Hi-C આધારિત ક્રોમેટિન ક્રિયાપ્રતિક્રિયા
સેવા સુવિધાઓ
● PE150 સાથે Illumina NovaSeq પર સિક્વન્સિંગ.
● સેવાને ફોર્માલ્ડિહાઇડ સાથે ક્રોસ-લિંક કરવા અને ડીએનએ-પ્રોટીન ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓને બચાવવા માટે, એક્સટ્રેક્ટેડ ન્યુક્લીક એસિડને બદલે પેશીના નમૂનાઓની જરૂર છે.
● Hi-C પ્રયોગમાં બાયોટિન સાથેના સ્ટીકી છેડાને પ્રતિબંધિત અને સમારકામનો સમાવેશ થાય છે, ત્યારબાદ ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓને સાચવીને પરિણામી મંદ છેડાનું પરિપત્રીકરણ થાય છે. પછી ડીએનએને સ્ટ્રેપ્ટાવિડિન મણકા વડે નીચે ખેંચવામાં આવે છે અને અનુગામી પુસ્તકાલયની તૈયારી માટે શુદ્ધ કરવામાં આવે છે.
સેવા લાભો
●શ્રેષ્ઠ પ્રતિબંધ એન્ઝાઇમ ડિઝાઇન: 93% સુધી માન્ય ક્રિયાપ્રતિક્રિયા જોડી સાથે વિવિધ પ્રજાતિઓ પર ઉચ્ચ હાઇ-સી કાર્યક્ષમતા સુનિશ્ચિત કરવા.
●વ્યાપક નિપુણતા અને પ્રકાશન રેકોર્ડ્સ:BMKGene પાસે 800 વિવિધ પ્રજાતિઓ અને વિવિધ પેટન્ટના >2000 Hi-C સિક્વન્સિંગ પ્રોજેક્ટ્સનો બહોળો અનુભવ છે. 900 થી વધુના સંચિત પ્રભાવ પરિબળ સાથે 100 થી વધુ પ્રકાશિત કેસ.
●ઉચ્ચ કુશળ બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ ટીમ:હાઇ-સી પ્રયોગો અને ડેટા વિશ્લેષણ માટે ઇન-હાઉસ પેટન્ટ અને સોફ્ટવેર કોપીરાઇટ અને સ્વ-વિકસિત વિઝ્યુલાઇઝેશન ડેટા સોફ્ટવેર સાથે.
●પોસ્ટ-સેલ્સ સપોર્ટ:અમારી પ્રતિબદ્ધતા 3-મહિનાના વેચાણ પછીની સેવા અવધિ સાથે પ્રોજેક્ટ પૂર્ણ થયા પછી વિસ્તરે છે. આ સમય દરમિયાન, અમે પરિણામોથી સંબંધિત કોઈપણ પ્રશ્નોને સંબોધવા માટે પ્રોજેક્ટ ફોલો-અપ, મુશ્કેલીનિવારણ સહાય અને પ્રશ્ન અને જવાબ સત્રો ઓફર કરીએ છીએ.
●વ્યાપક એનોટેશન: અમે ઓળખાયેલ ભિન્નતાઓ સાથે જનીનોને કાર્યાત્મક રીતે ટીકા કરવા અને અનુરૂપ સંવર્ધન વિશ્લેષણ કરવા માટે બહુવિધ ડેટાબેસેસનો ઉપયોગ કરીએ છીએ, બહુવિધ સંશોધન પ્રોજેક્ટ્સ પર આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરીએ છીએ.
સેવા વિશિષ્ટતાઓ
| પુસ્તકાલય | સિક્વન્સિંગ વ્યૂહરચના | ભલામણ કરેલ ડેટા આઉટપુટ | હાઇ-સી સિગ્નલ રિઝોલ્યુશન |
| હાઇ-સી લાઇબ્રેરી | ઇલુમિના PE150 | ક્રોમેટિન લૂપ: 150x TAD: 50x | ક્રોમેટિન લૂપ: 10Kb TAD: 40Kb |
સેવા જરૂરીયાતો
| નમૂના પ્રકાર | જરૂરી રકમ |
| પ્રાણી પેશી | ≥2 જી |
| આખું લોહી | ≥2mL |
| ફૂગ | ≥1 ગ્રામ |
| છોડ - યુવાન પેશી | 1g/aliquot, 2-4 aliquotes ભલામણ કરેલ |
| સંસ્કારી કોષો | ≥1x107 |
નીચેના વિશ્લેષણનો સમાવેશ થાય છે:
● કાચો ડેટા QC;
● મેપિંગ અને Hi-C લાઇબ્રેરી QC: માન્ય ક્રિયાપ્રતિક્રિયા જોડીઓ અને ક્રિયાપ્રતિક્રિયા સડો ઘાતાંક (IDEs);
● જીનોમ-વ્યાપી ક્રિયાપ્રતિક્રિયા પ્રોફાઇલિંગ: cis/trans વિશ્લેષણ અને Hi-C ક્રિયાપ્રતિક્રિયા નકશો;
● A/B કમ્પાર્ટમેન્ટ વિતરણનું વિશ્લેષણ;
● TADs અને ક્રોમેટિન લૂપ્સની ઓળખ;
● નમૂનાઓમાં 3D ક્રોમેટિન સ્ટ્રક્ચર એલિમેન્ટ્સ પર વિભેદક પૃથ્થકરણ અને સંકળાયેલ જનીનોને અનુરૂપ કાર્યાત્મક ટીકા.
સીઆઈએસ અને ટ્રાન્સ પ્રમાણ વિતરણ
નમૂનાઓ વચ્ચે રંગસૂત્રની ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓનો હીટમેપ
A/B કમ્પાર્ટમેન્ટ્સનું જીનોમ-વ્યાપી વિતરણ
ક્રોમેટિન લૂપ્સનું જીનોમ-વ્યાપી વિતરણ
TADs નું વિઝ્યુલાઇઝેશન
પ્રકાશનોના ક્યુરેટેડ સંગ્રહ દ્વારા BMKGene ની Hi-C સિક્વન્સિંગ સેવાઓ દ્વારા સુવિધાયુક્ત સંશોધન પ્રગતિઓનું અન્વેષણ કરો.
મેંગ, ટી. એટ અલ. (2021) 'એક તુલનાત્મક સંકલિત મલ્ટિ-ઓમિક્સ વિશ્લેષણ CA2 ને કોર્ડોમા માટે નવલકથા લક્ષ્ય તરીકે ઓળખે છે',ન્યુરો-ઓન્કોલોજી, 23(10), પાના. 1709–1722. doi: 10.1093/NEUONC/NOAB156.
ઝુ, એલ. એટ અલ. (2021) '3D અવ્યવસ્થા અને જીનોમની પુન: ગોઠવણી સંકલિત હાઇ-સી, નેનોપોર અને આરએનએ સિક્વન્સિંગ દ્વારા એનએએફએલડીના પેથોજેનેસિસમાં આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે',એક્ટા ફાર્માસ્યુટિકા સિનિકા બી, 11(10), પૃષ્ઠ 3150–3164. doi: 10.1016/J.APSB.2021.03.022.
