પ્લાન્ટ/એનિમલ દ નોવો જિનોમ સિક્વન્સિંગ
નવેસરસિક્વન્સીંગ એ સંદર્ભ જિનોમની ગેરહાજરીમાં સિક્વન્સિંગ તકનીકોનો ઉપયોગ કરીને પ્રજાતિના સંપૂર્ણ જીનોમના નિર્માણનો સંદર્ભ આપે છે. ત્રીજી પે generation ીના અનુક્રમનો પરિચય અને વ્યાપક દત્તક, જેમાં લાંબા સમય સુધી વાંચન દર્શાવવામાં આવ્યું છે, વાંચન વચ્ચેના ઓવરલેપને વધારીને જીનોમ એસેમ્બલીમાં નોંધપાત્ર વધારો થયો છે. પડકારજનક જીનોમ સાથે વ્યવહાર કરતી વખતે આ વૃદ્ધિ ખાસ કરીને યોગ્ય છે, જેમ કે ઉચ્ચ હેટરોઝાયગોસિટી, પુનરાવર્તિત પ્રદેશો, પોલિપ્લોઇડ્સ અને પુનરાવર્તિત તત્વોવાળા પ્રદેશોનું ઉચ્ચ ગુણોત્તર, અસામાન્ય જીસી સમાવિષ્ટો અથવા ઉચ્ચ જટિલતા કે જે સામાન્ય રીતે ટૂંકા-વાંચન અનુક્રમનો ઉપયોગ કરીને નબળી રીતે એસેમ્બલ કરવામાં આવે છે એકલા.
અમારું વન-સ્ટોપ સોલ્યુશન ઇન્ટિગ્રેટેડ સિક્વન્સીંગ સેવાઓ અને બાયોઇન્ફોર્મેટિક વિશ્લેષણ પ્રદાન કરે છે જે ઉચ્ચ-ગુણવત્તાવાળા ડી નોવો એસેમ્બલ જીનોમ પહોંચાડે છે. ઇલુમિના સાથેનો પ્રારંભિક જીનોમ સર્વે જિનોમ કદ અને જટિલતાના અનુમાન પૂરા પાડે છે, અને આ માહિતીનો ઉપયોગ પેકબિઓ હિફાઇ સાથે લાંબા-વાંચનના સિક્વન્સિંગના આગલા પગલાને માર્ગદર્શન આપવા માટે થાય છે, ત્યારબાદનવેસરકોન્ટીગ્સની એસેમ્બલી. એચઆઇસી એસેમ્બલીનો અનુગામી ઉપયોગ રંગસૂત્ર-સ્તરની એસેમ્બલી પ્રાપ્ત કરીને, જીનોમમાં કોન્ટિગ્સના એન્કરિંગને સક્ષમ કરે છે. છેવટે, જીનોમ જીન આગાહી દ્વારા અને સિક્વન્સિંગ જનીનો દ્વારા, ટૂંકા અને લાંબા વાંચન સાથે ટ્રાંસ્ક્રિપ્ટમ્સનો આશરો લઈને ot નોટેટ કરવામાં આવે છે.
સેવા વિશેષતા
એક સ્ટોપ સોલ્યુશનમાં મલ્ટીપલ સિક્વેન્સિંગ અને બાયોઇન્ફોર્મેટિક સેવાઓનું એકીકરણ:
જીનોમ કદનો અંદાજ કા and વા અને અનુગામી પગલાઓને માર્ગદર્શન આપવા માટે ઇલુમિના સાથે જીનોમ સર્વે;
માટે લાંબી વાંચન અનુક્રમનવેસરકોન્ટિગ્સની એસેમ્બલી;
રંગસૂત્ર એન્કરિંગ માટે હાય-સી સિક્વન્સિંગ;
જનીનોના ot નોટેશન માટે એમઆરએનએ સિક્વન્સિંગ;
વિધાનસભા માન્યતા.
Novel નવલકથાના જિનોમના નિર્માણ માટે યોગ્ય સેવા અથવા રસની જાતિઓ માટે હાલના સંદર્ભ જિનોમના સુધારણા.
સેવા લાભ
સિક્વન્સિંગ પ્લેટફોર્મ અને બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સનો વિકાસનવેસરજિનોમ સભા
(અમરાસિંગે એસએલ એટ અલ.,જિનામ જીવવિજ્ologyાન, 2020)
.વ્યાપક કુશળતા અને પ્રકાશન રેકોર્ડ: બીએમકેજેને વિવિધ પ્રજાતિઓની ઉચ્ચ-ગુણવત્તાવાળી જીનોમ એસેમ્બલીમાં મોટા અનુભવનો એકઠા કર્યો છે, જેમાં ડિપ્લોઇડ જિનોમ અને પોલિપ્લોઇડ અને એલોપોલિપ્લોઇડ પ્રજાતિઓના અત્યંત જટિલ જિનોમનો સમાવેશ થાય છે. 2018 થી, અમે વધુ ફાળો આપ્યો છે300 ઉચ્ચ અસરવાળા પ્રકાશનો, અને તેમાંથી 20+ પ્રકૃતિ આનુવંશિકતામાં પ્રકાશિત થાય છે.
St સ્ટોપ સોલ્યુશન: અમારું એકીકૃત અભિગમ બહુવિધ સિક્વન્સીંગ તકનીકો અને બાયોઇન્ફોર્મેટિક વિશ્લેષણને એકીકૃત વર્કફ્લોમાં જોડે છે, જે ઉચ્ચ-ગુણવત્તાવાળા એસેમ્બલ જીનોમ પહોંચાડે છે.
.તમારી જરૂરિયાતોને અનુરૂપ: અમારી સેવા વર્કફ્લો કસ્ટમાઇઝ કરી શકાય તેવું છે, વિવિધ સુવિધાઓ અને વિશિષ્ટ સંશોધન આવશ્યકતાઓવાળા જીનોમ માટે અનુકૂલનને મંજૂરી આપે છે. આમાં વિશાળ જિનોમ, પોલિપ્લોઇડ જિનોમ, અત્યંત વિજાતીય જિનોમ અને વધુ સમાવિષ્ટ શામેલ છે.
.ખૂબ કુશળ બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ અને પ્રયોગશાળા ટીમ: જટિલ જિનોમ એસેમ્બલીઓ અને પેટન્ટ અને સ software ફ્ટવેર ક copy પિરાઇટ્સની શ્રેણીના પ્રાયોગિક અને બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ બંનેના મહાન અનુભવ સાથે.
.વેચાણ પછીના સપોર્ટ:અમારી પ્રતિબદ્ધતા 3 મહિનાની વેચાણ પછીની સેવા અવધિ સાથે પ્રોજેક્ટ પૂર્ણ થવા ઉપરાંત વિસ્તરે છે. આ સમય દરમિયાન, અમે પરિણામોને લગતા કોઈપણ પ્રશ્નોને સંબોધવા માટે પ્રોજેક્ટ ફોલો-અપ, મુશ્કેલીનિવારણ સહાય અને ક્યૂ એન્ડ એ સત્રોની ઓફર કરીએ છીએ.
સેવા વિશિષ્ટતાઓ
| જીનોમ મોજણી | જિનોમ સભા | રંગભૂમિ | જિનોમ નોંધણી |
| 50x ઇલુમિના નોવાઝેક પીઇ 150
| 30x પેકબિઓ સીસીએસ હિફાઇ વાંચે છે | 100x હાય-સી | આરએનએ-સેક ઇલુમિના પીઇ 150 10 જીબી + (વૈકલ્પિક) સંપૂર્ણ લંબાઈ આરએનએ-સેક પેકબિઓ 40 જીબી અથવા નેનોપોર 12 જીબી |
સેવા આવશ્યકતા
જિનોમ સર્વે, જીનોમ એસેમ્બલી અને હાય-સી એસેમ્બલી માટે:
| પેશી અથવા કા racted ેલા ન્યુક્લિક એસિડ્સ | જીનોમ મોજણી | પેકબિઓ સાથેનો જિનોમ એસેમ્બલી | હાય-સી |
| પશુ વિસાર | 0.5-1 ગ્રામ
| ≥ 3.5 જી | ≥2 જી |
| પશુ સ્નાયુ | ≥ 5 ગ્રામ | ||
| સસ્તન પ્રાણી | 1.5 મિલી
| M 5 મિલી | M2 એમએલ |
| મરઘાં/માછલીનું લોહી | Ml 0.5 મિલી | ||
| છોડ- તાજી પાન | 1-2 જી | ≥ 5 ગ્રામ | ≥ 4 જી |
| સંસ્કારી કોષો |
| X 1x108 | X 1x107 |
| જંતુ | 0.5-1 ગ્રામ | ≥ 3 જી | ≥ 2 જી |
| કા racted ેલ ડીએનએ | એકાગ્રતા: ≥1 એનજી/ µl રકમ ≥ 30 એનજી મર્યાદિત અથવા કોઈ અધોગતિ અથવા દૂષણ | સાંદ્રતા: ≥ 50 એનજી/ µl રકમ: 10 µg/ફ્લો સેલ/નમૂના OD260/280 = 1.7-2.2 OD260/230 = 1.8-2.5 મર્યાદિત અથવા કોઈ અધોગતિ અથવા દૂષણ |
-
|
ટ્રાંસ્ક્રિપ્ટોમિક્સ સાથે જીનોમ ot નોટેશન માટે:
| પેશી અથવા કા racted ેલા ન્યુક્લિક એસિડ્સ | રોષ | પેકબિઓ ટ્રાંસ્ક્રિપ્ટોમ | નેનોપોર ટ્રાન્સક્રિપ્ટમ |
| છોડ- મૂળ/દાંડી/પાંખડી | 450 મિલિગ્રામ | 600 મિલિગ્રામ | |
| છોડ - પાંદડા/બીજ | 300 મિલિગ્રામ | 300 મિલિગ્રામ | |
| છોડ - ફળ | 1.2 જી | 1.2 જી | |
| પશુ હૃદય/આંતરડા | 300 મિલિગ્રામ | 300 મિલિગ્રામ | |
| પશુ વિઝેરા/મગજ | 240 મિલિગ્રામ | 240 મિલિગ્રામ | |
| પશુ સ્નાયુ | 450 મિલિગ્રામ | 450 મિલિગ્રામ | |
| પ્રાણી હાડકાં/વાળ/ત્વચા | 1 જી | 1 જી | |
| આર્થ્રોપોડ - જંતુ | 6 | 6 | |
| આર્થ્રોપોડ -ક્રુસ્ટેસિયા | 300 મિલિગ્રામ | 300 મિલિગ્રામ | |
| સંપૂર્ણ લોહી | 1 ટ્યુબ | 1 ટ્યુબ | |
| કા racted ેલ આર.એન.એ. | સાંદ્રતા: ≥ 20 એનજી/ µl રકમ ≥ 0.3 µg OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 દાણો≥ 6 5≥28s/18S≥1 | સાંદ્રતા: ≥ 100 એનજી/ µl રકમ ≥ 0.75 µg OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 દાણો. 8 5≥28s/18S≥1 | સાંદ્રતા: ≥ 100 એનજી/ µl રકમ ≥ 0.75 µg OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 દાણો.5 7.5 5≥28s/18S≥1 |
ભલામણ કરેલ નમૂના વિતરણ
કન્ટેનર: 2 મિલી સેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબ (ટીન વરખની ભલામણ કરવામાં આવતી નથી)
(મોટાભાગના નમૂનાઓ માટે, અમે ઇથેનોલમાં સાચવવાની ભલામણ કરીએ છીએ.)
નમૂના લેબલિંગ: નમૂનાઓ સબમિટ કરેલા નમૂના માહિતી ફોર્મની સ્પષ્ટ રીતે લેબલ અને સમાન હોવા જોઈએ.
શિપમેન્ટ: ડ્રાય-આઇસ: નમૂનાઓ પહેલા બેગમાં ભરેલા અને સૂકા-બરફમાં દફનાવવાની જરૂર છે.
કાર્યપ્રવાહ
સેવા કાર્ય -પ્રવાહ
પ્રયોગ -રચના
નમૂનાની સોંપણી
ડીએનએ નિષ્કર્ષણ
ગ્રંથાલય બાંધકામ
અનુક્રમ
આંકડા -માહિતી
વેચાણ બાદની સેવાઓ
સંપૂર્ણ બાયોઇન્ફોર્મેટિક વિશ્લેષણ, 4 પગલાઓમાં અલગ:
1) જીનોમ સર્વે, એનજીએસ સાથે કે-મેર વિશ્લેષણના આધારે વાંચો:
જિનોમ કદનો અંદાજ
વિજાતીયતાનો અંદાજ
પુનરાવર્તિત પ્રદેશોનો અંદાજ
2) પેકબિઓ હિફાઇ સાથે જીનોમ એસેમ્બલી:
નવેસરવિધાનસભા
એસેમ્બલી આકારણી: જીનોમ સંપૂર્ણતા માટે બસ્કો વિશ્લેષણ અને એનજીએસ અને પેકબિઓ હિફાઇ વાંચનનાં મેપિંગ સહિત
3) હાય-સી એસેમ્બલી:
હાય-સી લાઇબ્રેરી ક્યુસી: માન્ય એચ.આઈ.-સી ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓનો અંદાજ
હાય-સી એસેમ્બલી: જૂથોમાં કોન્ટિગ્સનું ક્લસ્ટરીંગ, ત્યારબાદ દરેક જૂથની અંદર કોન્ટિગ ઓર્ડર આપતા અને કોન્ટિગ ઓરિએન્ટેશન સોંપવામાં આવે છે
હાય-સી મૂલ્યાંકન
4) જીનોમ ot નોટેશન:
બિન-કોડિંગ આર.એન.એ.
પુનરાવર્તિત સિક્વન્સ ઓળખ (ટ્રાન્સપોન્સ અને ટ and ન્ડમ પુનરાવર્તન)
જાનની આગાહી
.નવેસર: એબી દીક્ષા એલ્ગોરિધમ્સ
હોમોલોજી પર આધારિત
Trans લાંબા અને ટૂંકા વાંચન સાથે ટ્રાંસ્ક્રિપ્ટોમ પર આધારિત: વાંચન છેનવેસરજીનોમ ડ્રાફ્ટમાં એસેમ્બલ અથવા મેપ કરેલા
Multiple બહુવિધ ડેટાબેસેસ સાથે આગાહી કરેલા જનીનોની ot નોટેશન
1) જીનોમ સર્વે- કે-મેર વિશ્લેષણ
2) જિનોમ વિધાનસભા
2) જીનોમ એસેમ્બલી - પેકબિઓ હિફાઇએ ડ્રાફ્ટ એસેમ્બલીમાં મેપિંગ વાંચ્યું
2) એચઆઇ-સી એસેમ્બલી-હાય-સી માન્ય ક્રિયાપ્રતિક્રિયા જોડીઓનો અંદાજ
3) હાય-સી પોસ્ટ-એસેમ્બલી મૂલ્યાંકન
)) જીનોમ ot નોટેશન - આગાહી જનીનોનું એકીકરણ
4) જીનોમ ot નોટેશન - આગાહી જનીનો એનોટેશન
પ્રકાશનોના ક્યુરેટેડ સંગ્રહ દ્વારા BMKGENE ની દ નોવો જિનોમ એસેમ્બલી સેવાઓ દ્વારા સુવિધા આપવામાં આવેલી પ્રગતિઓનું અન્વેષણ કરો:
લિ, સી. એટ અલ. (2021) 'જીનોમ સિક્વન્સ વૈશ્વિક વિખેરી નાખવાના માર્ગોને જાહેર કરે છે અને સીહોર્સ ઇવોલ્યુશનમાં કન્વર્જન્ટ આનુવંશિક અનુકૂલન સૂચવે છે', નેચર કમ્યુનિકેશન્સ, 12 (1). doi: 10.1038/S41467-021-21379-X.
લિ, વાય. એટ અલ. . doi: 10.1093/MOLBEV/MSAD006.
ટિયન, ટી. એટ અલ. . doi: 10.1038/S41588-023-01297-y.
ઝાંગ, એફ. એટ અલ. . doi: 10.1038/S41467-023-37133-4.
પડકારજનક કેસ-અભ્યાસ:
ટેલોમેર-થી-ટેલોમેર એસેમ્બલી:ફુ, એ. એટ અલ. . doi: 10.1093/hr/uhac228.
હેપ્લોટાઇપ એસેમ્બલી:હુ, ડબલ્યુ. એટ અલ. . doi: 10.1016/j.molp.2021.04.009.
જાયન્ટ જિનોમ એસેમ્બલી:યુઆન, જે. એટ અલ. . doi: 10.1038/S41467-022-35063-1.
પોલિપ્લોઇડ જિનોમ એસેમ્બલી:ઝાંગ, ક્યૂ. એટ અલ. . doi: 10.1038/S41588-022-01084-1.
