હીટમેપ
હીટમેપ ટૂલ મેટ્રિક્સ ડેટા ફાઇલને ઇનપુટ તરીકે સ્વીકારે છે અને વપરાશકર્તાઓને ડેટા ફિલ્ટર કરવા, સામાન્ય બનાવવા અને ક્લસ્ટર કરવાની મંજૂરી આપે છે. હીટમેપ્સ માટે પ્રાથમિક ઉપયોગનો કેસ વિવિધ નમૂનાઓ વચ્ચે જનીન અભિવ્યક્તિ સ્તરનું ક્લસ્ટર વિશ્લેષણ છે.
જીન એનોટેશન
જીન એનોટેશન ટૂલ વિવિધ ડેટાબેઝ સામે ઈનપુટ ફાસ્ટા ફાઈલોના અનુક્રમ સંરેખણના આધારે જીન એનોટેશન કરે છે.
મૂળભૂત સ્થાનિક સંરેખણ શોધ સાધન (BLAST)
BLAST ટૂલ એ NCBI BLAST નું BMKCloud સંકલિત સંસ્કરણ છે અને BMKCloud એકાઉન્ટ પર અપલોડ કરેલા ડેટાનો ઉપયોગ કરીને સમાન કાર્યો કરવા માટે તેનો ઉપયોગ કરી શકાય છે.
CDS_UTR અનુમાન
CDS_UTR પ્રિડિક્શન ટૂલ જાણીતા પ્રોટીન ડેટાબેઝ અને ORF આગાહી પરિણામો સામે BLAST પરિણામોના આધારે આપેલ ટ્રાન્સક્રિપ્ટ સિક્વન્સમાં કોડિંગ પ્રદેશો (CDS) અને નોન-કોડિંગ પ્રદેશો (UTR) ની આગાહી કરવા માટે રચાયેલ છે.
મેનહટન પ્લોટ
મેનહટન પ્લોટ ટૂલ ઉચ્ચ નમૂના પ્રયોગોના પ્રદર્શનને સક્ષમ કરે છે અને સામાન્ય રીતે જેનોમ-વાઇડ એસોસિએશન સ્ટડીઝ (GWAS) માં વપરાય છે.
સર્કોસ ડાયાગ્રામ
CIRCOS ડાયાગ્રામ ટૂલ સમગ્ર જીનોમમાં જિનોમિક લક્ષણ કેવી રીતે વિતરિત થાય છે તેનું કાર્યક્ષમ વિઝ્યુલાઇઝેશન પ્રદાન કરે છે. સામાન્ય લક્ષણોમાં જથ્થાત્મક સ્થાન, SNPs, InDels, માળખાકીય અને નકલ નંબર વેરિઅન્ટ્સનો સમાવેશ થાય છે.
જીન ઓન્ટોલોજી (GO) સંવર્ધન
GO સંવર્ધન સાધન કાર્યાત્મક સંવર્ધન વિશ્લેષણ પ્રદાન કરે છે. આ ટૂલમાં પ્રાથમિક સોફ્ટવેર ટોપજીઓ-બાયોકન્ડક્ટર પેકેજ છે, જેમાં વિભેદક અભિવ્યક્તિ વિશ્લેષણ, GO સંવર્ધન વિશ્લેષણ અને પરિણામોનું વિઝ્યુલાઇઝેશન શામેલ છે.
વેઇટેડ જીન કો-એક્સપ્રેશન નેટવર્ક એનાલિસિસ (WGCNA)
WGCNA એ જનીન સહ-અભિવ્યક્તિ મોડ્યુલો શોધવા માટે વ્યાપકપણે ઉપયોગમાં લેવાતી ડેટા માઇનિંગ પદ્ધતિ છે. તે માઇક્રોએરે અને NGS જનીન અભિવ્યક્તિ ડેટા સહિત વિવિધ અભિવ્યક્તિ ડેટાસેટને લાગુ પડે છે.
ઇન્ટરપ્રોસ્કેન
ઇન્ટરપ્રોસ્કેન ટૂલ ઇન્ટરપ્રો પ્રોટીન ક્રમ વિશ્લેષણ અને વર્ગીકરણ પ્રદાન કરે છે.
KEGG સંવર્ધન પર જાઓ
GO KEGG એનરિચમેન્ટ ટૂલ એ GO એનરિચમેન્ટ હિસ્ટોગ્રામ, KEGG એનરિચમેન્ટ હિસ્ટોગ્રામ અને KEGG એનરિચમેન્ટ પાથવે જનરેટ કરવા માટે ડિઝાઇન કરવામાં આવ્યું છે જે પ્રદાન કરેલ જીન સેટ અને અનુરૂપ એનોટેશન પર આધારિત છે.