16S/18S/ITS એમ્પ્લિકન સિક્વન્સિંગ-NGS
સેવા સુવિધાઓ
● સિક્વન્સિંગ પ્લેટફોર્મ: Illumina NovaSeq.
● અન્ય એમ્પ્લીફિકેશન લક્ષ્યો વચ્ચે 16S, 18S અને ITS ના ટૂંકા પ્રદેશોનું એમ્પ્લીફિકેશન.
● એમ્પલીકોનની લવચીક પસંદગીઓ.
● બહુવિધ એમ્પ્લીફિકેશન લક્ષ્યો સાથે અગાઉના પ્રોજેક્ટનો અનુભવ.
સેવા લાભો
●એકલતા-મુક્ત:પર્યાવરણીય નમૂનાઓમાં માઇક્રોબાયલ કમ્પોઝિશનની ઝડપી ઓળખ.
●ઉચ્ચ રીઝોલ્યુશન: પર્યાવરણીય નમૂનાઓમાં ઓછા વિપુલ પ્રમાણમાં ઘટકોમાં.
●વ્યાપકપણે લાગુ: વિવિધ માઇક્રોબાયલ સમુદાય અભ્યાસ.
●વ્યાપક બાયોઇન્ફોર્મેટીક વિશ્લેષણ: નવીનતમ QIIME2 પેકેજ (માઇક્રોબાયલ ઇકોલોજીમાં જથ્થાત્મક આંતરદૃષ્ટિ) ડેટાબેઝ, એનોટેશન, OTU/ASVના સંદર્ભમાં વિવિધ વિશ્લેષણ સાથે.
●વ્યાપક નિપુણતા: વાર્ષિક ધોરણે હાથ ધરાતા 150 હજાર એમ્પ્લિકોન સિક્વન્સિંગ પ્રોજેક્ટ્સ સાથે, BMKGENE એક દાયકાથી વધુનો અનુભવ, ઉચ્ચ કુશળ વિશ્લેષણ ટીમ, વ્યાપક સામગ્રી અને વેચાણ પછીનો ઉત્તમ સપોર્ટ લાવે છે.
સેવા વિશિષ્ટતાઓ
| પુસ્તકાલય | સિક્વન્સિંગ વ્યૂહરચના | ડેટા ભલામણ કરેલ |
| એમ્પ્લિકન | ઇલુમિના PE250 | 50/100/300K ટૅગ્સ (જોડીઓ વાંચો) |
સેવા જરૂરીયાતો
| એકાગ્રતા (ng/µL) | કુલ રકમ (ng) | વોલ્યુમ (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● માટી/કાદવ: 1-2 ગ્રામ
● આંતરડાની સામગ્રી-પ્રાણી: 0.5-2 ગ્રામ
● આંતરડાની સામગ્રી-જંતુ: 0.1-0.25 ગ્રામ
● છોડની સપાટી (સમૃદ્ધ કાંપ): 0.1-0.5 ગ્રામ
● આથો બ્રોથ સમૃદ્ધ કાંપ): 0.1-0.5 ગ્રામ
● મળ (મોટા પ્રાણીઓ): 0.5-2 ગ્રામ
● મળ (ઉંદર): 3-5 અનાજ
● પલ્મોનરી મૂર્ધન્ય લેવેજ પ્રવાહી: ફિલ્ટર પેપર
● યોનિમાર્ગ સ્વેબ: 5-6 સ્વેબ
● ત્વચા/જનનેન્દ્રિય સ્વેબ/લાળ/મૌખિક સોફ્ટ ટીશ્યુ/ફેરીન્જિયલ સ્વેબ/રેક્ટલ સ્વેબ: 2-3 સ્વેબ
● સપાટીના સુક્ષ્મસજીવો: ફિલ્ટર પેપર
● વોટરબોડી/એર/બાયોફિલ્મ: ફિલ્ટર પેપર
● એન્ડોફાઈટ્સ: 1-2 ગ્રામ
● ડેન્ટલ પ્લેક: 0.5-1 ગ્રામ
સેવા કાર્ય પ્રવાહ
નમૂના વિતરણ
પુસ્તકાલય બાંધકામ
સિક્વન્સિંગ
ડેટા વિશ્લેષણ
વેચાણ પછીની સેવાઓ
નીચેના વિશ્લેષણનો સમાવેશ થાય છે:
- કાચો ડેટા ગુણવત્તા નિયંત્રણ
- OTU ક્લસ્ટરિંગ/ડિ-નોઈઝ(ASV)
- OTU એનોટેશન
- આલ્ફા વિવિધતા વિશ્લેષણ: શેનોન, સિમ્પસન અને ACE સહિત બહુવિધ અનુક્રમણિકાઓ.
- બીટા વિવિધતા વિશ્લેષણ
- આંતર-જૂથ વિશ્લેષણ
- સહસંબંધ વિશ્લેષણ: પર્યાવરણીય પરિબળો અને OUT રચના અને વિવિધતા વચ્ચે
- 16S કાર્યાત્મક જનીન આગાહી
વર્ગીકરણ વિતરણનો હિસ્ટોગ્રામ
વર્ગીકરણ વિપુલતા ક્લસ્ટરિંગ ગરમી નકશો
આલ્ફા વિવિધતા વિશ્લેષણ: દુર્લભ વળાંક
બીટા વિવિધતા વિશ્લેષણ: NMDS
ઇન્ટરગ્રૂપ વિશ્લેષણ: LEFSE બાયોમાર્કર શોધ
પ્રકાશનોના ક્યુરેટેડ સંગ્રહ દ્વારા ઇલુમિના સાથે BMKGene ની એમ્પલિકોન સિક્વન્સિંગ સેવાઓ દ્વારા સુવિધા આપવામાં આવેલી પ્રગતિઓનું અન્વેષણ કરો.
ડોંગ, સી. એટ અલ. (2022) 'એસેમ્બલી, કોર માઇક્રોબાયોટા, એન્ડ ફંક્શન ઓફ ધ રાઇઝોસ્ફિયર સોઇલ એન્ડ બાર્ક માઇક્રોબાયોટા ઇન યુકોમિયા અલ્મોઇડ્સ', માઇક્રોબાયોલોજીમાં ફ્રન્ટિયર્સ, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.855317.
લી, વાય. એટ અલ. (2023) 'ઉંદરમાં ગાર્ડનેરેલા યોનિનાલિસ-પ્રેરિત બેક્ટેરિયલ યોનિસિસની સારવાર માટે સિન્થેટિક બેક્ટેરિયલ કન્સોર્ટિયા ટ્રાન્સપ્લાન્ટેશન', માઇક્રોબાયોમ, 11(1), પૃષ્ઠ 1-14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
યાંગ, જે., ફુ, વાય. અને લિયુ, એચ. (2022) 'જમીન-આધારિત બંધ બાયોરેજનરેટિવ લાઇફ સપોર્ટ પ્રયોગ "લુનર પેલેસ 365" દરમિયાન એકત્રિત હવાની ધૂળના માઇક્રોબાયોમ્સ, એન્વાયર્નમેન્ટલ માઇક્રોબાયોમ્સ, 17(1), પીપી. 1-20. doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
યીન, એસ. એટ અલ. (2022) 'ફીડસ્ટોક-આધારિત વિપુલતા કાર્યાત્મક જનીનો સંબંધિત નાઇટ્રોજન ટ્રાન્સફોર્મેશન કન્ટ્રોલ્ડ નાઇટ્રોજન લોસ ઇન કમ્પોસ્ટિંગ', બાયોરિસોર્સ ટેકનોલોજી, 361, પૃષ્ઠ. 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.
