એમ્પ્લીકન સિક્વન્સીંગ (16 એસ/18/આઇટીએસ)

ઇલુમિના સાથે એમ્પ્લીકન (16 એસ/18 એસ/આઇટીએસ) સિક્વન્સિંગ એ તેમના સિક્વન્સ અનુસાર માઇક્રોબાયલ પ્રોફાઇલ્સને ઓળખીને માઇક્રોબાયલ વિવિધતાનું વિશ્લેષણ કરવાની એક પદ્ધતિ છે અને પછી દરેક નમૂનામાં અને નમૂનાઓ વચ્ચે સમુદાયની સમૃદ્ધિ અને વિવિધતાને સમજાવવાનો પ્રયાસ કરે છે. બીએમકેક્લાઉડ એમ્પ્લીકન (એનજીએસ) પાઇપલાઇન 16 એસ, 18 એસ, તેના અને બહુવિધ કાર્યાત્મક જનીનોના વિશ્લેષણને મંજૂરી આપે છે. તે રીડ ટ્રિમિંગ, જોડી-અંત વાંચન અને ગુણવત્તા આકારણીથી શરૂ થાય છે, ત્યારબાદ છ જુદા જુદા વિશ્લેષણ વિભાગોમાં ઉપયોગમાં લેવાતા ઓપરેશનલ ટેક્સોનોમિક એકમો (ઓટીયુ) પેદા કરવા માટે સમાન વાંચનના ક્લસ્ટરીંગ દ્વારા. વર્ગીકરણ એનોટેશન દરેક નમૂનાની સંબંધિત વિપુલતા અને રચના વિશેની માહિતી પ્રદાન કરે છે, જ્યારે આલ્ફા અને બીટા વિવિધતા અનુક્રમે અને નમૂનાઓ વચ્ચે માઇક્રોબાયલ વિવિધતા પર ધ્યાન કેન્દ્રિત કરે છે. જૂથો વચ્ચેના વિભેદક વિશ્લેષણમાં ઓટીયુ મળે છે જે પેરામેટ્રિક અને બિન-પેરામેટ્રિક બંને પરીક્ષણોનો ઉપયોગ કરીને અલગ પડે છે, જ્યારે સહસંબંધ વિશ્લેષણ આ તફાવતોને પર્યાવરણીય પરિબળોથી સંબંધિત છે. અંતે, કાર્યાત્મક જનીન વિપુલતાની આગાહી માર્કર જનીન વિપુલતાના આધારે કરવામાં આવે છે, જે દરેક નમૂનામાં કાર્ય અને ઇકોલોજીની સમજ આપે છે ..