવંશિક ઈજનેરી અને માઇક્રોબાયલ ટેક્નોલોજી ડેવલપમેન્ટ જેવા કાર્યક્રમો માટે આધાર બનાવે છે, જે વૈજ્ઞાનિક આંતરદૃષ્ટિ અને બાયોટેક્નોલોજીકલ ઈનોવેશનને આગળ વધારવા માટે વિશ્વસનીય અને ગેપ-ફ્રી જીનોમિક ડેટાની ખાતરી કરે છે.
-
નાના આરએનએ
નાના આરએનએ ટૂંકા બિન-કોડિંગ આરએનએનો પ્રકાર છે જેની સરેરાશ લંબાઈ 18-30 nt છે, જેમાં miRNA, siRNA અને piRNAનો સમાવેશ થાય છે. આ નાના આરએનએ વિવિધ જૈવિક પ્રક્રિયાઓ જેમ કે mRNA અધોગતિ, અનુવાદ નિષેધ, હેટરોક્રોમેટિન રચના, વગેરેમાં મોટા પ્રમાણમાં સામેલ હોવાનું નોંધાયું છે. નાના આરએનએ સિક્વન્સિંગ પૃથ્થકરણ પ્રાણી/છોડના વિકાસ, રોગ, વાયરસ વગેરે પરના અભ્યાસમાં વ્યાપકપણે લાગુ કરવામાં આવ્યું છે. નાના આરએનએ સિક્વન્સિંગ એનાલિસિસ પ્લેટફોર્મમાં પ્રમાણભૂત વિશ્લેષણ અને અદ્યતન ડેટા માઇનિંગનો સમાવેશ થાય છે. RNA-seq ડેટાના આધાર પર, પ્રમાણભૂત વિશ્લેષણ miRNA ઓળખ અને અનુમાન, miRNA લક્ષ્ય જનીન અનુમાન, ટીકા અને અભિવ્યક્તિ વિશ્લેષણ પ્રાપ્ત કરી શકે છે. અદ્યતન વિશ્લેષણ કસ્ટમાઇઝ્ડ miRNA શોધ અને નિષ્કર્ષણ, વેન ડાયાગ્રામ જનરેશન, miRNA અને લક્ષ્ય જનીન નેટવર્ક નિર્માણને સક્ષમ કરે છે.
-
NGS-WGS (ઇલ્યુમિના/BGI)
NGS-WGS એ સંપૂર્ણ જીનોમ રી-સિક્વન્સિંગ એનાલિસિસ પ્લેટફોર્મ છે, જે બાયોમાર્કર ટેક્નોલોજીમાં સમૃદ્ધ અનુભવના આધારે વિકસાવવામાં આવ્યું છે. આ સરળ-થી-ઉપયોગ પ્લેટફોર્મ, ફક્ત થોડા મૂળભૂત પરિમાણને સેટ કરીને સંકલિત વિશ્લેષણ વર્કફ્લોને ઝડપી સબમિટ કરવાની મંજૂરી આપે છે, જે ઇલુમિના પ્લેટફોર્મ અને BGI સિક્વન્સિંગ પ્લેટફોર્મ બંનેમાંથી જનરેટ થયેલા DNA સિક્વન્સિંગ ડેટા માટે બંધબેસે છે. આ પ્લેટફોર્મ ઉચ્ચ પ્રદર્શન કમ્પ્યુટિંગ સર્વર પર તૈનાત છે, જે અત્યંત મર્યાદિત સમયમાં અત્યંત કાર્યક્ષમ ડેટા વિશ્લેષણને સશક્ત બનાવે છે. મ્યુટેટેડ જીન ક્વેરી, પીસીઆર પ્રાઈમર ડિઝાઇન વગેરે સહિત પ્રમાણભૂત વિશ્લેષણના આધારે વ્યક્તિગત ડેટા માઇનિંગ ઉપલબ્ધ છે.
-
mRNA(સંદર્ભ)
ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ એ જીનોમિક આનુવંશિક માહિતી અને જૈવિક કાર્યના પ્રોટીઓમ વચ્ચેની કડી છે. ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ લેવલ રેગ્યુલેશન એ સજીવોનું સૌથી મહત્વપૂર્ણ અને સૌથી વધુ વ્યાપકપણે અભ્યાસ કરાયેલ નિયમન મોડ છે. ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સિક્વન્સિંગ કોઈપણ સમયે અથવા કોઈપણ સ્થિતિમાં, એક ન્યુક્લિયોટાઈડ માટે ચોક્કસ રિઝોલ્યુશન સાથે, ટ્રાન્સક્રિપ્ટમને અનુક્રમિત કરી શકે છે. તે જનીન ટ્રાન્સક્રિપ્શનના સ્તરને ગતિશીલ રીતે પ્રતિબિંબિત કરી શકે છે, સાથે સાથે દુર્લભ અને સામાન્ય ટ્રાન્સક્રિપ્ટ્સને ઓળખી શકે છે અને તેનું પ્રમાણ નક્કી કરી શકે છે અને તેની માળખાકીય માહિતી પ્રદાન કરી શકે છે. નમૂના વિશિષ્ટ ટ્રાન્સક્રિપ્ટ.
હાલમાં, ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સિક્વન્સિંગ ટેક્નોલોજીનો વ્યાપકપણે કૃષિવિજ્ઞાન, દવા અને અન્ય સંશોધન ક્ષેત્રોમાં ઉપયોગ થાય છે, જેમાં પ્રાણી અને વનસ્પતિ વિકાસ નિયમન, પર્યાવરણીય અનુકૂલન, રોગપ્રતિકારક ક્રિયાપ્રતિક્રિયા, જનીન સ્થાનિકીકરણ, પ્રજાતિ આનુવંશિક ઉત્ક્રાંતિ અને ગાંઠ અને આનુવંશિક રોગની શોધનો સમાવેશ થાય છે.
-
મેટાજેનોમિક્સ (NGS)
આ વિશ્લેષણ પ્લેટફોર્મ વર્ષોના અનુભવના આધારે શોટગન મેટાજેનોમિક ડેટા વિશ્લેષણ માટે રચાયેલ છે. તેમાં ડેટા પ્રોસેસિંગ, પ્રજાતિ-સ્તર અભ્યાસ, જનીન કાર્ય-સ્તર અભ્યાસ, મેટાજેનોમ બિનિંગ, વગેરે સહિત સામાન્ય રીતે જરૂરી વિવિધ મેટાજેનોમિક્સ વિશ્લેષણો ધરાવતા સંકલિત વર્કફ્લોનો સમાવેશ થાય છે. વધુમાં, કસ્ટમાઇઝ્ડ ડેટા માઇનિંગ ટૂલ્સ પ્રમાણભૂત વિશ્લેષણ વર્કફ્લો પર ઉપલબ્ધ છે, જેમાં જીન અને પ્રજાતિઓ ક્વેરીનો સમાવેશ થાય છે. , પેરામીટર સેટિંગ, વ્યક્તિગત આકૃતિ પેદા કરવી, વગેરે.
-
LncRNA
લાંબા નોન-કોડિંગ આરએનએ (lncRNA) એ 200 nt થી વધુ લંબાઈ ધરાવતી ટ્રાન્સક્રિપ્ટનો એક પ્રકાર છે, જે પ્રોટીનને કોડ કરવામાં અસમર્થ છે. સંચિત પુરાવા સૂચવે છે કે મોટા ભાગના lncRNAs કાર્યકારી હોવાની સંભાવના છે. ઉચ્ચ-થ્રુપુટ સિક્વન્સિંગ ટેક્નોલોજીઓ અને બાયોઇન્ફોર્મેટીક પૃથ્થકરણ સાધનો અમને lncRNA સિક્વન્સ અને સ્થિતિની માહિતીને વધુ અસરકારક રીતે જાહેર કરવા અને નિર્ણાયક નિયમનકારી કાર્યો સાથે lncRNA શોધવામાં અમને દોરી જાય છે. BMKCloud અમારા ગ્રાહકોને ઝડપી, ભરોસાપાત્ર અને લવચીક lncRNA વિશ્લેષણ પ્રાપ્ત કરવા માટે lncRNA સિક્વન્સિંગ પૃથ્થકરણ પ્લેટફોર્મ પૂરું પાડવા માટે ગર્વ અનુભવે છે.
-
GWAS
જીનોમ-વાઇડ એસોસિએશન સ્ટડી (જીડબ્લ્યુએએસ) નો હેતુ આનુવંશિક પ્રકારો (જીનોટાઇપ) ને ઓળખવાનો છે જે વિશિષ્ટ લક્ષણો (ફીનોટાઇપ) સાથે સંકળાયેલ છે. GWA અભ્યાસો આનુવંશિક માર્કર્સ મોટી સંખ્યામાં વ્યક્તિઓના સમગ્ર જીનોમને પાર કરે છે અને વસ્તીના સ્તરે આંકડાકીય વિશ્લેષણ દ્વારા જીનોટાઇપ-ફેનોટાઇપ એસોસિએશનની આગાહી કરે છે. આખા-જીનોમ રિક્વેન્સિંગ સંભવિત રીતે તમામ આનુવંશિક પ્રકારો શોધી શકે છે. ફિનોટાઇપિક ડેટા સાથે જોડીને, GWAS ને ફિનોટાઇપ સંબંધિત SNPs, QTLs અને ઉમેદવાર જનીનોને ઓળખવા માટે પ્રક્રિયા કરી શકાય છે, જે આધુનિક પ્રાણી/છોડના સંવર્ધનને મજબૂત રીતે સમર્થન આપે છે. SLAF એ સ્વ-વિકસિત સરળ જીનોમ સિક્વન્સિંગ વ્યૂહરચના છે, જે જીનોમ-વ્યાપી વિતરિત માર્કર, SNP શોધે છે. આ SNPs, પરમાણુ આનુવંશિક માર્કર્સ તરીકે, લક્ષિત લક્ષણો સાથે જોડાણ અભ્યાસ માટે પ્રક્રિયા કરી શકાય છે. આનુવંશિક ભિન્નતા સાથે સંકળાયેલ જટિલ લક્ષણોને ઓળખવા માટે તે ખર્ચ-અસરકારક વ્યૂહરચના છે.
-
નેનોપોર ફુલ-લેન્થ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ
સજીવોમાં જટિલ અને ચલ વૈકલ્પિક આઇસોફોર્મ્સ જનીન અભિવ્યક્તિ અને પ્રોટીનની વિવિધતાને નિયંત્રિત કરવા માટે મહત્વપૂર્ણ આનુવંશિક પદ્ધતિઓ છે. ટ્રાન્સક્રિપ્ટ સ્ટ્રક્ચર્સની સચોટ ઓળખ એ જનીન અભિવ્યક્તિ નિયમન પેટર્નના ઊંડાણપૂર્વકના અભ્યાસ માટેનો આધાર છે. નેનોપોર સિક્વન્સિંગ પ્લેટફોર્મ સફળતાપૂર્વક ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક અભ્યાસને આઇસોફોર્મ-સ્તર પર લાવ્યા છે. આ વિશ્લેષણ પ્લેટફોર્મ નેનોપોર પ્લેટફોર્મ પર જનરેટ થયેલ આરએનએ-સેક ડેટાના સંદર્ભ જીનોમના આધારે વિશ્લેષણ કરવા માટે રચાયેલ છે, જે જનીન સ્તર અને ટ્રાન્સક્રિપ્ટ સ્તર બંનેમાં ગુણાત્મક અને જથ્થાત્મક વિશ્લેષણ પ્રાપ્ત કરે છે.
-
વર્તુળ-આરએનએ
પરિપત્ર RNA(circRNA) નોન-કોડિંગ RNAનો એક પ્રકાર છે, જે તાજેતરમાં વિકાસશીલ, પર્યાવરણીય પ્રતિકાર વગેરેમાં સામેલ નિયમનકારી નેટવર્ક્સમાં મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવતો જોવા મળે છે. રેખીય RNA અણુઓથી અલગ, દા.ત. mRNA, lncRNA, 3′ અને 5′ circRNA ના છેડા એકબીજા સાથે જોડાઈને ગોળાકાર માળખું બનાવે છે, જે તેમને પાચનથી બચાવે છે exonuclease અને મોટાભાગના રેખીય RNA કરતાં વધુ સ્થિર છે. જનીન અભિવ્યક્તિને નિયંત્રિત કરવામાં CircRNA વિવિધ કાર્યો ધરાવે છે તેવું જાણવા મળ્યું છે. CircRNA ceRNA તરીકે કાર્ય કરી શકે છે, જે miRNA ને સ્પર્ધાત્મક રીતે બાંધે છે, જેને miRNA સ્પોન્જ તરીકે ઓળખવામાં આવે છે. CircRNA સિક્વન્સિંગ વિશ્લેષણ પ્લેટફોર્મ circRNA માળખું અને અભિવ્યક્તિ વિશ્લેષણ, લક્ષ્ય આગાહી અને અન્ય પ્રકારના RNA અણુઓ સાથે સંયુક્ત વિશ્લેષણને સશક્ત બનાવે છે.
-
BSA
જથ્થાબંધ સેગ્રિગન્ટ એનાલિસિસ પ્લેટફોર્મમાં એક-પગલાની માનક વિશ્લેષણ અને કસ્ટમાઇઝ્ડ પેરામીટર સેટિંગ સાથે અદ્યતન વિશ્લેષણનો સમાવેશ થાય છે. BSA એ ફેનોટાઇપ સાથે સંકળાયેલ આનુવંશિક માર્કર્સને ઝડપથી ઓળખવા માટે કાર્યરત તકનીક છે. BSA ના મુખ્ય કાર્યપ્રવાહમાં નીચેનાનો સમાવેશ થાય છે: 1. અત્યંત વિરોધી ફિનોટાઇપ્સ ધરાવતી વ્યક્તિઓના બે જૂથોની પસંદગી; 2. તમામ વ્યક્તિઓના ડીએનએ, આરએનએ અથવા એસએલએએફ-સેક (બાયોમાર્કર દ્વારા વિકસિત) નું બે બલ્ક ડીએનએ બનાવવા માટે; 3. સંદર્ભ જીનોમ સામે અથવા તેની વચ્ચેના વિભેદક અનુક્રમોને ઓળખવા, 4. ED અને SNP-ઇન્ડેક્સ અલ્ગોરિધમ દ્વારા ઉમેદવાર સાથે જોડાયેલા પ્રદેશોની આગાહી કરવી; 5. ઉમેદવાર પ્રદેશોમાં જનીનો પર કાર્યાત્મક વિશ્લેષણ અને સંવર્ધન વગેરે. આનુવંશિક માર્કર સ્ક્રીનીંગ અને પ્રાઈમર ડિઝાઇન સહિત ડેટામાં વધુ અદ્યતન ખાણકામ પણ ઉપલબ્ધ છે.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) પ્લેટફોર્મ માઇક્રોબાયલ ડાયવર્સિટી પ્રોજેક્ટ વિશ્લેષણના વર્ષોના અનુભવ સાથે વિકસાવવામાં આવ્યું છે, જેમાં પ્રમાણભૂત મૂળભૂત વિશ્લેષણ અને વ્યક્તિગત વિશ્લેષણ શામેલ છે: મૂળભૂત વિશ્લેષણ વર્તમાન માઇક્રોબાયલ સંશોધનના મુખ્ય પ્રવાહના વિશ્લેષણ સામગ્રીને આવરી લે છે, વિશ્લેષણ સામગ્રી સમૃદ્ધ અને વ્યાપક છે, અને વિશ્લેષણ પરિણામો પ્રોજેક્ટ અહેવાલોના સ્વરૂપમાં રજૂ કરવામાં આવે છે; વ્યક્તિગત વિશ્લેષણની સામગ્રી વૈવિધ્યસભર છે. નમૂનાઓ પસંદ કરી શકાય છે અને વ્યક્તિગત આવશ્યકતાઓને અનુભૂતિ કરવા માટે મૂળભૂત વિશ્લેષણ અહેવાલ અને સંશોધન હેતુ અનુસાર પરિમાણો લવચીક રીતે સેટ કરી શકાય છે. વિન્ડોઝ ઓપરેટિંગ સિસ્ટમ, સરળ અને ઝડપી.
-
ઉત્ક્રાંતિ જિનેટિક્સ
ઇવોલ્યુશનરી જિનેટિક્સ એ SNPs, InDels, SVs અને CNVs સહિત આનુવંશિક ભિન્નતાઓ પર આધારિત, વ્યક્તિઓના વિશાળ જૂથમાં ઉત્ક્રાંતિનું સમજદાર અર્થઘટન પ્રદાન કરવા માટે રચાયેલ એક વ્યાપક અનુક્રમ સેવા છે. આ સેવામાં વસ્તીની રચના, આનુવંશિક વિવિધતા અને ફાયલોજેનેટિક સંબંધોના મૂલ્યાંકન સહિત, વસ્તીના ઉત્ક્રાંતિ પરિવર્તન અને આનુવંશિક લાક્ષણિકતાઓને સ્પષ્ટ કરવા માટે જરૂરી તમામ આવશ્યક વિશ્લેષણોનો સમાવેશ થાય છે. તદુપરાંત, તે જનીન પ્રવાહ પરના અભ્યાસમાં ધ્યાન આપે છે, અસરકારક વસ્તી કદ અને વિચલન સમયના અંદાજને સક્ષમ કરે છે. ઉત્ક્રાંતિ આનુવંશિક અભ્યાસો પ્રજાતિઓની ઉત્પત્તિ અને અનુકૂલન વિશે મૂલ્યવાન આંતરદૃષ્ટિ આપે છે.
BMKGENE ખાતે, અમે મોટી વસ્તી પર ઉત્ક્રાંતિ આનુવંશિક અભ્યાસ હાથ ધરવા માટેના બે રસ્તાઓ પ્રદાન કરીએ છીએ: સંપૂર્ણ-જીનોમ સિક્વન્સિંગ (WGS) ને રોજગારી આપવી અથવા ઓછી રજૂઆત જીનોમ સિક્વન્સિંગ પદ્ધતિ, ઇન-હાઉસ-ડેવલપ્ડ સ્પેસિફિક-લોકસ એમ્પ્લીફાઇડ ફ્રેગમેન્ટ (SLAF) પસંદ કરવી. જ્યારે WGS નાના જિનોમને અનુકૂળ કરે છે, ત્યારે SLAF લાંબા જિનોમ સાથે મોટી વસ્તીનો અભ્યાસ કરવા માટે ખર્ચ-અસરકારક વિકલ્પ તરીકે ઉભરી આવે છે, અસરકારક રીતે અનુક્રમ ખર્ચ ઘટાડે છે.
