Transcriptoma de lonxitude lóxica Pacbio (non referencia)
Tomando Pacific Biosciences (PACBIO) Os datos de secuenciación de isoformas como entrada, esta aplicación é capaz de identificar secuencias de transcrición de lonxitude completa (sen montaxe). Ao mapear secuencias de lonxitude completa contra o xenoma de referencia, pódense optimizar transcricións por xenes coñecidos, transcricións, rexións de codificación, etc. Neste caso, pódese conseguir unha identificación máis precisa de estruturas de ARNm, como o empalme alternativo, etc. A análise conxunta con datos de secuenciación de transcriptoma NGS permite unha anotación máis completa e unha cuantificación máis precisa na expresión a nivel de transcrición, o que beneficia en gran medida a expresión diferencial e a análise funcional descendente.