● Necesita un xenoma de referencia.
● Engádese ADN lambda para controlar a eficiencia de conversión de bisulfito.
● Secuenciación en Illumina Novaseq.
●Estándar de ouro para a investigación de metilación do ADN: Esta tecnoloxía de procesamento de conversión de metilación madura ten alta precisión e boa reproducibilidade.
●Ampla cobertura e resolución de base única:Detección de sitios de metilación a nivel do xenoma.
●Plataforma completa:Ofrece un excelente servizo de procesamento de mostras, construción de bibliotecas, secuenciación á análise de bioinformática.
●Ampla experiencia: Con proxectos de secuenciación de WGBs completados con éxito en diversas especies, BMKGene trae máis dunha década de experiencia, un equipo de análise altamente cualificado, contido integral e excelente soporte post-venda.
●Posibilidade de unirse á análise da transcriptómica: permitindo a análise integrada de WGB con outros datos de omics como o ARN-seq.
Biblioteca | Estratexia de secuenciación | Saída de datos recomendada | Control de calidade |
Tratado con bisulfito | Illumina PE150 | Profundidade 30x | Q30 ≥ 85% Conversión de bisulfito> 99% |
Concentración (ng/µl) | Cantidade total (µg) | Requisitos adicionais | |
ADN xenómico | ≥ 5 | ≥ 400 ng | Degradación ou contaminación limitada |
Inclúe a seguinte análise:
● Control de calidade de secuenciación en bruto;
● Mapeo para o xenoma de referencia;
● Detección de bases metiladas de 5mc;
● Análise da distribución e anotación de metilación;
● Análise de rexións metiladas diferencialmente (DMRs);
● anotación funcional de xenes asociados a DMRs.
Detección de metilación de 5mc: tipos de sitios metilados
Mapa de metilación. Distribución de 5mc de metilación en todo o xenoma
Anotación de rexións altamente metiladas
Rexións metiladas diferencialmente: xenes asociados
Rexións metiladas diferencialmente: anotación de xenes asociados (Gene Ontology)
Explora os avances da investigación facilitados polos servizos de secuenciación de bisulfitos do xenoma de BMKGene a través dunha colección curada de publicacións.
Fan, Y. et al. (2020) 'Análise dos perfís de metilación do ADN durante o desenvolvemento muscular esquelético de ovellas mediante secuenciación de bisulfito de xenoma enteiro',,Xenómica BMC, 21 (1), pp. 1-15. doi: 10.1186/s12864-020-6751-5.
Zhao, X. et al. (2022) 'Novas perturbacións de metilación de ácido desoxiribonucleico en traballadores expostos ao cloruro de vinilo',Toxicoloxía e saúde industrial, 38 (7), pp. 377–388. doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. et al. (2020) 'Relacións entre metilación do xenoma, niveis de ARNs non codificantes, ARNm e metabolitos en maduración de froitas de tomate',,O diario vexetal, 103 (3), pp. 980–994. doi: 10.1111/tpj.14778.