પૂર્ણ-લંબાઈ mRNA સિક્વન્સિંગ-નેનોપોર
લક્ષણો
● પોલી-એ એમઆરએનએનું કેપ્ચર ત્યારબાદ સીડીએનએ સંશ્લેષણ અને પુસ્તકાલયની તૈયારી
● પૂર્ણ-લંબાઈના ટ્રાંસ્ક્રિપ્ટનો ક્રમ
● સંદર્ભ જીનોમના સંરેખણ પર આધારિત બાયોઇન્ફોર્મેટિક વિશ્લેષણ
● બાયોઇન્ફોર્મેટીક પૃથ્થકરણમાં માત્ર જીન અને આઇસોફોર્મ-સ્તર પર અભિવ્યક્તિ જ નહીં પરંતુ lncRNA, જનીન ફ્યુઝન, પોલી-એડીનીલેશન અને જીન સ્ટ્રક્ચરનું વિશ્લેષણ પણ સામેલ છે.
સેવા લાભો
●આઇસોફોર્મ સ્તરે અભિવ્યક્તિનું પ્રમાણીકરણ: વિગતવાર અને સચોટ અભિવ્યક્તિ વિશ્લેષણને સક્ષમ કરવું, સમગ્ર જનીન અભિવ્યક્તિનું વિશ્લેષણ કરતી વખતે ઢાંકપિછોડો કરી શકાય તેવા ફેરફારનું અનાવરણ કરવું
●ઘટેલી ડેટા માંગ:નેક્સ્ટ-જનરેશન સિક્વન્સિંગ (એનજીએસ) ની તુલનામાં, નેનોપોર સિક્વન્સિંગ ઓછી ડેટા આવશ્યકતાઓ દર્શાવે છે, જે નાના ડેટા સાથે જનીન અભિવ્યક્તિ પ્રમાણીકરણ સંતૃપ્તિના સમકક્ષ સ્તરો માટે પરવાનગી આપે છે.
●અભિવ્યક્તિ પરિમાણની ઉચ્ચ સચોટતા: બંને જનીન અને આઇસોફોર્મ સ્તરે
●વધારાની ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક માહિતીની ઓળખ: વૈકલ્પિક પોલિએડેનિલેશન, ફ્યુઝન જનીનો અને lcnRNA અને તેમના લક્ષ્ય જનીનો
●વ્યાપક નિપુણતા: અમારી ટીમ 850 નેનોપોર પૂર્ણ-લંબાઈના ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ પ્રોજેક્ટ્સ પૂર્ણ કરીને અને 8,000 થી વધુ નમૂનાઓ પર પ્રક્રિયા કરીને દરેક પ્રોજેક્ટમાં અનુભવનો ભંડાર લાવે છે.
●પોસ્ટ-સેલ્સ સપોર્ટ: અમારી પ્રતિબદ્ધતા 3-મહિનાના વેચાણ પછીની સેવા અવધિ સાથે પ્રોજેક્ટ પૂર્ણ થયા પછી વિસ્તરે છે. આ સમય દરમિયાન, અમે પરિણામોથી સંબંધિત કોઈપણ પ્રશ્નોને સંબોધવા માટે પ્રોજેક્ટ ફોલો-અપ, મુશ્કેલીનિવારણ સહાય અને પ્રશ્ન અને જવાબ સત્રો ઓફર કરીએ છીએ.
નમૂના જરૂરિયાતો અને ડિલિવરી
| પુસ્તકાલય | સિક્વન્સિંગ વ્યૂહરચના | ડેટા ભલામણ કરેલ | ગુણવત્તા નિયંત્રણ |
| પોલી એ સમૃદ્ધ | ઇલુમિના PE150 | 6/12 જીબી | સરેરાશ ગુણવત્તા સ્કોર: Q10 |
નમૂના જરૂરીયાતો:
ન્યુક્લિયોટાઇડ્સ:
| કોન્ક.(ng/μl) | રકમ (μg) | શુદ્ધતા | અખંડિતતા |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 જેલ પર દર્શાવેલ મર્યાદિત અથવા કોઈ પ્રોટીન અથવા ડીએનએ દૂષણ નથી. | છોડ માટે: RIN≥7.0; પ્રાણીઓ માટે: RIN≥7.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; મર્યાદિત અથવા કોઈ આધારરેખા એલિવેશન નથી |
● છોડ:
રુટ, સ્ટેમ અથવા પાંખડી: 450 મિલિગ્રામ
પર્ણ અથવા બીજ: 300 મિલિગ્રામ
ફળ: 1.2 ગ્રામ
● પ્રાણી:
હૃદય અથવા આંતરડા: 300 મિલિગ્રામ
વિસેરા અથવા મગજ: 240 મિલિગ્રામ
સ્નાયુ: 450 મિલિગ્રામ
હાડકાં, વાળ અથવા ત્વચા: 1 ગ્રામ
● આર્થ્રોપોડ્સ:
જંતુઓ: 6 જી
ક્રસ્ટેસીઆ: 300 મિલિગ્રામ
● આખું લોહી: 1 ટ્યુબ
● કોષો: 106 કોષો
ભલામણ કરેલ નમૂના ડિલિવરી
કન્ટેનર: 2 મિલી સેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબ (ટીન ફોઇલની ભલામણ કરવામાં આવતી નથી)
નમૂના લેબલીંગ: જૂથ+પ્રતિકૃતિ દા.ત. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
શિપમેન્ટ:
1. ડ્રાય-આઈસ: સેમ્પલને બેગમાં પેક કરીને ડ્રાય આઈસમાં દાટી દેવાની જરૂર છે.
2. RNAstable ટ્યુબ: RNA સેમ્પલને RNA સ્ટેબિલાઈઝેશન ટ્યુબમાં સૂકવી શકાય છે (દા.ત. RNAstable®) અને ઓરડાના તાપમાને મોકલી શકાય છે.
સેવા કાર્ય પ્રવાહ
ન્યુક્લિયોટાઇડ્સ:
નમૂના વિતરણ
પુસ્તકાલય બાંધકામ
સિક્વન્સિંગ
ડેટા વિશ્લેષણ
વેચાણ પછીની સેવાઓ
સેવા કાર્ય પ્રવાહ
પેશી:
પ્રયોગ ડિઝાઇન
નમૂના વિતરણ
આરએનએ નિષ્કર્ષણ
પુસ્તકાલય બાંધકામ
સિક્વન્સિંગ
ડેટા વિશ્લેષણ
વેચાણ પછીની સેવાઓ
● રો ડેટા પ્રોસેસિંગ
● ટ્રાન્સક્રિપ્ટ ઓળખ
● વૈકલ્પિક વિભાજન
● જનીન સ્તર અને આઇસોફોર્મ સ્તરમાં અભિવ્યક્તિનું પ્રમાણીકરણ
● વિભેદક અભિવ્યક્તિ વિશ્લેષણ
● કાર્ય એનોટેશન અને સંવર્ધન (DEGs અને DETs)
વૈકલ્પિક સ્પ્લિસિંગ વિશ્લેષણ
વૈકલ્પિક પોલિઆડેનીલેશન એનાલિસિસ (APA)
lncRNA આગાહી
નવલકથા જનીનોની ટીકા
ડીઇટીનું ક્લસ્ટરીંગ
ડીઇજીમાં પ્રોટીન-પ્રોટીન નેટવર્ક
પ્રકાશનોના ક્યુરેટેડ સંગ્રહ દ્વારા BMKGene ની નેનોપોર પૂર્ણ-લંબાઈની mRNA સિક્વન્સિંગ સેવાઓ દ્વારા સુવિધાયુક્ત પ્રગતિઓનું અન્વેષણ કરો.
ગોંગ, બી. એટ અલ. (2023) 'એપિજેનેટિક એન્ડ ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ એક્ટીવેશન ઓફ ધ સિક્રેટરી કિનેઝ FAM20C એઝ એન ઓન્કોજેન ઇન ગ્લિઓમા', જર્નલ ઓફ જિનેટિક્સ એન્ડ જીનોમિક્સ, 50(6), પૃષ્ઠ 422–433. doi: 10.1016/J.JGG.2023.01.008.
તે, ઝેડ. એટ અલ. (2023) 'IFN-γ ને લિમ્ફોસાઇટ્સના પ્રતિસાદની પૂર્ણ-લંબાઈની ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સિક્વન્સિંગ ફ્લાઉન્ડર (પેરાલિચિથિસ ઓલિવેસિયસ) માં Th1-સ્ક્યુડ રોગપ્રતિકારક પ્રતિભાવ દર્શાવે છે', માછલી અને શેલફિશ ઇમ્યુનોલોજી, 134, પૃષ્ઠ. 108636. doi: 10.1016/J.FSI.2023.108636.
મા, વાય. વગેરે. (2023) 'નેમોપિલેમા નોમુરાઈ ઝેરની ઓળખ માટે PacBio અને ONT RNA સિક્વન્સિંગ પદ્ધતિઓનું તુલનાત્મક વિશ્લેષણ', જીનોમિક્સ, 115(6), p. 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.
યુ, ડી. એટ અલ. (2023) 'નેનો-સેક વિશ્લેષણ એચયુએમએસસીમાંથી મેળવેલા એક્ઝોસોમ્સ અને માઇક્રોવેસિકલ્સ વચ્ચેના વિવિધ કાર્યાત્મક વલણને દર્શાવે છે', સ્ટેમ સેલ રિસર્ચ એન્ડ થેરાપી, 14(1), પૃષ્ઠ 1-13. doi: 10.1186/S13287-023-03491-5/TABLES/6.
