-
BMKMANU S3000_Spatial Transcriptome
A transcriptómica espacial sitúase á vangarda da innovación científica, e permite aos investigadores afondar nos patróns de expresión xénica intrincadas dentro dos tecidos preservando o seu contexto espacial. Entre varias plataformas, BMKGene desenvolveu o chip de transcriptoma espacial BMKManu S3000, cunha resolución mellorada de 3,5 µm, alcanzando o rango subcelular e habilitando a configuración de resolución de varios niveis. O chip S3000, con aproximadamente 4 millóns de puntos, emprega micropozos con capas de perlas cargadas con sondas de captura con código de barras espacial. Prepárase unha biblioteca de ADNc, enriquecida con códigos de barras espaciais, a partir do chip S3000 e, posteriormente, secuenciada na plataforma Illumina NovaSeq. A combinación de mostras con código de barras espacial e UMI garante a precisión e especificidade dos datos xerados. O chip BMKManu S3000 é extremadamente versátil, ofrecendo configuracións de resolución de varios niveis que se poden axustar finamente a diferentes tecidos e niveis de detalle desexados. Esta adaptabilidade sitúa o chip como unha excelente opción para diversos estudos de transcriptómica espacial, garantindo unha agrupación espacial precisa cun ruído mínimo. O uso da tecnoloxía de segmentación celular con BMKManu S3000 permite a delimitación dos datos transcripcionais aos límites das células, dando como resultado unha análise que ten significado biolóxico directo. Ademais, a resolución mellorada de S3000 resulta nun maior número de xenes e UMI detectados por célula, o que permite unha análise moito máis precisa dos patróns de transcrición espaciais e do agrupamento de células.
-
Secuenciación de ARN de núcleo único
O desenvolvemento de técnicas de captura unicélula e de construción de bibliotecas personalizadas, xunto coa secuenciación de alto rendemento, revolucionou os estudos de expresión xénica a nivel celular. Este avance permite unha análise máis profunda e completa das poboacións celulares complexas, superando as limitacións asociadas coa expresión media dos xenes en todas as células e preservando a verdadeira heteroxeneidade dentro destas poboacións. Aínda que a secuenciación de ARN unicelular (scRNA-seq) ten vantaxes innegables, atópase con retos en certos tecidos nos que a creación dunha suspensión unicelular resulta difícil e require mostras novas. En BMKGene, abordamos este obstáculo ofrecendo a secuenciación de ARN dun só núcleo (snRNA-seq) utilizando a tecnoloxía 10X Genomics Chromium de última xeración. Este enfoque amplía o espectro de mostras susceptibles de análise de transcriptoma a nivel de célula única.
O illamento dos núcleos realízase a través do innovador chip 10X Genomics Chromium, que presenta un sistema de microfluídica de oito canles con dobres cruzamentos. Dentro deste sistema, as perlas de xel que incorporan códigos de barras, cebadores, encimas e un só núcleo están encapsuladas en gotas de aceite do tamaño dun nanolitro, formando Gel Bead-in-Emulsion (GEM). Despois da formación do GEM, a lise celular e a liberación do código de barras ocorren dentro de cada GEM. Posteriormente, as moléculas de ARNm pasan a transcrición inversa en cDNA, incorporando códigos de barras 10X e identificadores moleculares únicos (UMI). Estes ADNc son entón sometidos á construción de bibliotecas de secuenciación estándar, o que facilita unha exploración robusta e completa dos perfís de expresión xénica a nivel unicelular.
Plataforma: plataforma 10× Genomics Chromium e Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
A transcriptómica espacial é unha tecnoloxía de vangarda que permite aos investigadores investigar patróns de expresión xénica dentro dos tecidos preservando o seu contexto espacial. Unha plataforma poderosa neste dominio é 10x Genomics Visium xunto coa secuenciación Illumina. O principio de 10X Visium reside nun chip especializado cunha zona de captura designada onde se colocan seccións de tecido. Esta área de captura contén puntos con código de barras, cada un correspondente a unha localización espacial única dentro do tecido. As moléculas de ARN capturadas do tecido son entón etiquetadas con identificadores moleculares únicos (UMI) durante o proceso de transcrición inversa. Estes puntos de código de barras e UMI permiten un mapeo espacial preciso e a cuantificación da expresión xénica cunha resolución unicélula. A combinación de mostras con código de barras espacial e UMI garante a precisión e especificidade dos datos xerados. Ao usar esta tecnoloxía de transcriptómica espacial, os investigadores poden obter unha comprensión máis profunda da organización espacial das células e das complexas interaccións moleculares que ocorren nos tecidos, ofrecendo información inestimable sobre os mecanismos subxacentes aos procesos biolóxicos en múltiples campos, incluíndo a oncoloxía, a neurociencia, a bioloxía do desenvolvemento e a inmunoloxía. , e estudos botánicos.
Plataforma: 10X Genomics Visium e Illumina NovaSeq
