Pacbio પૂર્ણ-લંબાઈ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ

PacBio ફુલ-લેન્થ ટ્રાન્સક્રિપ્ટમ સિક્વન્સિંગ, Isoseq, ટ્રાંસ્ક્રિપ્ટ આઇસોફોર્મ્સની સચોટ ઓળખને સક્ષમ કરે છે, વૈકલ્પિક પોલિએડેનિલેશન અને સ્પ્લિસિંગ પર પ્રકાશ પાડે છે, અને વધુ સચોટ જનીન અભિવ્યક્તિ વિશ્લેષણ તરફ દોરી જાય છે. BMKCloud PacBio ફુલ-લેન્થ ટ્રાન્સક્રિપ્ટમ પાઈપલાઈન સર્ક્યુલર કન્સેન્સસ સિક્વન્સિંગ (CCS) મોડમાં અનુક્રમિત cDNA લાઈબ્રેરીઓનું વિશ્લેષણ કરવા માટે ડિઝાઇન કરવામાં આવી છે અને ફુલ-લેન્થ નોન-ચીમેરિક (FLNC) સિક્વન્સને ઓળખે છે, જે પછી બિન-રિડન્ડન્ટ ટ્રાંસ્ક્રિપ્ટમાં ક્લસ્ટર કરવામાં આવે છે. અનુગામી BUSCO વિશ્લેષણ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ એસેમ્બલીની સંપૂર્ણતાનું મૂલ્યાંકન કરે છે. એસેમ્બલ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમમાંથી, બહુવિધ વિશ્લેષણ કરવામાં આવે છે: વૈકલ્પિક વિભાજન, સરળ ક્રમ પુનરાવર્તન (SSR), lncRNA અને અનુરૂપ લક્ષ્ય જનીનોની આગાહી, નવલકથા જનીનોની આગાહી, જનીન કુટુંબ વિશ્લેષણ, ટ્રાન્સક્રિપ્શન પરિબળ વિશ્લેષણ, અને ટ્રાન્સક્રિપ્ટનું કાર્યાત્મક એનોટેશન.