જીનોમ-વાઇડ એસોસિએશન વિશ્લેષણ
વર્કફ્લો
સેવા લાભો
●વ્યાપક નિપુણતા અને પ્રકાશન રેકોર્ડ: GWAS માં સંચિત અનુભવ સાથે, BMKGene વસ્તી GWAS સંશોધનમાં સેંકડો પ્રજાતિઓના પ્રોજેક્ટ્સ પૂર્ણ કર્યા છે, સંશોધકોને 100 થી વધુ લેખો પ્રકાશિત કરવામાં મદદ કરી છે અને સંચિત અસર પરિબળ 500 સુધી પહોંચી ગયું છે.
● વ્યાપક બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ વિશ્લેષણ: વર્કફ્લોમાં SNP-લક્ષણ એસોસિએશન વિશ્લેષણનો સમાવેશ થાય છે, ઉમેદવાર જનીનોનો સમૂહ અને તેમના અનુરૂપ કાર્યાત્મક એનોટેશનને વિતરિત કરે છે.
●ઉચ્ચ કુશળ બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ ટીમ અને ટૂંકા વિશ્લેષણ ચક્ર: અદ્યતન જીનોમિક્સ વિશ્લેષણમાં મહાન અનુભવ સાથે, BMKGene ની ટીમ ઝડપી ટર્નઅરાઉન્ડ સમય સાથે વ્યાપક વિશ્લેષણો પહોંચાડે છે.
●પોસ્ટ-સેલ્સ સપોર્ટ:અમારી પ્રતિબદ્ધતા 3-મહિનાના વેચાણ પછીની સેવા અવધિ સાથે પ્રોજેક્ટ પૂર્ણ થયા પછી વિસ્તરે છે. આ સમય દરમિયાન, અમે પરિણામોથી સંબંધિત કોઈપણ પ્રશ્નોને સંબોધવા માટે પ્રોજેક્ટ ફોલો-અપ, મુશ્કેલીનિવારણ સહાય અને પ્રશ્ન અને જવાબ સત્રો ઓફર કરીએ છીએ.
સેવા સ્પષ્ટીકરણો અને જરૂરિયાતો
| સિક્વન્સિંગનો પ્રકાર | ભલામણ કરેલ વસ્તી સ્કેલ | સિક્વન્સિંગ વ્યૂહરચના | ન્યુક્લિયોટાઇડ આવશ્યકતાઓ |
| સંપૂર્ણ જીનોમ સિક્વન્સિંગ | 200 નમૂનાઓ | 10x | સાંદ્રતા: ≥ 1 ng/ µL કુલ રકમ≥ 30ng મર્યાદિત અથવા કોઈ અધોગતિ અથવા દૂષણ |
| સ્પેસિફિક-લોકસ એમ્પ્લીફાઇડ ફ્રેગમેન્ટ (SLAF) | ટેગ ઊંડાઈ: 10x ટૅગ્સની સંખ્યા: < 400 Mb: WGS ની ભલામણ કરવામાં આવે છે < 1Gb: 100K ટૅગ્સ 1 જીબી > 2Gb: 300K ટૅગ્સ મહત્તમ 500k ટૅગ્સ | સાંદ્રતા ≥ 5 ng/µL કુલ રકમ ≥ 80 એનજી નેનોડ્રોપ OD260/280=1.6-2.5 એગેરોઝ જેલ: ના અથવા મર્યાદિત અધોગતિ અથવા દૂષણ
|
સામગ્રીની પસંદગી
વિવિધ જાતો, પેટાજાતિઓ, લેન્ડરેસ/જીનીબેંક/મિશ્ર પરિવારો/જંગલી સંસાધનો
વિવિધ જાતો, પેટાજાતિઓ, લેન્ડરેસ
હાફ-સિબ ફેમિલી/ફુલ-સિબ ફેમિલી/જંગલી સંસાધનો
સેવા કાર્ય પ્રવાહ
પ્રયોગ ડિઝાઇન
નમૂના વિતરણ
આરએનએ નિષ્કર્ષણ
પુસ્તકાલય બાંધકામ
સિક્વન્સિંગ
ડેટા વિશ્લેષણ
વેચાણ પછીની સેવાઓ
નીચેના વિશ્લેષણનો સમાવેશ થાય છે:
- જીનોમ-વાઇડ એસોસિએશન વિશ્લેષણ: LM, LMM, EMMAX, FASTLMM મોડેલ
- ઉમેદવાર જનીનોની કાર્યાત્મક ટીકા
SNP-લક્ષણ એસોસિએશન વિશ્લેષણ - મેનહટન પ્લોટ
SNP-લક્ષણ એસોસિએશન વિશ્લેષણ - QQ પ્લોટ
પ્રકાશનોના ક્યુરેટેડ સંગ્રહ દ્વારા BMKGene ની ડી GWAS સેવાઓ દ્વારા સુવિધા આપવામાં આવેલી પ્રગતિઓનું અન્વેષણ કરો:
Lv, L. et al. (2023) 'જેનોમ-વાઇડ એસોસિએશન સ્ટડી દ્વારા રેઝર ક્લેમ સિનોનોવાક્યુલા કોન્સ્ટ્રિક્ટામાં એમોનિયા સહિષ્ણુતાના આનુવંશિક આધારની આંતરદૃષ્ટિ',એક્વાકલ્ચર, 569, પૃષ્ઠ. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
લી, એક્સ. એટ અલ. (2022) '398 ફોક્સટેલ બાજરીના એક્સેસન્સના મલ્ટિ-ઓમિક્સ પૃથ્થકરણો પાળવા, મેટાબોલાઇટ લક્ષણો અને બળતરા વિરોધી અસરો સાથે સંકળાયેલા જીનોમિક પ્રદેશોને જાહેર કરે છે',મોલેક્યુલર પ્લાન્ટ, 15(8), પાના. 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
લી, જે. એટ અલ. (2022) 'જીનોમ-વાઇડ એસોસિએશન મેપિંગ ઓફ હલલેસ બેરલી ફેનોટાઇપ્સ ઇન ડ્રૉટ એન્વાયર્નમેન્ટ',પ્લાન્ટ સાયન્સમાં ફ્રન્ટીયર્સ, 13, પૃષ્ઠ. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
ઝાઓ, એક્સ. એટ અલ. (2021) 'GmST1, જે સલ્ફોટ્રાન્સફેરેઝને એન્કોડ કરે છે, સોયાબીન મોઝેક વાયરસ સ્ટ્રેન્સ G2 અને G3 સામે પ્રતિકાર આપે છે',છોડ, કોષ અને પર્યાવરણ, 44(8), પૃષ્ઠ 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
