ટી 2 ટી જીનોમ એસેમ્બલી, ગેપ ફ્રી જિનોમ
1stચોખાના બે જિનોમ1
શીર્ષક: ઝિયાન/ઇન્ડીકા ચોખા માટે બે ગેપ-ફ્રી સંદર્ભ જિનોમનું એસેમ્બલી અને માન્યતા, પ્લાન્ટ સેન્ટ્રોમેર આર્કિટેક્ચરની આંતરદૃષ્ટિ દર્શાવે છે
Doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
પોસ્ટ સમય: 01 જાન્યુઆરી, 2021.
સંસ્થા: હુઝહોંગ એગ્રિકલ્ચરલ યુનિવર્સિટી, ચાઇના
સામગ્રી
ઓ. સટિવા ઝીઆન/ઇન્ડીકાચોખાની જાતો 'ઝેનશન 97 (ઝેડએસ 97)' અને 'મિંગુઇ 63 (એમએચ 63)
અનુક્રમ વ્યૂહરચના
એનજીએસ વાંચે છે + હિફાઇ વાંચે છે + સીએલઆર વાંચે છે + બિયોનાનો + હાય-સી
ડેટા:
ઝેડએસ 97: 8.34 જીબી （~ 23x） હિફાઇ વાંચે છે + 48.39 જીબી (~ 131x) સીએલઆર વાંચે છે + 25 જીબી (~ 69x) એનજીએસ + 2 બિયોના આઇઆરવાય સેલ્સ
એમએચ 63: 37.88 જીબી (~ 103x) એચઆઇએફઆઈ વાંચે છે + 48.97 જીબી (~ 132x) સીએલઆર વાંચે છે + 28 જીબી (~ 76x) એનજીએસ + 2 બિયોનો આઇર સેલ્સ
આકૃતિ 1 ચોખાના બે ગેપ મુક્ત જિનોમ (એમએચ 63 અને ઝેડએસ 97)
2ndમાળા2
શીર્ષક: નેનોપોર સિક્વન્સિંગનો ઉપયોગ કરીને કેળાના ટેલોમેર-થી-ટેલોમેર ગેપલેસ રંગસૂત્રો
Doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
પોસ્ટ સમય: 17 એપ્રિલ, 2021.
સંસ્થા: યુનિવર્સિટી પેરિસ-સેક્લે, ફ્રાન્સ
સામગ્રી
ડબલ હેપ્લોઇડમૂસા એક્યુમિનાટાસદસ્યમસાલા(ડી.એચ.-પહાંગ)
સિક્વન્સિંગ વ્યૂહરચના અને ડેટા:
HISEQ2500 PE250 મોડ+ મિનિઅન/ પ્રોમિથિયન (93 જીબી, ~ 200x)+ ઓપ્ટિકલ નકશો (ડીએલઇ -1+ બીએસપીક્યુ 1)
કોષ્ટક 1 મુસા એક્યુમિનાટા (ડી.એચ.-પહાંગ) જિનોમ એસેમ્બલીઓની તુલના
આકૃતિ 2 મુસા જિનોમ આર્કિટેક્ચર સરખામણી
3rdફેઓડેક્ટિલિયમ ટ્રાઇકોર્નટમ જિનોમ3
શીર્ષક: ટેલોમેર-થી-ટેલોમેર જિનોમ એસેમ્બલીP
હેયોઓડેક્ટિલિયમ ત્રિકોણાકાર
Doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
પોસ્ટ સમય: 04 મે, 2021
સંસ્થા: વેસ્ટર્ન યુનિવર્સિટી, કેનેડા
સામગ્રી
ત્રિકોણાકાર(શેવાળ અને પ્રોટોઝોઆ સીસીએપી 1055/1 નો સંસ્કૃતિ સંગ્રહ)
સિક્વન્સિંગ વ્યૂહરચના અને ડેટા:
1 Ox ક્સફર્ડ નેનોપોર મિનિઅન ફ્લો સેલ + એ 2 × 75 જોડી-અંત મિડ-આઉટપુટ નેક્સ્ટસેક 550 રન
આકૃતિ 3 ટેલોમેર-થી-ટેલોમેર જિનોમ એસેમ્બલી માટે વર્કફ્લો
4thમાનવ સીએચએમ 13 જીનોમ4
શીર્ષક: માનવ જિનોમનો સંપૂર્ણ ક્રમ
Doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
પોસ્ટ સમય: 27 મે, 2021
સંસ્થા: રાષ્ટ્રીય આરોગ્ય સંસ્થાઓ (એનઆઈએચ), યુએસએ
સામગ્રી: સેલ લાઇન સીએચએમ 13
સિક્વન્સિંગ વ્યૂહરચના અને ડેટા:
30 × પેકબિઓ પરિપત્ર સંમતિ સિક્વન્સીંગ (એચઆઇએફઆઈ), 120 × Ox ક્સફોર્ડ નેનોપોર અલ્ટ્રા-લાંબી રીડ સિક્વન્સીંગ, 100 × ઇલુમિના પીસીઆર-ફ્રી સિક્વન્સીંગ (આઈએલએમએન), 70 × ઇલુમિના / એરીમા જીનોમિક્સ એચઆઇ-સી (એચઆઇ-સી), બાયોનો ઓપ્ટિકલ નકશા, અને સ્ટ્રાન્ડ સેક
કોષ્ટક 2 GRCH38 અને T2T-CHM13 માનવ જીનોમ એસેમ્બલીઓની તુલના
સંદર્ભ
1. સેર્ગી નૂર્ક એટ અલ. માનવ જિનોમનો સંપૂર્ણ ક્રમ. biorxiv 2021.05.26.445798; doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
2. કેરોલિન બેલ્સર એટ અલ. નેનોપોર સિક્વન્સિંગનો ઉપયોગ કરીને કેળાના ટેલોમેર-ટુ-ટેલોમેર ગેપલેસ રંગસૂત્રો. બાયરોક્સિવ 2021.04.16.440017; doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
3. ડેનીએલ જે. ગીગ્યુઅર એટ અલ. ટેલોમેર-થી-ટેલોમેર જીનોમ એસેમ્બલી ફેઓડેક્ટિલમ ટ્રાઇકોર્નટમ. બાયરોક્સિવ 2021.05.04.442596; doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
4. જિયા-મિંગ ગીત એટ અલ. ઝિયાન/ઇન્ડીકા ચોખા માટે બે ગેપ-ફ્રી સંદર્ભ જિનોમની એસેમ્બલી અને માન્યતા છોડના સેન્ટ્રોમેર આર્કિટેક્ચરની આંતરદૃષ્ટિ દર્શાવે છે. બાયરોક્સિવ 2020.12.24.424073; doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
પોસ્ટ સમય: જાન્યુ -06-2022