10 એક્સ જિનોમિક્સ વિઝિયમ અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ
તકનિકી યોજના
લક્ષણ
● ઠરાવ: 100 µm
● સ્પોટ વ્યાસ: 55 µm
Fous ફોલ્લીઓની સંખ્યા: 4992
● કેપ્ચર ક્ષેત્ર: 6.5 x 6.5 મીમી
Bar દરેક બારકોડેડ સ્પોટ 4 વિભાગોથી બનેલા પ્રાઇમર્સથી ભરેલું છે:
- એમઆરએનએ પ્રીમિંગ અને સીડીએનએ સંશ્લેષણ માટે પોલી (ડીટી) પૂંછડી
- એમ્પ્લીફિકેશન બાયસને સુધારવા માટે અનન્ય મોલેક્યુલર આઇડેન્ટિફાયર (યુએમઆઈ)
- અવકાશી બારકોડ
- આંશિક વાંચન 1 સિક્વન્સીંગ પ્રાઇમરનું બંધનકર્તા ક્રમ
H અને ઇ વિભાગોનો સ્ટેનિંગ
ફાયદો
.એક સ્ટોપ સેવા: ક્રિઓ-સેક્શનિંગ, સ્ટેનિંગ, ટીશ્યુ optim પ્ટિમાઇઝેશન, અવકાશી બારકોડિંગ, લાઇબ્રેરીની તૈયારી, સિક્વન્સીંગ અને બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ સહિતના બધા અનુભવ અને કૌશલ આધારિત પગલાઓને એકીકૃત કરે છે.
● ઉચ્ચ-કુશળ તકનીકી ટીમ: 250 થી વધુ પેશીઓના પ્રકારો અને માનવ, માઉસ, સસ્તન પ્રાણી, માછલી અને છોડ સહિત 100+ પ્રજાતિઓનો અનુભવ.
.સમગ્ર પ્રોજેક્ટ પર રીઅલ-ટાઇમ અપડેટ: પ્રાયોગિક પ્રગતિના સંપૂર્ણ નિયંત્રણ સાથે.
.વ્યાપક માનક બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ:પેકેજમાં 29 વિશ્લેષણ અને 100+ ઉચ્ચ-ગુણવત્તાવાળા આંકડા શામેલ છે.
.કસ્ટમાઇઝ્ડ ડેટા વિશ્લેષણ અને વિઝ્યુલાઇઝેશન: વિવિધ સંશોધન વિનંતીઓ માટે ઉપલબ્ધ.
.સિંગલ-સેલ એમઆરએનએ સિક્વન્સિંગ સાથે વૈકલ્પિક સંયુક્ત વિશ્લેષણ
વિશિષ્ટતાઓ
| નમૂનાઓ જરૂરીયાતો | ગ્રંથાલય | અનુક્રમ વ્યૂહરચના | માહિતી સૂચવવી | ગુણવત્તા નિયંત્રણ |
| Oct ક્ટો-એમ્બેડેડ ક્રિઓ નમૂનાઓ (શ્રેષ્ઠ વ્યાસ: આશરે 6x6x6 મીમી) નમૂના દીઠ 2 બ્લોક્સ | 10x વિઝિયમ સીડીએનએ લાઇબ્રેરી | ઇલુમિના PE150 | 50 કે પીઇઓ દીઠ રીડ વાંચે છે (60 જીબી) | રીન> 7 |
નમૂનાની તૈયારી માર્ગદર્શન અને સેવા વર્કફ્લો વિશે વધુ વિગતો માટે, કૃપા કરીને એ સાથે વાત કરવા માટે મફત લાગેબી.એમ.કે.જી.એન.
સેવા -કાર્યપ્રવાહ
નમૂનાની તૈયારીના તબક્કામાં, ઉચ્ચ-ગુણવત્તાવાળા આરએનએ મેળવી શકાય છે તેની ખાતરી કરવા માટે પ્રારંભિક બલ્ક આરએનએ નિષ્કર્ષણ ટ્રાયલ કરવામાં આવે છે. પેશી optim પ્ટિમાઇઝેશન તબક્કામાં વિભાગો સ્ટેઇન્ડ અને વિઝ્યુલાઇઝ્ડ કરવામાં આવે છે અને પેશીઓમાંથી એમઆરએનએ પ્રકાશન માટેની અભિવ્યક્તિની સ્થિતિ optim પ્ટિમાઇઝ કરવામાં આવે છે. ત્યારબાદ લાઇબ્રેરી બાંધકામ દરમિયાન optim પ્ટિમાઇઝ પ્રોટોકોલ લાગુ કરવામાં આવે છે, ત્યારબાદ સિક્વન્સીંગ અને ડેટા વિશ્લેષણ થાય છે.
સંપૂર્ણ સેવા વર્કફ્લોમાં પ્રતિભાવપૂર્ણ પ્રતિસાદ લૂપ જાળવવા માટે રીઅલ-ટાઇમ અપડેટ્સ અને ક્લાયંટની પુષ્ટિ શામેલ છે, સરળ પ્રોજેક્ટ એક્ઝેક્યુશનને સુનિશ્ચિત કરે છે.
નીચેના વિશ્લેષણ શામેલ છે:
ડેટા ગુણવત્તા નિયંત્રણ:
o ડેટા આઉટપુટ અને ગુણવત્તા સ્કોર વિતરણ
o સ્થળ દીઠ જનીન તપાસ
ઓ પેશી કવરેજ
આંતરિક-નમૂના વિશ્લેષણ:
ઓ જીન સમૃદ્ધિ
ઓ સ્પોટ ક્લસ્ટરીંગ, ઘટાડેલા પરિમાણ વિશ્લેષણ સહિત
ક્લસ્ટરો વચ્ચેના વિભેદક અભિવ્યક્તિ વિશ્લેષણ: માર્કર જનીનોની ઓળખ
o કાર્યાત્મક ot નોટેશન અને માર્કર જનીનોનું સંવર્ધન
આંતર જૂથ
ઓ બંને નમૂનાઓમાંથી ફોલ્લીઓ (દા.ત. રોગગ્રસ્ત અને નિયંત્રણ) અને ફરીથી ક્લસ્ટરનું ફરીથી સંયોજન
દરેક ક્લસ્ટર માટે માર્કર જનીનોની ઓળખ
o કાર્યાત્મક ot નોટેશન અને માર્કર જનીનોનું સંવર્ધન
જૂથો વચ્ચે સમાન ક્લસ્ટરની વિભેદક અભિવ્યક્તિ
કરોડાનું વિશ્લેષણ
હાજર સ્થળ
માર્કર જનીનો ઓળખ અને અવકાશી વિતરણ
આંતર જૂથ
બંને જૂથોમાંથી ડેટા સંયોજન અને ફરીથી ક્લસ્ટર
નવા ક્લસ્ટરોના માર્કર જનીનો
આ વૈશિષ્ટિકૃત પ્રકાશનોમાં 10x વિઝિયમ દ્વારા BMKGENE ની અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ સેવા દ્વારા સુવિધા આપવામાં આવેલી પ્રગતિઓનું અન્વેષણ કરો:
ચેન, ડી. એટ અલ. .યુનાઇટેડ સ્ટેટ્સની નેશનલ એકેડેમી Sci ફ સાયન્સિસની કાર્યવાહી, 120 (30), પી. E2303462120. doi: /10.1073/pnas.2303462120
ચેન, વાય. એટ અલ. (2023) 'સ્ટીલ સ્પેટિઓટેમ્પરલ ટ્રાંસ્ક્રિપ્ટોમિક ડેટાના ઉચ્ચ-રીઝોલ્યુશન ડેલિનેશનને સક્ષમ કરે છે',બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સમાં બ્રીફિંગ, 24 (2), પૃષ્ઠ 1-10. doi: 10.1093/BIB/BBAD068.
લિયુ, સી. એટ અલ. (2022) 'ઓર્કિડ ફૂલોના વિકાસમાં ઓર્ગેનોજેનેસિસના સ્પેટિઓટેમ્પરલ એટલાસ',બીજક સંશોધન, 50 (17), પૃષ્ઠ 9724–9737. doi: 10.1093/NAR/GKAC773.
વાંગ, જે. એટ અલ. (2023) 'એકીકૃત અવકાશી ટ્રાંસ્ક્રિપ્ટોમિક્સ અને સિંગલ-ન્યુક્લિયસ આરએનએ સિક્વન્સીંગ ગર્ભાશયના લિયોમિઓમા માટે સંભવિત ઉપચારાત્મક વ્યૂહરચના દર્શાવે છે',જૈવિક વિજ્ scાનનું આંતરરાષ્ટ્રીય જર્નલ, 19 (8), પૃષ્ઠ 2515-2530. doi: 10.7150/ijbs.83510.
